冯陈晨
- 作品数:14 被引量:32H指数:3
- 供职机构:内蒙古农业大学兽医学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金内蒙古自治区科技计划项目内蒙古自治区自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学医药卫生更多>>
- 小花棘豆对小白鼠的毒性试验被引量:1
- 2011年
- 将60只昆明系小白鼠随机分为5个剂量的小花棘豆试验组(A、B、C、D、E组小花棘豆剂量分别为日粮的60%、40%、20%、10%、5%)和1个对照组(F组),进行为期60d的小花棘豆毒性试验。结果表明,在小白鼠日粮中添加20%小花棘豆,在60d试验期内未出现小白鼠死亡;添加40%小花棘豆,第57天出现死亡;添加60%小花棘豆,第45天出现死亡。随着小花棘豆在日粮中含量的增加,小白鼠的增重幅度明显减慢,其中A、B、C组小白鼠的试验终体重与对照组差异极显著(P<0.01),D组与对照组差异显著(P<0.05),E组与对照组无显著性差异。各剂量组小白鼠与对照组小白鼠相比,心脏、脾脏、脑和肺脏的脏器系数变化不大;肝脏系数和肾脏系数随着小花棘豆剂量的增加而增大,日粮中小花棘豆含量越高,小白鼠肝、肾肿大越严重,A、B、C组与对照组相比较差异极显著(P<0.01),表明日粮中小花棘豆剂量达到20%时,就会对肝、肾脏造成损伤。
- 杨海东韩敏亢和平邱玉昆刘上飞冯陈晨盛璐丝李雪蕾
- 关键词:小花棘豆毒性试验脏器系数
- 骆驼斯氏副柔线虫雌虫和雄虫比较转录组学分析被引量:2
- 2017年
- 为探明骆驼斯氏副柔线虫雌虫和雄虫的转录组差异,挖掘出与性别决定相关的功能基因,采用Illumina HiSeqTM2000分别对其雌虫和雄虫样本进行转录组测序,构建cDNA文库,通过建库质量评估和组装效率评估后对其进行功能注释及相关生物信息学分析。结果显示,比较雌虫和雄虫的转录本,获得6 430个差异表达基因,其中2 131个基因上调;4 299个基因下调。对差异表达基因进行GO功能分类,有341 328和714个Unigenes分别注释到生物学过程、细胞组成和分子功能三大类41个分支中。KEGG数据库分析,有1 116个差异表达基因参与到198条KEGG通路中,显著富集在机体免疫调节,卵母细胞成熟等通路。功能聚类分析中,雌虫样本在生殖发育、产卵、生殖行为中高表达;雄虫在主要精子蛋白、丝氨酸/苏氨酸特异性蛋白磷酸酶中高表达。此外,在雄虫和雌虫中筛选出Tab-3,Tab-5、Fem-1和Mog-3等10种线虫性别决定相关基因,以及8种雄性性别特异表达基因和4种雌性性别特异表达基因,这些基因在虫体性别决定和性别特异性表达中发挥重要作用。本研究利用生物信息学技术预测出雌虫和雄虫差异表达基因在功能分类和代谢通路等方面的生物学特征,挖掘出性别决定基因和性别特异性表达相关基因,为进一步开展斯氏副柔线虫的功能基因组学研究、药物靶点预测和疫苗候选基因筛选提供有价值的数据资源。
- 冯陈晨王文龙红梅刘宁呼和巴特尔
- 关键词:斯氏副柔线虫转录组差异表达基因生物信息学分析
- 布鲁氏杆菌S2弱毒疫苗S2JY1基因的原核表达被引量:2
- 2019年
- 为了获得高效表达且抗原性好的布鲁氏杆菌S2弱毒疫苗特异性基因重组抗原,研究从S2疫苗全基因组中筛选出特有基因S2JY1,并从S2疫苗株基因组DNA中扩增出S2JY1基因片段,用生物信息学方法对S2JY1基因编码的蛋白进行了理化性质、二级结构、信号肽等分析;对扩增的S2JY1基因进行了克隆测序;构建了原核表达载体pET-30a-S2JY1并转化到大肠杆菌BL21(DE3)细胞中,诱导表达后进行Western-blot免疫印迹试验。结果表明:S2JY1基因编码145个氨基酸,理论PI值为5.55,不稳定系数为25.51;跨膜结构和信号肽分析显示该蛋白为无跨膜区且无信号肽的外膜蛋白;亲疏水性分析表明该蛋白为亲水性蛋白。构建的S2JY1基因原核表达载体可在大肠杆菌中重组表达;S2JY1基因重组蛋白能够与布鲁氏杆菌S2疫苗免疫的羊血清发生特异性结合反应,不与自然感染羊血清反应。说明S2JY1基因原核表达载体具有较好的抗原性和特异性,可用于布鲁氏杆菌病鉴别诊断研究。
- 白丽艳冯陈晨呼和巴特尔王文龙
- 关键词:布鲁氏杆菌弱毒疫苗基因生物信息学原核表达
- 骆驼斯氏副柔线虫病间接ELISA检测方法的建立
- 2019年
- 为建立骆驼斯氏副柔线虫病间接ELISA(iELISA)诊断方法,本试验对骆驼斯氏副柔线虫半胱氨酸蛋白酶CPR基因进行重组表达,将获取的重组蛋白(rCPR)进行纯化和Western blotting检测,然后以纯化好的重组蛋白为抗原,通过棋盘滴定试验优化了抗原包被浓度、包被条件、抗体稀释度、酶标二抗稀释度、封闭液和封闭时间等,建立了骆驼斯氏副柔线虫病iELISA诊断方法,并对建立的iELISA检测方法进行了重复性、敏感性、特异性试验和临床检测。结果显示,抗原最佳包被浓度为8μg/孔,血清最佳稀释度为1∶50,酶标二抗最佳稀释度为1∶5 000,最佳包被条件为4℃包被过夜,最佳封闭条件为3%BSA封闭2 h。临界值为0.235,待检血清D450 nm值>0.235则确定为阳性。重复性试验中变异系数均<10%,重复性较好;用该方法检测阳性血清的敏感性为96.3%;此方法仅与骆驼斯氏副柔线虫病阳性血清发生特异性反应,与感染了其他寄生虫的阳性血清无交叉反应,特异性为100%;对140份临床血清进行检测,阳性率为86.4%。综上可知,本试验成功建立了一种快速有效诊断骆驼斯氏副柔线虫病的iELISA方法。
- 苏倩冯陈晨赵学亮王金玲王文龙呼和巴特尔
- 关键词:斯氏副柔线虫半胱氨酸蛋白酶间接ELISA
- 斯氏副柔线虫SHR基因表达载体的构建及生物信息学分析
- 2019年
- 为探讨斯氏副柔线虫免疫相关SHR基因作为疫苗候选抗原及早期诊断抗原的可能性,提取斯氏副柔线虫的总RNA,用RT-PCR技术扩增SHR基因,并将PCR产物克隆到pMD19-T载体,构建原核表达载体pET-30a(+)-SHR,利用在线软件对该基因编码蛋白序列进行生物信息学分析。结果表明:克隆获得SHR基因全长1 083 bp,编码360个氨基酸,理论等电点为6.09,无信号肽和跨膜区;磷酸化预测含有29个磷酸化位点;结构分析发现,α-螺旋构成二级结构的主要成分,亲水性氨基酸比例超过60%;抗原表位预测表明,SHR蛋白是一种抗原性较高的亲水性蛋白。推测SHR有望用作斯氏副柔线虫的免疫诊断抗原和疫苗候选抗原。
- 赵学亮王姝懿呼和巴特尔冯陈晨孙柯王文龙
- 关键词:原核表达载体抗原表位生物信息学
- 临河地区舍饲羔羊自然感染主要消化道线虫情况的观察被引量:2
- 2016年
- 近年来,内蒙古地区肉羊养殖业由散养化向规模化、集约化转变。但是在此过程中,在舍饲条件下对绵羊消化道线虫病的流行情况尚不清楚。针对这一情况,本文在对巴彦淖尔市临河区舍饲绵羊消化道线虫病的流行规律进行调查研究的基础上,对该地区不同出生时间的全舍饲羔羊首次感染消化道线虫的排卵情况进行了动态观察。结果显示:6月出生的夏羔在9月龄以前没有观察到消化道线虫虫卵的排出;9月出生的秋羔在翌年4月首次观察到了奥拉齐细颈线虫虫卵,羔羊平均月龄为7月龄;12月出生的冬羔在翌年的6月首次观察奥拉齐细颈线虫虫卵,最早排卵羔羊为6月龄;3月出生的春羔在翌年的9月首次检出捻转血矛线虫(Haemonchus.contortus)、蛇形毛圆线虫(Trichostrongylus.colubriformis)和奥拉齐细颈线虫(Nematodirus.oiratianus)3种消化道线虫虫卵,羔羊平均月龄为6月龄。舍饲羔羊1a中首次发现消化道线虫虫卵的顺序为奥拉齐细颈线虫,捻转血矛线虫和蛇形毛圆线虫。羔羊最早感染消化道线虫的年龄为5月龄。羔羊消化道线虫的排卵的季节动态的研究结果显示:捻转血矛线虫和蛇形毛圆线虫全年呈现1个高峰期,高峰期为9月;奥拉齐细颈线虫则有2个高峰期,首个高峰期在5月,第2个高峰期在10月。由此推断,捻转血矛线虫和蛇形毛圆线虫的感染时间为6到10月,奥拉齐细颈线虫的感染时间为4到10月。
- 岳建伟冯陈晨红梅吴志敏代洪烽常久林呼和巴特尔王文龙
- 关键词:舍饲羔羊消化道线虫
- 布鲁菌疫苗株S2全基因组测序及功能分析被引量:2
- 2016年
- 为找出布鲁菌疫苗株S2基因组分泌性蛋白、参与生物学途径基因、细胞组件基因、分子功能基因、毒力相关因子及耐药基因,对布鲁菌疫苗株S2全基因组测序并进行Ⅲ型分泌系统效应蛋白预测、GO注释、VFDB注释、ARDB注释。全基因组测序结果表明,S2基因组大小约为3.3 Mb,杂合度和重复度较低,GC含量分布未出现异常。通过Ⅲ型分泌系统效应蛋白预测未找出S2分泌性蛋白。通过GO数据库注释,发现参与生物学途径基因有3 823个、细胞组件基因有1 949个、分子功能基因有2 585个。通过VFDB数据库注释,找出S2基因组有79个毒力相关基因,其中最大基因为8 604bp,最小基因为180bp。通过ARDB数据库注释,找出S2基因组有13个耐药基因,最大基因为3 225bp,最小基因为333bp;其中功能注释的有GL002835基因,是枯草杆菌肽类基因,此基因耐受抗微生物类药物。本研究为进一步了解布鲁菌S2基因组基本功能奠定了基础。
- 红梅冯陈晨岳建伟刘宁呼和巴特尔王文龙
- 关键词:布鲁菌全基因组测序功能分析
- 布氏杆菌S2疫苗免疫绵羊血清抗体消长规律研究被引量:6
- 2017年
- 为了解绵羊对布氏杆菌病S2疫苗免疫后的抗体消长规律,通过口服和注射2种方法对绵羊进行了布氏杆菌病S2疫苗免疫试验,利用虎红平板凝集试验(RBT)和试管凝集试验(SAT)以及c ELISA检测方法进行了血清抗体检测。结果表明:正常剂量口服免疫S2疫苗20 d后,RBT、SAT、c ELISA抗体阳性率均达到最高,分别是80%、70%、60%,并且在免疫100 d后羊血清抗体阳性率分别为RBT 20%、SAT 10%、c ELISA 10%,免疫250 d后3种方法检测结果均转为阴性。2倍剂量口服免疫S2疫苗20 d后,RBT、SAT、c ELISA均达到最高为60%,并在免疫100 d后均转为阴性。以正常剂量注射免疫S2疫苗免疫7 d后RBT和SAT抗体阳性率达到最高为80%,c ELISA抗体阳性率达到60%,30 d后达到80%,而疫苗免疫370 d后,RBT和SAT检测抗体阳性率下降到60%,c ELISA检测抗体阳性率依然80%;而2倍剂量注射免疫S2疫苗370 d后,RBT和c ELISA检测抗体阳性率仍保持着100%,SAT检测抗体阳性率达80%。结果表明,从免疫羊抗体产生及体内消长规律来看,布氏杆菌S2疫苗注射免疫明显优于口服免疫效果,且两种免疫途径的试验羊均且未发现明显接种副反应。
- 白丽艳刘宁红梅冯陈晨岳建伟王文龙呼和巴特尔
- 关键词:布氏杆菌病绵羊抗体消长规律
- 巴彦淖尔地区全舍饲绵羊主要消化道线虫幼虫圈内发育情况的观察被引量:2
- 2016年
- 近年来,内蒙古部分地区肉羊养殖由散养向规模化、集约化养殖模式转变。在此过程中,相应的寄生虫病防治体系依然属于空白。本课题对巴彦淖尔市临河地区舍饲绵羊消化道线虫病的流行规律进行调查研究,同时对圈舍主要消化道线虫的幼虫发育进行了观察。结果表明:捻转血矛线虫(Haemonchus contortus)、蛇形毛圆线虫(Trichostrongylus colubriformis)虫卵在1~4月份和11~12月份不能发育幼虫,在5~10月份虫卵发育成幼虫,在7月份形成高峰期;奥拉齐细颈线虫(Nematodirus oiratianus)虫卵在1~3月份和11~12月份不能发育成幼虫,在4~10月份虫卵发育成幼虫,在7月份形成发育高峰期。圈舍条件下气温在10~20℃之间与幼虫的发育率呈正相关,在27℃以上呈负相关,湿度与幼虫的发育率呈正相关。
- 冯陈晨岳建伟红梅常久林吴志敏代洪烽呼和巴特尔王文龙
- 关键词:绵羊全舍饲消化道线虫
- 骆驼斯氏副柔线虫转录组的高通量测序及分析被引量:7
- 2017年
- 为了系统了解斯氏副柔线虫的转录组特征并构建其转录组图谱,以不同发育阶段的斯氏副柔线虫为研究对象,应用Illumina Nextseq 500高通量测序技术平台对其进行转录组测序及生物信息学分析,结果每个样本均得到3GB的原始数据,经质量控制和拼接组装后,共获得128 454个Unigene,序列片段的平均长度与N50值分别为634和1 037bp;将Unigenes与COG,Nr,Trembl等数据库进行比对,结果表明有35 324个Unigene比对到COG数据库,根据蛋白种类大致分为25类;通过GO功能分类,5 227个Unigene映射到GO不同的功能节点上;通过KEGG pathways分析,共有13 424个Unigene参与了8 155个代谢通路。该研究结果为斯氏副柔线虫病的基础理论、诊断方法及防治研究奠定基础。
- 冯陈晨王文龙呼和巴特尔
- 关键词:斯氏副柔线虫转录组生物信息学分析