代先祝 作品数:35 被引量:280 H指数:11 供职机构: 西南大学资源环境学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家高技术研究发展计划 重庆市自然科学基金 更多>> 相关领域: 环境科学与工程 生物学 农业科学 文化科学 更多>>
环境中污染物降解基因的水平转移(HGT)及其在生物修复中的作用 水平基因转移是不同于垂直基因转移的遗传物质的交流方式.在污染环境这一特异生镜中,降解基因的水平转移有着独特的功能与作用.研究环境中污染物降解基因在微生物间的水平转移,更深入地了解微生物种群适应污染环境的机理,对于评价污染... 张瑞福 蒋建东 代先祝 顾立锋 李顺鹏关键词:水平基因转移 降解基因 降解菌 生物修复 有机污染物 文献传递 Arthrobacter sp.AG1菌株降解土壤中阿特拉津研究 被引量:4 2008年 在阿特拉津浓度为50mg/kg干土的黄棕壤、潮土和红壤接种1.5×106CFU/g干土的降解菌Arthrobacter sp. AG1,10天后土壤中的阿特拉津分别降解至1.5、6.6和10mg/kg干土。阿特拉津的降解速率受到土壤性质的影响,但AG1仍能在不满足其生长繁殖要求的pH值的土壤中有效降解酸性土壤中阿特拉津;土壤中水分含量对降解效果影响较大,>20%时降解效果较好;土壤低含水量和低pH值会导致AG1降解阿特拉津的活力下降。不同的接种量对降解效果有一定影响,但105~107CFU/g干土接种量的AG1都能有效发挥降解作用。AG1降解完土壤中的阿特拉津后,在土壤含水量分别为5%和15%的情况下能长期保持降解活性,对60天后第2次施入黄棕壤和潮土中的50mg/kg阿特拉津4天时降解效率在65%以上。 代先祝 蒋建东 李荣 李顺鹏关键词:阿特拉津 土壤生物修复 降解效果 土壤性质 菌肥对青稞根际土壤理化性质以及微生物群落的影响 被引量:49 2014年 应用化学分析、聚合酶链反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术和DNA测序技术,研究了西藏棕色砂壤土中微生物肥料不同施用量和施用期对青稞根际土壤理化性质和细菌群落多样性的影响。结果表明,施用谷特菌肥能显著提高土壤全氮、全磷、全钾、有机质、碱解氮、有效磷和速效钾的水平,如播前施用菌肥浓度750 ml hm-2的处理较不施用菌肥的处理上述指标分别提高13.32%、28.42%、16.20%、9.81%、21.36%、39.35%和30.48%,拔节期施用菌肥浓度2 250 ml hm-2的处理较不施用菌肥的处理分别提高7.25%、29.35%、18.04%、12.86%、15.90%、43.27%和53.99%。DGGE分析表明,相同施用方式中不同施用量土样中微生物的DGGE图谱相似。非加权组平均法(UPGMA)聚类分析将DGGE图谱分为2大类群。Shannon-Wiener指数表明,施用菌肥的土壤细菌多样性先增加后逐渐降低,播前以喷施谷特菌浓度750 ml hm-2时的细菌多样性最高;拔节期则以喷施谷特菌浓度2 250 ml hm-2处理的细菌多样性最高,且两种施用方式土壤养分的释放与Shannon指数的变化规律均为播前﹥拔节期。测序结果表明,不同施肥浓度土样微生物种群分布较为广泛,其中Actinobacteria纲细菌种类略多,少数菌种为未经培养菌种(Uncultured bacterium)。典型对应分析(CCA)表明,DGGE图谱条带分布与土壤理化性质密切相关,碱解氮、全磷和全氮是影响微生物群落的主要环境因子。研究结果表明,施用谷特菌肥可明显改善青稞根际土壤理化性状,提高土壤细菌多样性。 朱丹 张磊 韦泽秀 刘晓燕 周志峰 代先祝 王晓锋 夏志强 吴先勤 蔚建军 付莉关键词:菌肥 根际土壤 微生物多样性 七株有机磷农药降解菌的降解特性比较 被引量:26 2004年 对分离自同一有机磷农药污染土壤的7株有机磷农药降解菌的降解特性进行了比较,7株降解菌都能利用甲基对硫磷为唯一碳源生长,并生成中间代谢产物对硝基苯酚.对硝基苯酚的降解经过一段延滞期,不同菌株降解对硝基苯酚的能力和延滞期有很大差异.降解菌株对多种有机磷类农药和芳香族化合物具有降解能力,其降解谱表现了一定的差异.用PCR方法从7株降解菌中克隆了有机磷农药水解酶基因. 张瑞福 戴青华 何健 代先祝 李顺鹏关键词:有机磷农药 降解菌 降解特性 水解酶基因 阿特拉津降解菌Arthrobacter sp. AG1降解基因研究 被引量:6 2007年 菌株Arthrobacter sp. AG1能以4000mg/L的阿特拉津(AT)为唯一碳源、氮源和能源生长。通过设计特异引物从AG1中扩增出阿特拉津氯水解酶基因trzN的全序列,该基因与已报道的trzN基因序列相似性为99%。AG1菌株中含有两个大于100kb的质粒,Southern杂交结果显示trzN和atzB基因均位于其中较大的一个质粒pAG1上。将AG1菌株在LB液体培养基中转接三代后,发现34%的细菌细胞丢失了降解活性,但却未发现丢失质粒,PCR扩增结果表明突变子丢失了trzN基因,但atzB和atzC基因未丢失,说明降解活性的缺失是trzN基因片段从质粒上丢失的结果,表明trzN基因在环境中存在水平转移现象,暗示菌株AG1中的阿特拉津降解基因是基因的水平转移重组的结果。 代先祝 蒋建东 顾立峰 潘荣清 李顺鹏关键词:ARTHROBACTER 基因水平转移 阿特拉津 降解 两株降解菌对阿特拉津污染土壤的修复效果研究 被引量:30 2005年 胡江 代先祝 李顺鹏关键词:阿特拉津 甘蔗田 防除 污染土壤 降解菌 莠去津 通过厌氧消化实验探讨《微生物学》综合性实验教学 被引量:1 2012年 通过对厌氧消化实验教学过程的改革研究,以提高学生实践能力和创新精神为目的,探讨了微生物学综合性实验教学的新方法。 代先祝 张磊关键词:《微生物学》 教学实践 耐冷希瓦氏菌外膜蛋白的体外折叠研究 2016年 目的:旨在建立耐低温革兰氏阴性菌外膜蛋白体外折叠体系,为膜蛋白合成耐低温机制提供理论基础。方法:以包涵体的形式在大肠杆菌中过量表达了来源于耐低温希瓦氏菌的Omp A同源外膜蛋白Omp74的全蛋白质和N端跨膜结构域,纯化包涵体后,用高浓度尿素或强阴离子表面活性剂溶液溶解包涵体,以非离子表面活性剂为折叠介质,建立该外膜蛋白的体外折叠体系,同时以大肠杆菌的Omp A作为对照进行了比较研究。结果:与Omp A相比,Omp74体外折叠受温度影响较小,低浓度的阴离子表面活性剂能促Omp74的折叠,但对Omp A的折叠没有影响;C端结构域抑制Omp74在表面活性剂中的折叠;Omp74在0.5%的月桂酰基麦芽糖苷(DDM)和0.4%的十二烷基肌氨酸钠的混合溶液中能达到接近100%的折叠效率。 轩换玲 李静 罗锋 代先祝关键词:耐冷菌 外膜蛋白 表面活性剂 促进烟草生长的耐冷芽孢杆菌的筛选及其对烟苗根系分泌物的影响 2024年 【背景】我国西南高海拔地区的农作物常遭受低温胁迫,其中烟草是喜温植物,对低温尤为敏感。【目的】筛选低温条件下能促进烟苗生长的根际微生物,研究其促生特性及其对烟苗根系分泌物的影响。【方法】采集高海拔烟区烟苗根际土壤,首先用10℃低温培养的方法分离耐冷菌,接着用平板培养法筛选能促进烟苗生长的细菌,然后再鉴定菌株,研究促生菌的促生特性,并用非靶向代谢组学LC-MS/MS分析技术检测低温条件下所分离的促生菌对烟苗根系分泌物的影响。【结果】分离到一株耐冷芽孢杆菌JZC10,该菌在15℃时显著促进烟苗生长和根系发育,25℃时无明显促生效果。该菌产蛋白酶和吲哚乙酸(indoleacetic acid,IAA),不能溶磷,不分泌嗜铁素和脂酶。相较于25℃培养条件,菌株JZC10在15℃条件下定殖能力更强,但都不沿根系扩散。15℃条件下,接种菌株JZC10会影响烟苗根系分泌物组成,有19种根系分泌物在处理组和对照组之间的含量具有显著差异,其中5 nmol/L的光色素显著促进了烟苗叶片生长和侧根发育。【结论】本研究分离到一株15℃低温条件下能促进烟苗生长和根系发育的耐冷芽孢杆菌,并发现接种促生菌改变了烟苗根系分泌物组成,本研究的结果有望为根际促生菌资源开发以及揭示微生物与植物根系的互作关系提供理论基础。 李旭 朱晓伟 代先祝 冯俊洲 李岱黛 习向银 陈少鹏关键词:烟草 芽孢杆菌 根系分泌物 环境中污染物降解基因的水平转移(HGT)及其在生物修复中的作用 被引量:8 2005年 水平基因转移是不同于垂直基因转移的遗传物质的交流方式。在污染环境这一特异生态环境中,降解基因的水平转移有着独特的功能与作用。研究环境中污染物降解基因在微生物间的水平转移,更深入地了解微生物种群适应污染环境的机理,对于评价污染物的环境毒理、生物可降解性以及污染环境的可修复潜力具有重要参考价值。在污染物生物修复实践中,可以通过调控降解基因的水平转移,增强污染环境中微生物的降解能力,更有效地发挥生物修复作用。文章将对环境中细菌间基因交流的机制,污染物降解基因的水平转移对微生物适应污染环境的机理、水平基因转移对代谢途径的进化及其对污染物生物修复作用的影响等方面的研究进展做一综述。 张瑞福 蒋建东 代先祝 顾立锋 李顺鹏关键词:水平基因转移 降解基因 降解菌 生物修复 有机污染物