孙凌霞
- 作品数:2 被引量:10H指数:1
- 供职机构:中国农业大学生物学院农业生物技术国家重点实验室更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 苹果柱型同普通型品种间基因表达差异的研究
- 该文选用柱型果树舞姿和普通型富士构建了F1群体,以这两种果树以及它们的杂交后代为材料,应用cDNA-AFLP技术结合BSA的方法,分析了这两类树体基因表达的差异.对64对引物组合进行了cDNA-AFLP分析.反向Nort...
- 孙凌霞
- 关键词:CDNA-AFLP基因表达
- 文献传递
- 利用cDNA-AFLP技术研究苹果柱型与非柱型cDNA的差异表达被引量:9
- 2007年
- 以苹果(Malus×domesticaBorkh.)柱型品种舞姿、非柱型品种富士及其杂交F1群体中柱型、非柱型单株为研究试材,应用cDNA-AFLP(cDNA-amplified fragment length polymorphism)技术,研究柱型与非柱型苹果cDNA的差异表达,探讨了苹果柱型基因Co表达的分子机制。通过64对引物组合的cDNA-AFLP分析获得了1630条在柱型与非柱型苹果中差异表达的片段。经过BSA(bulked segregant analysis)分析和反向Northern杂交鉴定,获得了11个差异表达的cDNA片段,并进行了克隆、测序和序列同源性检索分析。有5个片段在GenBank数据库中发现同源序列,其余的6个功能未知。核酸和氨基酸比对分析中同源性最高的是片段A7和A16。A7的核苷酸序列同源于红叶石楠Photinia fraseri26S核糖体RNA(97%)、蛋白同源于玉米的细胞色素P450单加氧酶(91%),A16的核苷酸(85%)及蛋白(93%)同源于直果草属Triphysaria versicolor的α-expansin2基因。对A7、A16两个候选基因片段再进行正向Northern杂交验证,在富士中表达最强,在非柱型后代、柱型后代及舞姿中表达依次减弱。由此推断,由细胞色素P450单加氧酶基因所调控的赤霉素GAS变化影响了苹果柱型性状的表达。
- 朱元娣孙凌霞李春雨张文王涛
- 关键词:苹果柱型苹果柱型基因差异表达分析CDNA-AFLP