石礼涛
- 作品数：4 被引量：4H指数：1
- 供职机构：教育部更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学化学工程更多>>
- 一种仲丁醇耐受菌株及其筛选方法和应用
- 本发明涉及一种仲丁醇耐受菌株，名称为S-2，分类名称为Lysinibacillus fusiformis，保藏编号为：CGMCC No. 6769，保藏日期：2012年11月2日，保藏地址为：北京市朝阳区大屯路中国科学院...
- 杨洪江石礼涛
- 天津地区气单胞菌分离株的鉴定与多位点序列分型被引量：4
- 2013年
- 【目的】研究气单胞菌菌株分类情况,并分析其致病性。【方法】采集环境样品和鱼类标本,分离并鉴定气单胞菌菌株,并运用多位点序列分型(Multilocus sequence typing,MLST)方法进行分类研究,利用PCR和测序方法分析毒力基因Aera、Hly、Aha1、GCAT和Nuc的分布。【结果】通过对分离菌株的16S rRNA基因进行分析,确认属于4种不同气单胞菌的7个分离株。发现所有菌株至少有1种毒力基因阳性,其中3株具有4种毒力基因。药物敏感实验显示,6株分离株对3种或3种以上抗菌素具有多重耐药性。最后,对看家基因gyrB、groL、gltA、metG、ppsA和recA进行分析,与MLST数据库中的等位基因序列比对,发现7株分离株均为新的不同的序列型(Sequence type,ST)。【结论】气单胞菌具有较高的遗传多样性。
- 李倩杨洪江何洋石礼涛
- 关键词：气单胞菌RRNA基因耐药性毒力基因多位点序列分型
- 一种仲丁醇耐受菌株及其筛选方法和应用
- 本发明涉及一种仲丁醇耐受菌株，名称为S-2，分类名称为Lysinibacillus fusiformis，保藏编号为：CGMCC No. 6769，保藏日期：2012年11月2日，保藏地址为：北京市朝阳区大屯路 中国科学...
- 杨洪江石礼涛
- 文献传递
- mariner转座子pKKma的序列分析及转座性能
- 2015年
- 【目的】本研究针对携带mariner转座子的质粒pKKma,进行序列分析和功能注释。【方法】根据已知序列设计引物测定质粒序列。构建转座子突变文库,分析转座子转座效率。【结果】序列分析发现,质粒pKKma全长6879 bp,具有7个开放阅读框。其中,阅读框ORF6编码mariner转座酶(348 aa),属于mariner转座子Himar1转座酶的C9变种;pKKma有2个相同的27 bp的反向重复序列(inverted terminal repeats);阅读框ORF7为庆大霉素抗性基因aacC 1,位于转座子反向重复序列之间,与其它mariner转座子可转移序列比对发现,覆盖率仅为2.0%-47.7%,相应同源程度为3.2%-99.7%,可转移序列具有较大差异。转座效率分析显示,该转座子对于粘质沙雷氏菌的转座效率为(3.1×10-4)-(4.8×10-4),对于弗氏柠檬酸菌的转座效率为(1.3×10-3)-(1.7×10-3)。【结论】质粒pKKma携带一种新的mariner转座子,可在多种细菌中构建转座子文库,研究细菌基因的功能。
- 张翠坤石礼涛于越杨洪江
- 关键词：测序功能注释
