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董志锋
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张建宗
解放军第302医院
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1999
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中国大陆庚型肝炎病毒NS区部分基因序列分析及变异的初步研究
被引量:1
1999年
目的研究中国庚型肝炎患者分离的病毒基因的特异性及变异规律。方法应用逆转录-巢式聚合酶链反应(PCR)技术从16例庚型肝炎病毒(HGV)感染住院病人血清中扩增了HGVNS5区部分基因片段(141nt)。经纯化后采用双脱氧链末端终止法进行序列分析。结果观察到在HGVNS5区第7820-7960核苷酸之间的5′端较3′端核苷酸及其编码氨基酸变异率高。与Linnen等报道的美国株HGV相比,中国人HGVNS5区核苷酸的变异主要集中在HGVNS5工第7824,7845~7860,7892,7914,7917和7935核苷酸位点及区域,各个核苷酸位点的变异率在0~89.5%,与美国株相比核苷酸序列的同源性为83.6%~95.7%,平均89.6%;氨基酸为83.0%~100%,平均为91.2%。在7933核苷酸位点与美国株相比变异率为93.7%。结论中国人群之间HGVNS5区部分基因及其推测编码蛋白较保守,但与美国株有明显差别。不同硷基在序列中呈散在分布,而在某些位点虽与美国株相比变异很大,但中国人群之间离散度较小,HGV核酸的变异可能与地域因素有关。
李伯安
董志锋
程云
程云
高蓉
郭仁峰
施红
罗清华
郭仁峰
张建宗
关键词:
庚型肝炎病毒
序列同源性
核酸
氨基酸
PCR
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