管清新
- 作品数:5 被引量:8H指数:2
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- 发文基金:国家自然科学基金广西研究生教育创新计划项目广西壮族自治区自然科学基金更多>>
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- 蛇雕线粒体DNA全序列测定与分析
- 2013年
- 蛇雕为我国二级珍稀濒危物种。本文采用PCR扩增方法测定蛇雕Spilornischeela线粒体DNA全序列,结果:该DNA全长18291bp,为双链环状DNA分子,含有13个蛋白质编码基因、2个rRNA基因、22个tRNA基因、1个控制区(D-loop)和1个假设控制区(pseudo-controlregion),其基因排序与已报道的其他猛禽鸟类排列方式相同。该基因组基因DNA排列紧密,共观察到53bp基因间隔(除控制区1144bp和假控制区1532bp外)与31bp基因重叠;全序列AT含量为53.02%;13个蛋白编码基因中,除COI使用GTG作为起始密码子外,其余使用ATN。此外,10个蛋白编码基因使用常规三联终止密码子TAA、AGG和TAG作为终止密码子,其余3个基因为不完全终止密码子T。除tRNA-Ser(AGY)外,其余21个tRNA基因的二级结构均为典型的三叶草结构。D-loop存在2个结构区:中央保守区(CSB-F、CSB-D和CSB-C)和保守序列区(CSB-1)。在假控制区的3′端有一个48bp的8个重复串联单元。
- 覃屏生石菁萍管清新曾德龙秦新民
- 关键词:鹰科蛇雕线粒体基因组
- 枯叶蛱蝶和燕凤蝶线粒体基因组及鳞翅目系统发育研究
- 鳞翅目(Lepidoptera)是昆虫纲中第二大目,中国已知约有8000多个物种。但目前可利用的鳞翅目物种线粒体全序列较少。枯叶蛱蝶(Kallima inachus)和燕凤蝶(Lamproptera curia)都属于国...
- 管清新
- 关键词:枯叶蛱蝶线粒体基因组鳞翅目系统发育
- 文献传递
- 濒危黑颈长尾雉圈养种群的RAPD遗传多样性分析被引量:3
- 2012年
- 运用RAPD技术对黑颈长尾雉圈养种群的遗传多样性进行了分析。从50条随机引物中筛选出14条引物,对24个个体的基因组DNA进行了PCR扩增,从检测出的119个位点中有98个多态位点,占总位点的82.35%,标记的分子量大小范围是0.2~3kb。24个个体间的遗传距离幅度0.1597~0.4874,平均是0.2810;用软件NTsys2.10e构建了24个个体相互关系的分支图,24个个体可分为3个类群。实验表明:黑颈长尾雉圈养种群的遗传多样性水平较高,圈养种群内遗传差异性较大。
- 庾太林韩增超管清新张良建刘晓辉
- 关键词:黑颈长尾雉圈养种群RAPD
- 红腹锦鸡线粒体基因组全序列及其结构分析被引量:5
- 2012年
- 采用PCR扩增方法测定红腹锦鸡Chrysolophus pictus线粒体基因组全序列:序列全长16 678bp,共有13个蛋白质编码基因、2个rRNA基因和22个tRNA基因。基因组的组成、顺序、编码链的选择、tRNA的结构都与绝大多数鸟类相同或相近。红腹锦鸡线粒体基因组碱基组成分别为:A(30.4%)、T(24.8%)、C(31.2%)、G(13.6%)。总的A+T含量为55.2%。除了COⅠ基因起始密码子是GTG,其余12个蛋白质编码基因的起始密码子都是ATG。tRNA基因核苷酸长度为65~76nt,12S rRNA和16S rRNA基因分别为968和1 604 nt。
- 秦新民李惠敏覃屏生曾振华石菁萍管清新曾德龙
- 关键词:红腹锦鸡雉科线粒体基因组
- 基于12S、16S和Cyt b基因部分序列的丽棘蜥系统发育分析
- 2012年
- 本文测定丽棘蜥12SRNA、16SRNA、Cyt b基因部分序列,并从GenBank中下载15种有鳞目动物的同源序列,以鳄目的2个种(Alligator sinensis和Cairman crocodilus)作为外群,构建MP、NJ和ML分子系统树,探讨它们的系统发育关系。MP、NJ和ML分子系统树聚类的结果显示:蛇蜥亚目、壁虎亚目、蚓蜥亚目、石龙子亚目和鬣蜥亚目能够完全分开,蛇亚目和蜥蜴亚目在有鳞目中为姐妹支关系。
- 秦新民李惠敏蔡乐靖曾德龙管清新
- 关键词:CYTB基因系统发育