施识帆
- 作品数：2 被引量：3H指数：1
- 供职机构：东南大学生物科学与医学工程学院生物电子学国家重点实验室更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 基于结构特征的核酸序列分析方法的研究与应用
- 随着生命科学的不断发展，基因组序列信息大量产生，针对基因组核酸序列进行分析的手段和方法也层出不穷，但是与序列分析相对应的结构分析的方法却极其有限，这导致我们现在对基因组结构信息的了解非常少。我们知道，核酸的结构是与功能密...
- 施识帆
- 关键词：动态规划算法基因编码区核酸序列分析结构特征
- 文献传递
- 面向蛋白质功能位点识别的机器学习平台构建被引量：3
- 2010年
- 有关蛋白质功能的研究是解析生命奥秘的基础,机器学习技术在该领域已有广泛应用。利用支持向量机(support vectormachine,SVM)方法,构建一个预测蛋白质功能位点的通用平台。该平台先提取非同源蛋白质序列,再对这些序列进行特征编码(包括序列的基本信息、物化特征、结构信息及序列保守性特征等),以编码好的样本作为训练数据,利用SVM进行训练,得到敏感性、特异性、Matthew相关系数、准确率及ROC曲线等评价指标,反复测试,得到评价指标最优的SVM模型后,便可以用来预测蛋白质序列上的功能位点。该平台除了应用在预测蛋白质功能位点之外,还可以应用于疾病相关单核苷酸多态性(SNP)预测分析、预测蛋白质结构域分析、生物分子间的相互作用等。
- 胡敏菁吴建盛施识帆刘宏德孙啸
- 关键词：支持向量机
