顾珉
- 作品数:3 被引量:6H指数:1
- 供职机构:东南大学更多>>
- 发文基金:江苏省自然科学基金国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学更多>>
- 基于特征的核酸序列数据库搜索系统被引量:1
- 2006年
- 随着后基因组时代的到来,建立生物数据库并且在其上开发各种分析工具进行数据分析和挖掘,已经成为了生物学研究的一种新方法。目前国际上流行的通过序列比对搜索相似序列的方法主要是针对短的序列,将这样的方法应用于大规模基因组序列时搜索速度很慢。针对基因组序列搜索的特点,从提高序列搜索效率出发,提出了一种新的、速度更快的搜索方法,其核心是通过序列特征的分析和比较搜索相似序列。在此基础上,建立了基于特征的序列数据库搜索系统,并利用序列的碱基关联性特征搜索人类基因组序列,结果表明,新搜索方法具有较高的命中率,并且搜索速度非常快,适合于大规模基因组序列的搜索。
- 焦典顾珉傅静李石法谢建明孙啸
- 关键词:基因组数据库
- 学习科学相关基因数据库的构建被引量:4
- 2004年
- 利用生物信息学方法和技术 ,收集、整理、集成分散在多个数据库和文献中与学习科学相关的基因信息 ,建立与学习科学相关的基因数据库。数据库提供基因数据管理和查询功能。数据库的管理 ,采用在线管理方式 ,可向数据库添加、修改、删除记录 ,及时、有效地管理数据库。在数据库查询方面 ,提供关键词查询方式、染色体浏览查询方式、基因列表浏览查询方式和行为特征分类浏览查询方式。
- 陈亮顾珉陶怡谢建明孙啸
- 关键词:生物信息学基因数据库
- 基于序列统计特征的水平转移基因搜索
- 所谓水平基因转移(horizontal gene transfer,HGT),又称侧向基因转移(lateral genetransfer,LGT),是指在生物个体之间,生物与环境之间,或单个细胞内部细胞器之间进行的横向的...
- 顾珉
- 关键词:水平基因转移物种特异性基因工程
- 文献传递