张竞男
- 作品数：9 被引量：44H指数：4
- 供职机构：武汉大学生命科学学院植物发育生物学教育部重点实验室更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- rpl15基因在鱼类系统发育研究中的价值与斑马鱼dmrt1基因的两个选择性剪接体分析
- 该论文主要报道:应用分子生物学实验方法从5种鱼类和水螅中克隆核糖体蛋白L15的完整cDNA,从黑斑蛙和鹌鹑中克隆RPL15的cDNA片段,从斑马鱼卵巢获得dmrt1基因的两个选择性剪接体的完整克隆;并应用生物信息学方法对...
- 张竞男
- 关键词：真骨鱼类
- 文献传递
- 食蟹猴疟原虫 (Plasmodium cynomolgi)中一个真核翻译起始因子4A(eIF-4A)同源蛋白的cDNA克隆、表达和ATP酶活性测定(英文)被引量：4
- 2004年
- 真核翻译起始因子 4A(eukaryoticinitiationfactor 4A ,eIF 4A)是DEAD盒蛋白家族的ATP依赖性的RNA解旋酶类中的一个原型成员 .它在真核细胞的蛋白质合成的起始过程中起着关键性作用 .通过PCR扩增和放射探针杂交相结合的方法筛选食蟹猴疟原虫 (Plasmodiumcynomolgi)的cDNA文库 ,克隆了一个eIF 4A同源蛋白的完整cDNA序列 ,命名为CH1F .CH1F全长 1 75 3bp ,包含一个1 1 97bp的完整阅读框 ,推测编码一个由 398个氨基酸组成的蛋白 .对CH1F的蛋白序列用BlastP进行搜索和分析 ,提示它应该是DEAD盒家族的一个eIF 4A同源蛋白 ;用DNAStar将其与许多典型的DEAD盒蛋白序列进行比对分析 ,结果显示 :比起其它的DEAD盒蛋白 ,它与eIF 4A或eIF 4A的同源蛋白具有更高的同源性和更多序列上的相似结构域 .将包含完整阅读框的片段亚克隆进表达载体pET 2 8a (+) ,在大肠杆菌DH5α中表达 ,产生的融合蛋白大小在 4 5kD左右 .对该融合蛋白进行纯化、重新折叠和初步鉴定 .ATP酶活性检测显示 ,该融合蛋白只有很低的ATP酶活性 ,而且它的ATP酶活性似乎不依赖于核酸底物 .对这一检测结果给出 3种可能的原因 .这一检测结果与根据序列分析得到的推论———CH1F蛋白可能是一个eIF
- 宋平张竞男胡珈瑞李奎
- 小毛茛居群分化研究(Ⅰ)——居群内和居群间的形态变异被引量：17
- 2001年
- 对小毛茛的 3个地点共 6个居群的的形态变异作了观测。该种的株高、叶形、花瓣数目等性状具有显著的居群内和居群间变异。用 31个形态及生境性状作出的聚类分析结果表明 :小毛茛居群遗传分化主要与居群所在生境因素相关 ,与地理位置之间仅有不显著的相关性。
- 张竞男周巍汪小凡予茜张刚
- 关键词：小毛莨居群分化
- 恶性疟原虫abstrakt同源基因的克隆及DEAD盒家族蛋白的序列分析(英文)被引量：1
- 2004年
- DEAD盒蛋白家族的ATP依赖性的RNA解旋酶类参与细胞内几乎所有的RNA代谢过程 ,在几乎所有生物的细胞生长发育过程中扮演着众多不可或缺的角色。在本实验中 ,通过PCR和探针杂交相结合的筛选方法 ,筛选恶性疟原虫 (Plasmodiumfalciparum)的基因组文库 ,克隆了FH1F———abstrakt同源基因的完整序列。通过搜索已经完成测序的恶性疟原虫基因组数据库 ,推测FH1F序列定位在第 5条染色体上。FH1F全长2 80 4bp,包含一个 1 1 6 1bp的完整阅读框 ,编码一个由 386个氨基酸组成的蛋白。对FH1F蛋白序列用BlastP进行搜索和分析以及用DNAStar与许多典型的DEAD盒蛋白序列进行比对分析 ,结果均提示FH1F蛋白应该是DEAD盒家族的一个Abstrakt蛋白。另一方面 ,用DNAStar对已知所有完整的DEAD盒蛋白进行详细的序列分析以及用Mega对这些序列进行系统发育研究的结果都显示 :DEAD盒家族的蛋白聚类成为若干不同的亚群 ;与DEAD盒蛋白的一般保守序列相比 ,Abstrakt,eIF 4A ,Vasa ,P6 8等不同亚群的DEAD盒蛋白在保守区具有各自不同的结构特征。本文对不同的DEAD盒蛋白的结构特征进行了总结并试图给出不同亚群分类上的结构标准 。
- 宋平张竞男Pawan MALHOTRANarendra TUTEJAVirender Singh CHAUHAN李奎
- 关键词：恶性疟原虫同源基因RNA解旋酶
- 6种重要经济鱼类生长激素完整cDNA的克隆和序列分析(英文)被引量：9
- 2005年
- 通过RT PCR、3′ RACE、5′ RACE方法 ,从 6种重要经济鱼类———大眼鳜 (Sinipercakneri)、石斑鱼 (Epinepheluscoioides)、黄鳝 (Monopterusalbus)、鲶鱼 (Silurusasotus)、泥鳅 (Misgurnusanguillicaudatus)和方正银鲫 (CarassiusauratusgibelioBloch ,FangZhengcruciancarp)中克隆了生长激素 (GrowthHormone ,GH)的完整cDNA序列 (除石斑鱼序列外 ,其他生长激素序列均系第一次克隆 ) ,并详细分析了其序列特征。测序结果显示 ,克隆的 6种GHcDNA长度依次为95 3bp、10 2 3bp、82 5bp、10 82bp、115 4bp和 1180bp ,它们均包含一个长度为 6 0 0个左右核苷酸的完整阅读框 ,分别编码一个 2 0 0个左右氨基酸的蛋白 :大眼鳜、石斑鱼和黄鳝GH为 2 0 4个氨基酸 ,鲶鱼GH为 2 0 0个氨基酸 ,泥鳅和方正银鲫GH为 2 10个氨基酸。这 6种蛋白序列与其他已知的鱼类GH序列都有较高的同源性 ,特别是与相同目的鱼类序列相比。通过序列比对 ,在这些蛋白序列内鉴定了许多保守的氨基酸残基 ,其中的大多数聚集而成 5个保守域。基于这 6种鱼类序列的编码区和其他鱼类的GH编码序列进行分子系统学分析 ,结果 (MP和NJ树 )与根据形态特征构建的系统发育树基本一致 ,特别是在硬骨鱼类较大分类阶元 (目间、目以上 )的系统发育研究方面?
- 张竞男宋平胡珈瑞莫赛军彭茂宇周伟邹记兴胡隐昌
- 关键词：生长激素
- 小毛茛居群分化研究(Ⅱ)——居群遗传变异的等位酶分析被引量：9
- 2002年
- 采用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术检测小毛茛的 3个地点共 6个居群的遗传变异。对 4个酶系统 7个酶位点的基因型频率的聚类分析 ,结果表明 :小毛茛居群遗传分化主要与居群所在生境因素相关 ,与地理位置之间仅有不显著的相关性。
- 汪小凡靳宝锋庞新安张竞男
- 关键词：小毛莨居群分化等位酶分析
- 鲇鱼和斜带石斑鱼核糖体蛋白L15完整cDNA的克隆和序列分析被引量：3
- 2004年
- 通过RT PCR和3′ RACE方法,分别从鲇鱼(Silurusasotus)和斜带石斑鱼(Epinepheluscoioides)中克隆了核糖体大亚基蛋白L15(ribosomalproteinL15,RPL15)的完整cDNA,并详细分析了其序列特征.这两种鱼的RPL15蛋白cDNA均包含一个615个核苷酸的完整阅读框,推测分别编码一个204个氨基酸的蛋白.不论是核苷酸序列还是推测的氨基酸序列,这2个序列分别与同属的南方大口鲇和同科的大眼鳜rpl15序列同源性最高,与其他已知的脊椎动物rpl15序列也有较高的同源性.基于这2个序列的编码区和其他鱼类的rpl15编码序列进行分子系统学分析,与传统的形态分类结果是一致的.
- 张竞男宋平吕道远
- 关键词：鲇鱼斜带石斑鱼系统发育树
- 核糖体蛋白rpl15cDNA序列在真骨鱼类系统进化研究中的价值被引量：5
- 2006年
- 应用RTPCR,从真骨总目(Teleostei)5目15种鱼类中首次克隆了核糖体大亚基蛋白L15(rpl15,ribosomalproteinL15)的完整cDNA序列。以海鲢形亚组(Elopomorpha)的鳗鲡作为外类群,对这些真骨鱼类的核糖体蛋白L15cDNA序列进行了系统发育分析,结果表明:(1)rpl15基因在真骨鱼类等许多真核生物进化中高度保守;(2)系统树中各物种之间的关系与形态分类一致。rpl15编码区适合于真骨鱼类目以上分类阶元的分子系统学研究。
- 向筑张竞男宋平胡珈瑞钟扬
- 关键词：分子系统学真骨鱼类
- 鹌鹑和黑斑蛙核糖体蛋白L15 cDNA片段的克隆和序列分析被引量：3
- 2003年
- 通过RT PCR方法,分别从两栖类的黑斑蛙(Rananigromaculata)和鸟类的鹌鹑(Coturnixcoturnixjaponica)中首次克隆了核糖体大亚基蛋白L15(RPL15,ribosomalproteinL15)的cDNA片段,并分析了其序列特征.黑斑蛙和鹌鹑的rpl15cDNA片段分别为467个核苷酸和408个核苷酸,推测分别编码155个氨基酸和136个氨基酸的蛋白片段,与其它已知的脊椎动物rpl15序列有高度的同源性.应用这两条cDNA序列和其它已知的脊椎动物rpl15序列构建的系统发育树显示聚类结果与传统分类一致.
- 张竞男宋平彭茂宇吕道远陈云贵周伟陈春红
- 关键词：黑斑蛙鹌鹑系统发育树基因克隆
