李瑞芳
- 作品数：25 被引量：21H指数：2
- 供职机构：广西农业科学院更多>>
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- 相关领域：农业科学生物学医药卫生轻工技术与工程更多>>
- 十字花科黑腐病菌中转录调控因子HpaR1调控一个纤维素酶基因的表达被引量：2
- 2012年
- 十字花科黑腐病菌(Xcc8004)中的一个转录调控因子XC_2736(HpaR1)在致病过程中具有重要的作用。前期研究发现该转录调控因子可能调控胞外纤维素酶的合成。为了解HpaR1对纤维素酶的转录调控机理,本研究对HpaR1进行原核表达纯化,并与488bp的包含XC_0639的启动子区DNA片段进行凝胶电泳迁移率试验,发现HpaR1与XC_0639启动子可以发生结合。将488bp的XC_0639的启动子DNA片段与报告基因gus融合,构建XC_0639的报告质粒pGUS0639r,分别导入野生型8004菌株和缺失突变体DM2736中,分析发现在突变体背景下GUS的表达水平比野生型背景明显降低。表明HpaR1正调控XC_0639的表达。构建XC_0639的极性整合突变体PK0639,检测发现PK0639几乎丧失胞外纤维素酶的活力;通过功能反式互补构建的互补菌株CPK0639可以恢复纤维素酶活性。研究结果表明HpaR1通过调控纤维素酶基因XC_0639的表达来调控细胞的纤维素酶活性。本研究为更深入地了解HpaR1如何调控细菌生理生化功能奠定了基础。
- 薛番艳苏辉昭刘兴艳梁伟李磊李瑞芳陆光涛
- 关键词：十字花科黑腐病菌转录调控因子纤维素酶
- 一种编码转录调控因子的基因的应用
- 本发明鉴定了Xcc的野生菌株8004基因组中编号为XC_2096的基因突变后的突变体(2020nK)，与野生型菌株8004相比可使得黄原胶产量增加20％以上，表明在Xcc野生型菌株中突变XC_2096基因能够提高提高黄原...
- 陆光涛唐纪良李瑞芳苏辉昭冯家勋姜伯乐唐东阶何勇强
- 广西稻瘟病菌生理小种鉴定及遗传多样性分析被引量：9
- 2017年
- 【目的】明确广西稻瘟病菌生理小种组成及遗传结构,为今后水稻抗病品种的选育和布局提供依据。【方法】利用我国7个稻瘟病菌鉴别品种和SSR对广西2012~2014年分离获得的稻瘟病菌单孢菌株分别进行生理小种鉴定和遗传多样性分析。【结果】2012-2014年分离获得的142株稻瘟病菌菌株分成ZA、ZB、ZC、ZD、ZE、ZF、ZG 7群24个生理小种,其中优势种群为ZB,出现频率67.61%,优势生理小种为ZB_9和ZB_(13),出现频率均为19.01%。运用UPGMA法对其中107个菌株进行遗传多样性分析,在0.88的相似水平上划分为14个遗传宗谱。其中,宗谱L01为优势宗谱,占供试菌株比例为44.86%;其次为宗谱L03、L06和L11,占供试菌株比例分别为19.63%、13.08%和10.28%。对每个遗传宗谱所包含的菌株及对应生理小种进行统计,发现稻瘟病菌遗传宗谱与生理小种之间未存在相关性。【结论】2012-2014年广西稻瘟病菌优势种群为ZB,优势生理小种为ZB9和ZB13,其遗传宗谱与生理小种之间未存在相关性。
- 陈小林颜群李瑞芳李焜华韦善富黄凤宽韦丽丽
- 关键词：水稻稻瘟病菌生理小种SSR
- 一种编码4-羟基苯丙酮酸双加氧酶的基因的应用
- 本发明提供了一种编码4-羟基苯丙酮酸双加氧酶的基因(XC_0450)在黄原胶生产中的应用，该基因用于构建及选育黄原胶高产的基因工程菌。该基因工程菌携带所述基因的重组质粒(pL0450)，通过将该pL0450导入野油菜黄单...
- 陆光涛唐纪良向志娇李瑞芳苏辉昭安世琦何勇强
- 火龙果茎溃疡病植株茎组织真菌群落特征分析
- 2023年
- 【目的】明确火龙果茎溃疡病对火龙果植株茎组织真菌群落的影响,为揭示火龙果溃疡病发生机制及防治技术研究提供理论依据。【方法】采集火龙果健康植株和溃疡病发病植株茎组织,利用Illumina高通量测序平台对植株茎组织真菌rDNA的ITS序列进行测序,分析健康植株与发病植株茎组织中的真菌群落特征差异。【结果】火龙果健康植株茎组织的真菌群落多样性显著高于发病植株(P<0.05,下同),且健康植株与发病植株茎组织的真菌群落组成具有明显差异。与健康植株相比,发病植株茎组织的子囊菌门(Ascomycota)和担子菌门(Basidiomycota)相对丰度较高,分别为49.11%和10.90%,门分类水平的未知真菌(unclassified_k_Fungi)的相对丰度较低(39.97%)。在属分类水平上,发病植株茎组织存在8个优势属,其中柱节孢属(Neoscytalidium)的相对丰度最高(33.29%),汉纳酵母属(Hannaella)、Dirkmeia、丛赤壳科未知属(unclassified_f_Nectriaceae)和刺盘孢属(Colletotrichum)4个优势属的相对丰度显著高于健康植株,未在健康植株检测到柱节孢属、维希尼克氏酵母属(Vishniacozyma)和Meira;健康植株茎组织存在4个优势属,其中地霉属(Geotrichum)和链格孢属(Alternaria)的相对丰度显著高于发病植株。线性判别分析(LEfSe)结果显示,发病植株的柱节孢属和维希尼克氏酵母属以及健康植株的地霉属最能解释健康植株与发病植株间的差异。通过比对FUNGuild数据库预测真菌的营养型,发现发病植株中丰度最高的营养型为病理营养型(15.46%),健康植株中丰度最高的营养型是腐生营养型(7.95%)。【结论】火龙果发生茎溃疡病后其茎组织的真菌群落多样性显著下降,真菌群落结构发生改变。当病原营养型真菌显著富集在茎组织中时会破坏茎组织的菌群平衡,可能促进了茎溃疡病的发生。
- 姚姿婷贤小勇李瑞芳韦小妹邹承武朱桂宁
- 关键词：火龙果溃疡病真菌群落多样性
- 水稻细菌性条斑病菌中一个调控致病性的DNA结合蛋白负调控胞外酶活性被引量：1
- 2021年
- 原核革兰氏阴性菌稻黄单胞菌稻生致病变种(又称水稻细菌性条斑病菌,Xanthomonas oryzae pv.oryzicola,Xoc)是引起水稻细菌性条斑病的病原物,该病是水稻粮食生产中的严重病害之一。我们的前期工作对广西农科院分离到的Xoc菌株GX01进行基因组序列分析,发现一个编号为gx01_0566的基因可能编码一个Fis家族的DNA结合蛋白。本工作采用自杀质粒pK18mobsacB介导的方法来构建该基因的缺失突变体,并对突变体进行反式互补。表型分析发现,gx01_0566基因的突变体在寄主水稻日本晴上的致病力显著下降,但其胞外多糖产量与野生型基本一致,胞外酶尤其是胞外纤维素酶活性却大幅度提高。为进一步研究gx01_0566基因在Xoc中调控胞外纤维素酶的机理,我们对该基因的产物进行过量表达和纯化,并通过凝胶阻滞实验和实时定量PCR实验分析,发现gx01_0566编码产物能够结合在一些编码纤维素酶的基因的启动子上,负调控这些纤维素酶基因的表达。
- 李瑞芳覃祚树王欣欣王欣欣陈小林岑贞陆颜群晏卫红韦善富
- 关键词：水稻细菌性条斑病菌DNA结合蛋白
- 一种十字花科黑腐病菌致病相关的基因的应用
- 本发明提供一种十字花科黑腐病菌致病相关的基因(XC_3670)在防治植物病害上的应用，该基因编码双组分调控系统感受蛋白组氨酸激酶，并影响hrp基因的表达，作为抗病育种靶标或药物靶标，可用于十字花科黑腐病病害的防治。
- 唐纪良陆光涛李瑞芳唐永勤何勇强
- 十字花科黑腐病菌中影响致病相关基因XC3814表达的基因鉴定被引量：2
- 2010年
- 十字花科黑腐病菌8004菌株的XC3814基因与致病性和胞外多糖合成有关。文章将XC3814的启动子与报告基因sacB融合,构建了XC3814的表达报告质粒pL3814sac。将该质粒导入野生型菌株8004,获得了报告菌株8004/pL3814sac。利用转座子EZ::Tn5对报告菌株的基因组进行随机诱变,分离到3株耐蔗糖的突变体。分析发现其中的1株突变体是由EZ::Tn5插入到编号为XC3882的未知功能的基因所产生的。将由XC3814启动子与报告基因gusA融合得到的报告质粒pGUS3814分别导入8004菌株和XC3882的转座子Tn5gusA5插入突变体,测定比较pGUS3814的GUS表达水平,结果显示在XC3882突变体背景下GUS的表达水平比在野生型背景下降低81.3%,表明XC3814基因的表达水平受XC3882基因的影响。
- 苏辉昭向志娇彭方印李瑞芳安世琦陆光涛唐纪良
- 关键词：野油菜黄单胞菌致病相关基因
- 十字花科黑腐病菌中HpaM蛋白的突变分析
- 2017年
- 我们的前期工作发现,黄单胞菌中的HpaM是一个位于外膜的Ⅲ型分泌系统的装置蛋白,对其编码基因缺失后,病原菌丧失在寄主上的致病力和在非寄主上引起过敏反应的能力。为了进一步了解该蛋白的功能,本研究将十字花科黑腐病菌中HpaM的功能域分别进行缺失突变,并对一些保守氨基酸位点进行定点突变,发现HpaM的7个功能域分别缺失后,蛋白质的功能均丧失;另外8个位点的氨基酸分别突变后,使蛋白质的功能也丧失。这些结果表明,HpaM的每一个功能域,甚至是一些位点的单个氨基酸均是HpaM发挥正常功能所必需的。
- 李瑞芳朱艳宁韦萍真覃启剑李磊陆光涛
- 关键词：十字花科黑腐病菌功能域
- 十字花科黑腐病菌中葡萄糖-6-磷酸脱氢酶的酶学分析被引量：1
- 2017年
- 葡萄糖-6-磷酸脱氢酶是磷酸戊糖途径(HMP)的限速酶,在十字花科黑腐病菌8004的基因组中,有2个基因XC1977和XC4082被注释为葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PD)。前期工作发现XC1977突变后,细胞的胞外多糖产量明显降低,而XC4082突变不影响胞外多糖产量。为明确这两个基因的编码产物在Xcc中的生化功能,本工作表达纯化了这两个蛋白,并对这两个蛋白的特征进行分析,发现这两个蛋白均具有6-葡萄糖脱氢酶的活性,但是它们的最适反应温度、最适反应pH、金属离子和烷化剂的敏感性完全不同。而且,XC1977以NAD^+和NADP^+为电子受体,而XC4082只能以NADP^+为电子受体。在以NAD^+和NADP^+为受体时,XC1977的K_m值分别为0.125 mmol/L和0.927 mmol/L,而XC4082以NADP^+为受体时的K_m值为0.364 mmol/L。这表明Xcc细胞合成胞外多糖时,需要NAD^+参与能量代谢。
- 李瑞芳杨玉芹覃启剑韦萍真卢卓建陆光涛
- 关键词：十字花科黑腐病菌葡萄糖-6-磷酸脱氢酶酶活力
