张含会
- 作品数:4 被引量:11H指数:1
- 供职机构:中南大学更多>>
- 发文基金:国家教育部博士点基金国家自然科学基金湖南省科技计划项目更多>>
- 相关领域:生物学自动化与计算机技术更多>>
- 一种基于先验知识和网络拓扑特性的关键蛋白预测方法
- 本发明公开了一种基于先验知识和网络拓扑特性的关键蛋白预测方法。基于对已知关键蛋白之间拓扑关系的分析发现关键蛋白之间联系紧密,将边聚集系数作为评估两个关键蛋白紧密程度的参数,并利用部分已知关键蛋白,以及其邻居节点与这些已知...
- 李敏张含会王建新
- 文献传递
- 融合PPI和基因表达数据的关键蛋白质识别方法被引量:11
- 2013年
- 提出一种新的融合了基因表达数据和PPI网络的拓扑特性来识别关键蛋白质的中心性测度PeC。对于网络中的每一条边,PeC首先计算该边的聚集系数和该边相连的2个基因(蛋白质)共表达的皮尔逊相关系数,并在此基础上进一步计算出该边的权值。网络中每个节点的PeC值即为其所连接的所有边的权值之和。基于酵母PPI网络上的实验结果表明,PeC明显优于其他8种中心性拓扑参数DC,BC,CC,SC,EC,IC,LAC和SoECC;特别地,在预测的蛋白质数量不大于总数量的10%的情况下,PeC的预测准确率相对于SC,CC和EC提高20%以上。
- 李敏张含会费耀平
- 关键词:蛋白质相互作用网络基因表达
- 一种基于先验知识和网络拓扑特性的关键蛋白预测方法
- 本发明公开了一种基于先验知识和网络拓扑特性的关键蛋白预测方法。基于对已知关键蛋白之间拓扑关系的分析发现关键蛋白之间联系紧密,将边聚集系数作为评估两个关键蛋白紧密程度的参数,并利用部分已知关键蛋白,以及其邻居节点与这些已知...
- 李敏张含会王建新
- 文献传递
- 融合蛋白质网络和基因表达数据的关键蛋白质识别方法
- 关键蛋白质是细胞生命活动所必需的蛋白质,是生物体生存和繁殖不可或缺的一部分。关键蛋白质的识别不仅对于生命科学的研究具有重要意义,而且对于疾病诊治和药物设计也具有重要的应用价值。在后基因组时代,随着高通量技术的发展,可获得...
- 张含会
- 关键词:蛋白质网络基因表达先验知识
- 文献传递