邓娟
- 作品数:6 被引量:17H指数:3
- 供职机构:四川农业大学更多>>
- 发文基金:四川省科技支撑计划国家科技重大专项国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学医药卫生更多>>
- 基于Cytb基因多态性研究西藏地区8个藏山羊群体遗传结构及母系起源被引量:8
- 2018年
- 旨在基于Cytb基因多态性探讨藏山羊群体间遗传结构及其母系起源。对西藏8个地区157只藏山羊的细胞色素b基因(Cytb)全序列进行扩增和测序,分析群体遗传多样性,计算群体间遗传分化指数,构建系统发育邻接树等。结果显示,藏山羊Cytb全序列为1 140bp,在8个群体中共检测到33个变异位点,定义了30种单倍型,单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样度(Pi)分别为0.736和0.001 8,表明西藏地区藏山羊群体具有较丰富的遗传多样性。78.6%的群体间发生了显著的遗传分化(P<0.05),组内群体间的变异极显著(F_(SC)=0.321,P<0.001);系统发育邻接树分为了4个单倍型组(Haplogroup A-D),提示藏山羊有4个母系起源;单倍型网络图显示,不同地理来源的藏山羊没有完全聚类在同一群簇。在历史驯养过程中,藏山羊发生过群体扩增事件。本研究表明,西藏地区藏山羊有4个母系起源,并呈现出较丰富的遗传多样性,虽然群体间有一定程度的遗传分化,但没有形成明显的地理分隔格局,遗传结构差异在缩小。本研究结果为藏山羊遗传资源的保护和利用提供了科学依据。
- 邓娟张红平巴贵次仁德吉宋天增李利
- 关键词:藏山羊CYTB
- 利用双荧光素酶报告基因系统检测猪miR-369与TNF-α基因的靶标关系
- 本实验通过猪与人TNF-α基因序列相似性的比对,及与猪miR-369第2-8位种子序列相匹配的靶位点的寻找和对比,预测猪miR-369同样调节TNF-α基因的表达。为了验证这一结果,本实验利用双荧光素酶报告基因系统去检测...
- 邓娟
- 关键词:MRNA稳定性
- 文献传递
- 丙型肝炎病毒核酸疫苗的构建及免疫研究
- 丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)属于黄病毒科,其基因组为单股正链RNA,易变异,慢性感染可导致肝脏慢性炎症坏死和纤维化,部分患者可发展为肝硬化甚至肝细胞癌,危害患者的健康和生命,已成为严重的社会...
- 邓娟
- 关键词:丙型肝炎核酸疫苗体液免疫细胞免疫
- 文献传递
- 基于单细胞转录组与宏基因组解析绵羊和山羊瘤胃趋同发育模式
- 绵羊(Ovis aries)和山羊(Capra hircus)在长期进化中产生了许多趋同表型,其中瘤胃是两物种适应性进化的重要结构,也是消化粗纤维的关键器官,其内容物富含高度密集和多样化的微生物群落。随着动物的生长发育,...
- 邓娟
- 关键词:瘤胃宏基因组趋同进化
- 基于线粒体ATP6及Cytb基因多态性研究藏山羊高原适应性被引量:3
- 2020年
- 为了探究藏山羊ATP6和Cytb是否具有潜在的高海拔适应性突变,本研究利用藏山羊(n=157,来自西藏地区的8个群体,海拔高度>3500 m)与低海拔山羊(n=104,来自欧亚大陆50个群体,海拔高度<1000 m)两组261条ATP6和Cytb序列,对核苷酸组成、遗传多样性、单倍型网络以及基因突变对蛋白结构域功能影响进行比较分析。结果,在ATP6和Cytb中分别鉴定出33和67个单核苷酸多态性位点(SNPs),其中错义突变均为6个。值得注意的是,ATP6 m.8102A>G(Ile→Met;P=0.0006)和Cytb m.14794A>G(Thr→Ala;P=0.0077)是低海拔山羊群体特有的错义突变,由此形成的单倍体H27和Ha36与高原适应性呈显著负相关(H27,P=0.0070;Ha36,P=0.0123)。进一步分析推测,这两个突变阻碍了质子跨膜的正常功能,并影响了质子或电子在OXPHOS中的转移,从而导致了低海拔山羊和藏山羊之间呼吸作用效率的差异。本研究通过对线粒体ATP6和Cytb基因编码区多态性到功能的相关分析,初步推测了藏山羊高海拔低氧适应性机制,为高原适应性相关研究提供了一定的见解。
- 邓娟张红平余佳林宋天增李利
- 关键词:藏山羊ATP6CYTB