于建国 作品数:24 被引量:20 H指数:3 供职机构: 北京师范大学化学学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家重点基础研究发展计划 中国科学院科学基金 更多>> 相关领域: 理学 文化科学 生物学 医药卫生 更多>>
硅三环系列化合物中五价硅和硼三环中四价硼的量化研究 于建国DNA和RNA双链稳定性差异的理论研究 被引量:3 2009年 利用适用于分子间弱相互作用,尤其是生物分子间的氢键相互作用的改进的半经验方法RM1BH和达到线性标度的新的半经验算法以及SimuCal_SE方法,与自主开发的量子化学程序包SimuPac1.0,对4组一系列DNA和RNA碱基的氢键结合能进行了计算.这些计算包括单一碱基类型和混合碱基类型两大类情形,最大的原子数达到1064个.计算结果表明,在碱基层数较少时,DNA和RNA氢键结合能差别不大;在碱基层数较多时,RNA的氢键结合能明显高于DNA的氢键结合能;嘌呤和嘧啶的排列方式对结合能略有影响,但不影响上述趋势.可见,氢键对于RNA的稳定性差异起到重要的作用,计算结果支持了实验的结论. 冯丰 于建国 方维海亚硝酸甲酯光解反应的从头算和Cl研究 被引量:1 1988年 用从头算和MP2方法求得亚硝酸甲酯的基态、第一和第二激发态解离为CH_(3)O和NO自由基的解离能分別为238.14、68.99和-183.97kJ/mol,而CH_(3)O和NO易于生成甲醛和硝酰。由CI方法求出的亚硝酸甲酯直接生成甲醛和硝酰的基态和激发态反应曲线表明,该反应难以按这种机理进行。因此,以上计算支持了实验提出的亚硝酸甲酯光反应生成甲醛和硝酰的两种机理中的光解离机制。 于建国 刘若庄关键词:亚硝酸甲酯 光解反应 从头算 CI 甲基硅乙烯异构化反应的理论研究 用从头算结果讨论其热力学、动力学性质 被引量:2 1990年 1981年第一个含碳硅双键的化合物被分离出来.但这类化合物在通常条件下是不稳定的,易于发生加成、异构化反应.Conlin给出了甲基硅乙烯异构化反应的实验证据.近来Davidson和Conlin又对反应(1)进行了热力学、动力学观测,实验表明反应(1) 居冠之 马万勇 邓从豪 于建国 刘若庄关键词:异构化 热力学 动力学 计算化学软件包SimuPac开发的初步成果 由于计算机科学和软硬件技术的飞速发展,计算化学已发展成了化学中的一个重要分支学科,而发展新的计算方法和开发大型计算化学程序成了衡量一个国家和地区计算化学水平的一个重要指标。经两年多的努力,我们组织队伍,自主开发,并具知识... 于建国关键词:图形界面 文献传递 硅-酞菁核富勒烯枝状分子使用GPU量化计算软件的计算研究 本文使用GPU量化计算程序TeraChem1对硅-酞菁核富勒烯枝状分子(G1–G4(SiPc–nC60;n=2(G1),4(G2),8(G3),and16(G4))进行了计算研究。首先使用MOPAC程序2的MOZYME算... 于建国关键词:GPU 从HON到HNO的重排反应的位能面特征及沿反应途径的动态学行为 被引量:1 1989年 本文使用带有解析梯度的MCSCF ab initio方法和3-21G基组,求得了HNO和HON的平衡几何构型及它们的重排反应的过渡态;并用数值方法求得了反应体系的力常数矩阵;从过渡态力常数矩阵的唯一负本征值相应的本征向量出发,求出了反应的内禀反应坐标(IRC)。经这个反应途径的振动分析和曲率计算表明:沿反应途径,N=O伸缩振动是绝热的,而H原子的伸缩振动则是一个动态自由度,IRC的曲率主要由这个正则坐标组成;沿反应途径IRC的曲率有2个尖锐的峰值,表明在这2个点附近,将会有动态学的效应发生。 于建国 刘若庄关键词:重排反应 量子化学 星际炔氰分子电子结构和分子振动的理论研究 1986年 用MINDO/3法计算了星际炔氰分子(HC_(2)nCN,n=0,1,…,5)的电子结构和振动频率;得出了炔氰分子的HOMO、LUMO、电子总能量E_(T)与n之间的线性关系。炔氰分子n愈大,HOMO愈高,LUMO愈低,体系愈不稳定。由计算的振动频率和对振动模式的分析可知,在炔氰分子中(HCN除外),应有频率约为3820cm^(-1)的H—C伸缩振动和800cm^(-1)的H—C—C弯曲振动这样的特征振动。 于建国 郑世钧 汤定华关键词:分子振动 振动频率 MolGUI,一个用于Molcas程序的图形界面 Molcas是由瑞典Lund大学量子化学系开发的大型量化计算程序包,尤其在高等级的量化计算,如CASSCF和CASPT2,有强大和独特的功能.当限制Molcas得到广泛使用的障碍是计算输入的繁杂.在成功将具独立知识产权的... 于建国一种研究分子间相互作用的新方法及应用——基于自洽场从头计算法的能量分解方案 1984年 分子科学发展的过程约可分为三步:即对原子的研究、对分子的研究及对原子或分子形成的凝聚态物质的研究。为了理解和凝聚态有关的现象,人们就必需学习分子间相互作用的语言。研究分子间相互作用是了解液体和固体的结构及性质的关键;另外,对分子间相互作用的了解还可提供关于化学催化反应和生物化学催化过程机理以及关于化学反应途径的信息。在确定生物体系(例如酶)的结构和性质、能量转移、相变过程时。 刘若庄 于建国关键词:分子间相互作用 自洽场 从头计算法 生物体系 取代基效应 凝聚态物质