夏慧煜
- 作品数：5 被引量：28H指数：3
- 供职机构：清华大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金科技部基础研究重大项目前期研究专项更多>>
- 相关领域：生物学自动化与计算机技术更多>>
- 隐Markov模型在剪接位点识别中的应用被引量：14
- 2002年
- 剪接位点的识别是基因识别中的一个重要环节。由于现有的基因识别算法主要关注编码区的整体特性 ,而并不着重考虑个别位点的信息 ,因此难以准确地识别出剪接位点。考虑到剪接位点附近的保守序列的相邻碱基之间应该存在某种相关性 ,利用一阶 Markov链建立了表述这种相关性的模型 ,在此基础之上 ,设计了专门用于剪接拉点识别的隐马氏模型 (HMM)方法。实验结果表明 ,用 HMM描述剪接位点附近序列符合实际情况 ,并且利用这一方法进行剪接位点的识别可以很好地提取位点附近保守序列在边缘分布与条件分布 (转移概率 )上的统计特征。使用该方法对真实剪接位点和虚假剪接位点进行识别 ,识别率均可达 90 %以上。
- 夏慧煜周晴李衍达
- 关键词：隐MARKOV模型剪接位点基因识别基因编码区保守序列
- 选择性剪接识别相关问题研究
- 夏慧煜
- 关键词：选择性剪接剪接位点
- 文献传递
- 基于控制原理和情感计算的信息推荐被引量：8
- 2002年
- 在分布式合作信息推荐系统中 ,系统的目标是使信息尽量流动到需要该信息的用户手中 ,促进宏观信息的有效流动 ,这是一种有目的性的行为 ,可以抽象为复杂系统的控制问题 .由于系统的复杂性和动态性 ,集中式控制难以奏效 ,研究表明 :通过用户的局部 PI控制 ,可以获得很好的宏观控制质量 ,简单的控制规则可以在分布式信息推荐中产生很好的效果 .信息推荐需要基于用户的需求模型 ,鉴于基于符号空间建立用户需求模型存在的不足 ,给出了基于情感空间建立用户需求模型的方法 ,用户通过“很喜欢 ,喜欢 ,一般 ,不喜欢”等情感词汇表达自己的偏好 .仿真实验表明 :情感空间模型可以很好地表达用户的偏好 ,模糊化的局部 PI控制能够使计算机逐渐适应用户的需要 .
- 路海明李衍达卢增祥夏慧煜
- 关键词：控制原理情感空间信任
- 剪接位点识别与选择性剪接机制的初步研究
- RNA的选择性剪接是在高等真核生物基因中普遍存在的一种生命现象,它在真核基因表达调控中起着十分重要的作用。有关选择性剪接的研究是功能基因组时代的重要前沿问题之一。本论文围绕这一重要生命现象展开研究,主要包括下面三部分内容...
- 夏慧煜
- 关键词：选择性剪接剪接位点识别剪接机制
- 文献传递
- 真核基因选择性剪接机理的初步研究被引量：3
- 2003年
- 真核基因表达调控是生命科学研究的前沿、热点。RNA的选择性剪接在真核基因表达调控中起着十分重要的作用。该文从已有数据出发 ,对真核基因的剪接机制以及选择性剪接的机制进行了初步的研究。结果表明 ,在真核基因的剪接过程中 ,可能存在一种“粗定位—细定位”的过程 ,即在剪接过程中首先有一粗略的定位过程 ,根据序列的嘌呤、嘧啶浓度特征寻找出剪接位点的大致位置 ;然后在这一基础上 ,根据几个保守碱基所提供的信息找到准确的剪接位点。这一结果对于进一步研究真核基因的剪接机制 ,特别是选择性剪接发生的机理有很大的启发。
- 夏慧煜李衍达
- 关键词：真核基因选择性剪接剪接机制基因表达剪接位点
