孛昊 作品数:33 被引量:7 H指数:2 供职机构: 中南大学 更多>> 发文基金: 湖南省自然科学基金 国家自然科学基金 中央高校基本科研业务费专项资金 更多>> 相关领域: 生物学 医药卫生 更多>>
检测鼻咽癌组织中长链非编码RNA LOC284454表达量的试剂的应用 本发明公开了检测鼻咽癌组织中长链非编码RNA LOC284454表达量的试剂的应用,主要是用于制备鼻咽癌辅助诊断或者疗效预测的实时荧光定量检测试剂。实时荧光定量PCR技术验证了lncRNA LOC284454在鼻咽癌(2... 曾朝阳 熊炜 李桂源 李小玲 唐艳艳 杨丽婷 孛昊 李夏雨 向波 龚朝建 张文玲 马健文献传递 长链非编码RNA AFAP1-AS1促进肿瘤侵袭转移 被引量:3 2015年 人类基因组计划及其后续的DNA元件百科全书计划(The Encyclopedia of DNA Elements Project,ENCODE)研究成果表明,蛋白质编码基因序列仅占人类基因组序列的1%-3%,人基因组中绝大部分可转录的序列为长链非编码RNA(long non-coding RNA,lnc RNAs)[1].Lnc RNA广泛地存在于各种生物中,且随着生物复杂程度的升高,基因组中lnc RNA序列的比例也相应地增大,提示lnc RNA在生物进化过程中可能有着重要意义[2-4]。 曾朝阳 孛昊 龚朝建 李夏雨 连瑜 荆益州 唐艳艳 陈攀 廖前进 李小玲 熊炜 李桂源关键词:肿瘤侵袭 人类基因组计划 生物进化过程 蛋白质编码 长链非编码RNA LOC401317引物的应用方法 本发明公开了一种长链非编码RNA LOC401317引物的应用方法,即用于制备口腔肿瘤患者的预后制剂,特别是制备出实时荧光定量检测法预测口腔肿瘤患者预后的试剂盒。通过研究证实LncRNA LOC401317在口腔肿瘤组织... 曾朝阳 龚朝建 李桂源 熊炜 李小玲 熊芳 吴汉江 张姗姗 范松青 石磊 孛昊 杨倩文献传递 一个肝癌相关长链非编码RNA的克隆及序列分析 被引量:5 2014年 最近我们利用新一代测序(next generation sequencing,NGS)技术对肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者活检标本及正常对照肝组织样品进行高通量RNA测序(RNA-sequencing,RNA-Seq),在肝癌样品中染色体11q13.1区域检测到几个相邻的RNA-Seq信号峰,而在正常对照组织中没有检测到,且该染色体区域目前尚无已知基因登录,提示这几个RNA-Seq峰可能代表一个或多个未知的新基因.以此为线索,证实这几个RNA-Seq峰来自同一个新基因,并克隆了该基因全长序列,在克隆该基因全长序列时,发现该基因编码的RNA存在多种剪接形式,最长的转录本为3 562 bp.将该基因编码的12条代表性RNA转录本序列递交到美国国立生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)的GenBank数据库中,GenBank ID号分别为KC136297~KC136308.该基因编码的RNA没有发现明显的开放阅读框(open reading fragment,ORF),提示该基因可能编码长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA).为了探讨该lncRNA基因可能的转录调控机制,我们用生物信息学方法预测了该lncRNA基因潜在启动子区域,发现在其转录起始位点上游-719^-469 bp处有一个潜在的启动子,其中包含7个Sp1、1个STAT5和1个EGR1转录因子结合位点.该lncRNA在肝细胞癌发生发展过程中的作用机制值得进一步深入研究. 唐珂 魏芳 孛昊 黄宏斌 张文玲 龚朝建 李夏雨 宋亚莉 廖前进 彭淑平 向娟娟 周鸣 马健 李小玲 熊炜 李勇 曾朝阳 李桂源关键词:长链非编码RNA 肝细胞癌 基因克隆 生物信息学 原位杂交检测鼻咽癌组织中长链非编码RNA LOC284454试剂的应用 本发明公开了原位杂交检测鼻咽癌组织中长链非编码RNA LOC284454试剂的应用,主要用于制备鼻咽癌辅助诊断或者疗效预测制剂。通过原位杂交技术证实LOC284454在正常鼻咽上皮(NPE)中表达水平较低,40例正常鼻咽... 曾朝阳 李桂源 熊炜 李小玲 唐艳艳 杨丽婷 孛昊 李夏雨 龚朝建 张文玲 张姗姗 郭灿文献传递 原位杂交检测鼻咽癌组织中长链非编码RNA LOC284454试剂的应用 本发明公开了原位杂交检测鼻咽癌组织中长链非编码RNA?LOC284454试剂的应用,主要用于制备鼻咽癌辅助诊断或者疗效预测制剂。通过原位杂交技术证实LOC284454在正常鼻咽上皮(NPE)中表达水平较低,40例正常鼻咽... 曾朝阳 李桂源 熊炜 李小玲 唐艳艳 杨丽婷 孛昊 李夏雨 龚朝建 张文玲 张姗姗 郭灿文献传递 长链非编码RNA基因LOC553103的应用 本发明公开了一个长链非编码RNA基因LOC553103的应用。基因LOC553103用于制备监测胃癌复发转移和预后预测的制剂;胃癌组织中基因LOC553103的表达水平与胃癌的复发和转移呈正相关关系;该基因在NCBI中的... 李桂源 曾朝阳 熊炜 石磊 李夏雨 李小玲 张文玲 龚朝建 何宝玉 孛昊 周鸣 唐珂长链非编码RNA AFAP1-AS1的应用方法 本发明公开了一种长链非编码RNAAFAP1-AS1基因的应用方法,具体是该长链非编码RNA基因在制备干扰和抑制剂上的应用方法;根据该基因序列,设计并合成了用于RNA干扰封闭该长链非编码RNA表达的短发夹结构RNA真核表达... 曾朝阳 孛昊 李桂源 熊炜 李小玲 李夏雨 邓昊 龚朝建 张文玲 曾勇 向娟娟 李征文献传递 长链非编码RNA AFAP1-AS1在制备乳腺癌实时荧光定量辅助诊断制剂上的应用 本发明公开了一种长链非编码RNA AFAP1‑AS1在制备乳腺癌实时荧光定量辅助诊断制剂上的应用。通过研究证实AFAP1‑AS1在乳腺癌组织中表达上调,高表达AFAP1‑AS1的乳腺癌患者比低表达AFAP1‑AS1的乳腺... 熊炜 曾朝阳 李桂源 石磊 孛昊 李小玲 李夏雨 龚朝建 范松青 张文玲 周鸣 彭淑平文献传递 一个长链非编码RNA基因及其应用方法 本发明涉及一个新克隆的长链非编码RNA基因全长序列及其应用方法,可以采用包括杂交法或扩增法在内的方法在分离样本中检测该基因,该基因可以作为肿瘤标志物,尤其是肝癌的标记物。根据该基因序列,设计并合成实时定量PCR引物和原位... 曾朝阳 李桂源 熊炜 李小玲 唐珂 魏芳 孛昊 龚朝建 宋亚莉 杨倩 李夏雨 张文玲 范松青 石磊 马健 周鸣