汤凯
- 作品数:5 被引量:2H指数:1
- 供职机构:北京大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划北京市优秀博士学位论文指导教师科技项目更多>>
- 相关领域:生物学自动化与计算机技术电子电信更多>>
- 基于迭代自学习的操纵子结构预测被引量:2
- 2011年
- 原核生物操纵子结构的准确注释对基因功能和基因调控网络的研究具有重要意义,通过生物信息学方法计算预测是当前基因组操纵子结构注释的最主要来源.当前的预测算法大都需要实验确认的操纵子作为训练集,但实验确认的操纵子数据的缺乏一直成为发展算法的瓶颈.基于对操纵子结构的认识,从基因间距离、转录翻译相关的调控信号以及COG功能注释等特征出发,建立了描述操纵子复杂结构的概率模型,并提出了不依赖于特定物种操纵子数据作为训练集的迭代自学习算法.通过对实验验证的操纵子数据集的测试比较,结果表明算法对于预测操纵子结构非常有效.在不依赖于任何已知操纵子信息的情况下,算法在总体预测水平上超过了目前最好的操纵子预测方法,而且这种自学习的预测算法要优于依赖特定物种进行训练的算法.这些特点使得该算法能够适用于新测序的物种,有别于当前常用的操纵子预测方法.对细菌和古细菌的基因组进行大规模比较分析,进一步提高了对基因组操纵子结构的普遍特征和物种特异性的认识.
- 吴文琪郑晓斌刘永初汤凯朱怀球
- 关键词:基因组分析操纵子
- 视频传输方法及设备
- 本发明提供一种视频传输方法及设备。方法包括:客户端获取存储有待请求的视频数据的多台内容分发网络CDN服务器的地址信息;根据多台CDN服务器的地址信息,向多台CDN服务器发送请求观看视频数据的请求消息,以使多台CDN服务器...
- 汤凯周超张行功郭宗明
- 文献传递
- 微生物基因预测方法及软件研究
- 随着测序技术的飞速发展,迄今为止已有一千多种原核生物基因组完成测序工作。如何从海量的基因组序列中提取出生命活动的重要信息,是生命科学面临的一大挑战。基因预测正是解决这一难题的首要步骤,它在生物信息学中有着重要地位。 本...
- 汤凯
- 关键词:原核生物基因预测软件开发
- 面向动态自适应视频的传输优化和QoE建模研究
- 随着互联网基础设施的不断完善和智能设备的不断普及,互联网视频的应用越来越广泛,随之而来,人们对互联网视频的期望也越来越高。为了应对用户对于多终端、高清晰度、流畅视频体验的需求,动态自适应流媒体(即DASH)应运而生。本论...
- 汤凯
- 关键词:多服务器冗余数据
- 视频传输方法及设备
- 本发明提供一种视频传输方法及设备。方法包括:客户端获取存储有待请求的视频数据的多台内容分发网络CDN服务器的地址信息;根据多台CDN服务器的地址信息,向多台CDN服务器发送请求观看视频数据的请求消息,以使多台CDN服务器...
- 汤凯周超张行功郭宗明