魏广兵
- 作品数:10 被引量:9H指数:2
- 供职机构:苏州大学医学部基础医学与生物科学学院更多>>
- 发文基金:国家现代农业产业技术体系建设项目江苏省自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学农业科学医药卫生更多>>
- 基于数字基因表达谱(DGE)分析异烟肼诱导家蚕脂肪体损伤的差异表达基因被引量:2
- 2016年
- 以无脊椎动物家蚕为实验动物,采用高通量测序技术分析人结核病治疗药物异烟肼(INH)诱导蚕体脂肪体损伤状态下的相关基因信息。供试5龄第3天家蚕幼虫分别按照1、2 mg/头的剂量经口给予INH后8 h,解剖获取家蚕脂肪体组织并提取总RNA,利用RNA-Seq测序技术分别构建INH诱导组和CK对照组家蚕脂肪体的数字基因表达谱(digital gene expression,DGE)文库。比对2个DGE文库的差异表达基因,并进行GO功能分析和KEGG通路分析,结果显示:INH影响了家蚕脂肪体中功能基因的表达,其中下调表达的基因数目明显较多,这些差异表达基因的GO分类和所在的KEGG通路,均集中在核酸损伤、细胞外信号转导、细胞凋亡与氧化应激过程、蛋白质代谢、药物代谢过程和免疫毒性等几大通路中。选择4个分别与肝损伤、药物代谢、线粒体能量代谢有关的差异表达基因进行qRT-PCR检测,结果与DGE文库的表达一致。另外,家蚕脂肪体经HE和DAPI染色后亦可观察到INH对细胞的损伤;测定不同浓度INH及作用时间下家蚕脂肪体中与肝损伤有关的谷丙转氨酶(ALT)和谷草转氨酶(AST)的活性显著提高,但2种酶的变化趋势不一样。推测INH造成机体组织损伤可能与其和机体内的大分子物质结合,从而影响到这些大分子发挥参与多种代谢通路调节机体正常生理活动的作用有关。
- 王海英魏广兵刘影霞杜贝贝岳玲黄涛王立鹏徐世清司马杨虎
- 关键词:异烟肼家蚕脂肪体差异表达基因
- 烘箱的热风循环系统
- 本实用新型公开了一种烘箱的热风循环系统,包括箱体,箱体内形成有一工作室和一加热室,加热室内设有加热装置,加热室和工作室之间的隔板上设有进风孔和出风孔,所述加热室包括一个位于箱体底部的加热区及一个位于工作室的右侧的进风通道...
- 司马杨虎胡子刚陈息林胡昕潘中华周前凯魏广兵
- 文献传递
- 烘干箱
- 本实用新型公开了一种烘干箱,包括箱体,箱体内形成有一工作室和一加热室,加热室和工作室之间的隔板上设有进风孔和出风孔,所述加热室包括位于箱体底部的加热区及位于工作室的右侧的进风通道,所述进风孔纵向间隔地设置在进风通道与工作...
- 司马杨虎胡子刚胡纯陈玉华袁燕萍魏广卫魏广兵周前凯
- 文献传递
- 从SAGE文库筛选的家蚕正反交F_1代3个差异基因的组织表达分析被引量:1
- 2013年
- 家蚕许多数量遗传性状在品种的正反交之间存在明显差异,研究产生性状差异的分子机制对于家蚕育种具有重要指导意义。基于家蚕品种75新与7532正反交F1代同性别间的SAGE文库,比较、筛选出与家蚕抗逆性相关的3个表达差异显著基因——线粒体硫氧还蛋白2(TRx2)基因、谷胱甘肽过氧化物酶(GPx)基因、抗菌肽(AMPs)基因。在幼虫5龄期设置高温(34℃)饲养环境,利用竞争性半定量RT-PCR方法检测3个差异基因在75新与7532的正反交F1代幼虫脂肪体、中肠和丝腺组织中的转录水平。TRx2基因和GPx基因在正反交F1代雌、雄幼虫的3个组织中均有表达,其中:TRx2基因在反交F1代雌、雄幼虫3个组织的转录水平总体上略高于正交F1代,表达趋势为先升高后降低,至5龄第6天的表达最高;GPx基因在正反交F1代雌性幼虫3个组织的转录水平在整个5龄期无明显差异,但雄性幼虫中该基因的转录水平在5龄第3天和第6天以反交F1代雄性幼虫略高,推测其抗氧化性能高于正交F1代雄性幼虫。AMPs基因在正反交F1代幼虫脂肪体中的转录水平最高,且正反交之间、雌雄之间无明显差异,推测该基因在脂肪体中的高水平表达对维持家蚕在高温环境下的体内稳态环境起重要作用。
- 周前凯张彩霞王华魏广兵李娟刘腾金鑫徐世清司马杨虎
- 关键词:家蚕
- 抗结核药物异烟肼(INH)引起家蚕氧化损伤的机制研究
- 家蚕(Bombyx mori)是一种重要的经济昆虫,也是鳞翅目的模式昆虫。家蚕在基础物质代谢和遗传方式方面与人类有很大的相似性,而且分化程度较果蝇高,体积比果蝇大,为生命科学的一些基础及应用学科提供一个复杂性适度和可操作...
- 魏广兵
- 关键词:家蚕异烟肼转氨酶差异表达基因
- 文献传递
- 应用基因表达系列分析(SAGE)技术研究高温处理前后家蚕的基因表达差异被引量:4
- 2012年
- 高温对家蚕的生理和免疫能力有明显影响。为从分子水平上探究家蚕抗高温机制,应用基因表达系列分析(SAGE)技术获得家蚕5龄雌蚕高温处理前后中肠、丝腺和脂肪体组织的基因表达谱,构建高温组(34℃)和常温组(26℃)2个家蚕SAGE文库。2个家蚕SAGE文库分别包含3555107和3580976个原始标签,其中的标签种类分别为113684和131 296个,清洁标签的种类分别为45972和49467。比较2个文库清洁标签获得65 535种差异标签,共注释4249个基因,其中有1 062个差异表达的基因(P<0.05,错误检测率FDR≤0.001并且拷贝数的差异在2倍以上)。经GO分析发现2个文库中基因的分布极其相似,表明这些基因在不同的环境温度下有类似的生物学功能并参与类似的生理代谢过程。KEGG pathway分析显示有732个基因涉及176个KEGG路径,其中有40个为差异表达基因显著富集的路径(P<0.05),超过一半的路径与代谢、生物合成和信号传导有关。上述结果有助于对家蚕抗高温基因的鉴定以及探究基因调控的网络关系。
- 鲍忠赞张彩霞徐世清周前凯魏广兵王华刘腾金鑫司马杨虎
- 关键词:家蚕高温差异表达基因
- 摄入异烟肼对家蚕幼虫体内谷胱甘肽氧化还原循环和谷胱甘肽S-转移酶活性的影响被引量:2
- 2013年
- 为了建立家蚕Bombyx mori的药物筛选和毒性评价模型,以剂量为2 000 mg/kg的抗结核模药异烟肼饲喂家蚕5龄第3天幼虫后检测其中肠和脂肪体的抗氧化解毒相关代谢的变化。结果表明:雌蚕中肠组织中,总谷胱甘肽(GSH+2GSSG)、还原型谷胱甘肽(reduced glutathione,GSH)和氧化型谷胱甘肽(oxidized glutathione,GSSG)含量均呈现迅速上升再缓慢下降趋势;谷胱甘肽S-转移酶(glutathione S-transferase,GST)活性升高到较大值后逐渐降低;GSH/GSSG的比值下降表明,在72 min后中肠组织向氧化态转移。脂肪体组织中,总谷胱甘肽、GSH和GSSG含量变化均呈现迅速下降再迅速上升的趋势;GST活性达到最大值后逐渐降低后趋于平稳;GSH/GSSG比值升高表明,在72 min后脂肪体组织向还原态转移。无论雌蚕还是雄蚕,总谷胱甘肽、GSH和GSSG含量以及GST活性均是脂肪体高于中肠。雌蚕的总谷胱甘肽含量、GSH和GSSG含量高于雄蚕,但雄蚕的GST活性高于雌性。结果说明,摄入异烟肼引起了家蚕幼虫体内谷胱甘肽氧化还原状态的改变和酶活性的变化,在这个过程中脂肪体起主要解毒代谢作用。
- 魏广兵王璐殷为民何月朱文娟周前凯赵林川徐世清司马杨虎
- 关键词:家蚕异烟肼谷胱甘肽S-转移酶脂肪体中肠
- 可调式削茧刀
- <B>本实用新型公开了一种可调式削茧刀,包括刀片、与刀片固定连接的手柄、及调节板,所述刀片的前后两端分别固设有调节螺杆,所述调节板两侧分别设有与两调节螺杆螺接的调节螺母,调节板通过调节螺母与调节螺杆的螺纹配合来调整与刀片...
- 司马杨虎胡子刚徐世清潘中华陈息林刘腾王华魏广兵
- 文献传递
- 基于SAGE 技术的家蚕雄性幼虫高温处理前后差异表达基因筛选及分析
- 以家蚕品种“7532”雄性为试验材料,5 龄期设置高温组和常温组,解剖家蚕幼虫5 龄饷食24h、72h 和熟蚕的脂肪体、丝腺和中肠,提取各时期相关组织的总RNA,分别以雄性常温和雄性高温的各时期的混合组织为材料,运用基因...
- 周前凯魏广兵王华金鑫刘腾王立鹏朱文娟徐世清司马杨虎
- 关键词:高温差异表达基因SAGE
- 家蚕正反交组合F_1代的基因表达系列分析(SAGE)文库构建被引量:1
- 2012年
- 家蚕杂交组合存在普遍的正反交遗传表型差异现象,为探讨引起正反交组合遗传差异的分子机制,构建家蚕品种75新×7532正交F1代雌雄个体和7532×75新反交F1代雌雄个体共4个基因表达系列分析(SAGE)文库。通过正反交组合同性别子代样本间的比较,显示低表达的标签在种类上占大多数,而高表达的标签在数量上占绝对优势。以错误检测率(FDR)≤0.001且拷贝数倍数差异在2倍以上作为比较样本筛选差异表达基因(DEGs)的条件,在7532×75新的雄性样本里面有298个上调基因和46个下调基因,而在雌性样本里有453个上调基因和240个下调基因。进一步对差异表达基因进行GO和KEGG路径功能分析,筛选出在显著性富集路径中的差异表达基因,其中参与新陈代谢途径、氧化磷酸化途径以及信号传导途径的差异基因在反交组合的子代中表达明显上调。
- 张彩霞鲍忠赞徐世清周前凯魏广兵王华刘腾金鑫司马杨虎
- 关键词:家蚕差异表达基因