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宋新蕊

作品数：8 被引量：10H指数：2
供职机构：北京市计算中心更多>>
发文基金：北京市自然科学基金北京市教委科技发展计划更多>>
相关领域：医药卫生生物学更多>>

合作作者

文献类型

  • 4篇期刊文章
  • 3篇专利
  • 1篇学位论文

领域

  • 3篇生物学
  • 3篇医药卫生

主题

  • 3篇化合物
  • 2篇医院环境
  • 2篇内酰胺
  • 2篇青霉
  • 2篇青霉素
  • 2篇酰胺
  • 2篇物种
  • 2篇物种进化
  • 2篇消毒
  • 2篇消毒灭菌
  • 2篇灭菌
  • 2篇进化
  • 2篇抗菌
  • 2篇氨苄
  • 2篇氨苄青霉素
  • 2篇AUTO
  • 2篇VINA
  • 2篇DOCK
  • 1篇蛋白
  • 1篇蛋白质结构

机构

  • 6篇北京市计算中...
  • 2篇北京工业大学
  • 1篇军事医学科学...

作者

  • 8篇宋新蕊
  • 6篇赵勇
  • 3篇童贻刚
  • 3篇谢威
  • 3篇刘昕
  • 3篇常莉
  • 2篇黄劲松
  • 2篇陈洁
  • 2篇刘清珺
  • 2篇康怀兴
  • 2篇李达
  • 1篇吴一雷
  • 1篇陈禹保
  • 1篇李晓琴
  • 1篇张媛
  • 1篇刘雨桐
  • 1篇周雪松

传媒

  • 4篇生物信息学

年份

  • 4篇2015
  • 1篇2014
  • 3篇2013
共 8 条 记 录，以下是 1-8
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排序方式：
化合物naphthoylenequinazolone的抗菌用途
本发明公开了一种小分子化合物的抗菌用途，具体为一种β-内酰胺的抗菌用途。该小分子化合物是naphthoylenequinazolone，化合物名：benzo[lmn]diquinazolino[2,1-b:1ˊ,2ˊ-j...
赵勇谢威刘昕童贻刚刘清珺宋新蕊康怀兴常莉吴一雷
文献传递
宏基因组的生物信息分析被引量：5
2013年
基于高通量测序的宏基因组学研究是近年来的研究热点之一。宏基因组的生物信息分析正在逐渐完善成熟,各种分析软件和流程的开发与应用,极大地促进了宏基因组研究的发展,特别是在遗传与进化、基因发现、宏基因组和人类疾病的相关研究等方面取得了显著成果。本文旨在结合宏基因组学的研究内容和研究方向,对宏基因组的生物信息分析方法进行综述,探讨宏基因组的生物信息分析面临的机遇和挑战。
赵勇黄劲松宋新蕊陈禹保童贻刚
关键词：宏基因组生物信息学高通量测序
一种β-内酰胺的抗菌用途
本发明公开了一种小分子化合物的抗菌用途，具体为一种β-内酰胺的抗菌用途。该小分子化合物是2-(1,3-dioxo-1H-benzo[de]isoquinolin-2(3H)-yl)-5H,13H-benzo[4,5]is...
赵勇谢威刘昕童贻刚刘清珺宋新蕊康怀兴常莉黄劲松
文献传递
基于结构的单绕蛋白聚类图构建与分析
2013年
蛋白质分子进化规律研究是分子进化研究的重点,对揭示生命起源与进化机制有重要意义。本文对已知空间结构及物种信息的单绕蛋白,利用结构比对信息,构建了不同层次单绕样本系统聚类图。分析发现:功能相似蛋白存在明显聚集现象,同一超家族样本基本聚在一个大支中,同一家族样本集中在所属超家族下的小支中,功能约束下单绕样本聚类图与物种进化图有较好对应关系。结果表明:单绕蛋白的结构演化反映了蛋白质功能的约束,特定功能单绕样本的结构差异具有种属特异性,结构演化包含了物种进化信息。
宋新蕊李晓琴
关键词：系统聚类物种进化
宽叶阿魏酮作为β2-肾上腺素受体拮抗剂的应用
本发明涉及化合物的新用途，具体涉及宽叶阿魏酮作为β2-肾上腺素受体拮抗剂的应用。
赵勇谢威刘昕陈洁宋新蕊常莉
反向虚拟筛选平台及应用
2015年
靶标确证是老药新用、药物毒副作用研究的关键。基于分子对接方法 Auto Dock Vina和内部构建的疾病靶标数据库,采用分布式架构,构建了反向虚拟筛选平台。应用该平台对药物吡斯的明进行靶标确证,最终成功找到其靶标乙酰胆碱酯酶,验证了平台的实用性和准确性。
张媛刘雨桐李达宋新蕊周雪松赵勇
关键词：老药新用毒副作用AUTODOCKVINA
计算机辅助药物筛选平台及应用被引量：3
2014年
先导化合物发现是创新药物研发的最重要环节之一。针对目前海量功能不明确的小分子化合物,本文构建了一个用来实现快速发现先导化合物,有效降低药物研发成本的计算机辅助药物筛选平台。该平台采用分布式架构思想,集成了Auto Dock Vina和多个小分子库,具有数据安全、计算与存储的负载均衡以及实时监控的特点。应用平台进行先导化合物筛选,在较短时间发现了有针对性的活性小分子化合物,命中率高,大大缩短先导化合物发现周期。该平台具有很好的实用性和良好的扩展性。
宋新蕊李达陈洁赵勇
关键词：AUTODOCKVINA
基于结构的(β/α)8-barrel蛋白进化与特征分析
分子水平的进化研究集中于两大问题:重建物种间的进化关系以及了解进化过程的动力与机制。蛋白质分子进化规律是分子进化研究的重点之一，是生物学重大基础研究课题之一。随着PDB数据库中蛋白质结构数量不断增加以及结构比对算法的发展...
宋新蕊
关键词：分子进化蛋白质结构折叠类型
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