朱晓滨
- 作品数：13 被引量：13H指数：3
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- 小麦雌性育性与分子标记的关联分析
- 发掘与小麦雌性育性紧密关联的SSR分子标记,并估算其表型效应。选择遍布基因组的40个多态性标记,对包括小麦雌性不育系的261个小麦品种(系)组成的目标群体使用STRUCTRE软件进行群体结构评估,并利用TASSEL软件的...
- 窦秉德朱晓滨徐海明侯北伟徐海风杨晋彬童婷
- 关键词：SSR小麦雌性育性
- 文献传递
- 小麦taf1位点的连锁不平衡分析被引量：1
- 2009年
- 利用遍布全基因组的21个SSR分子标记,对小麦雌性不育系XND126与1201、802、60个普通小麦品种(系)组成的三个品种(系)群体进行群体结构的评估,发现在三个群体中都存在群体结构.对消除群体结构后的三个亚群体中各标记的连锁不平衡值(linkage disequilibrium value)进行比较.结果表明,群体大小影响标记与雌性育性位点间的LD值.基于对小麦雌性育性taf1位点初步定位的信息.对2DS染色体上30个SSR分子标记的LD研究显示,Xgwm71、Xwmc25、Xgwm515、Xcfd36同样与原标记Xgdm35等具有较大的LD值,可能与taf1密切相关.获得这些较大LD值的标记(Xgwm71、Xwmc25等),为taf1位点的精细定位做出了充分的准备.
- 朱晓滨窦秉德侯北伟徐海风杨晋彬刘福霞顾正中
- 关键词：小麦SSR
- 小麦雌性育性双向极端群体QTL定位策略初探被引量：1
- 2009年
- 在极端不育群体中计算重组频率(c值)初步筛选QTL位点的基础之上,利用普通小麦中育性正常的良种藁城8901(P1)与雌性不育系XND126(P2)杂交F2群体中的189株隐性极端不育株和63株极端可育株组成的双向极端群体为定位群体,构建了连锁图,分析定位了小麦雌性育性位点taf1,获得了与F2平衡群体相同的定位位点.分析发现与taf1位点连锁较紧密的标记,其c值较小.利用极端群体的策略能快速有效的定位小麦雌性育性QTL在染色体上的位置.
- 徐海风窦秉德侯北伟朱晓滨杨晋彬
- 关键词：小麦雌性育性QTL
- 小麦taf1位点的连锁不平衡分析
- 在小麦雌性不育 taf1位点连锁分析定位的基础上,利用 SSR 分子标记技术,使用28 个来自全基因的 SSR 分子标记,对小麦雌性不育系 XND126和120个、200个及260个品种组成的三个群体进行了群体结构的评估...
- 朱晓滨窦秉德侯北伟杨晋彬徐海风王芳顾正中
- 关键词：小麦SSR
- 文献传递
- 小麦雌性育性与SSR分子标记的关联分析被引量：3
- 2009年
- 为了寻找与小麦雌性育性紧密关联的SSR分子标记,并估算其表型效应,选择均匀分布于小麦基因的63个SSR标记,对包括小麦雌性不育系XND126在内的261个品种(系)组成的群体进行分析,并使用STRUCTRE软件进行群体结构评估,利用TASSEL软件的GLM模型检测多态性标记与小麦雌性育性(国内法育性D.F.和国际法育性I.F.)两种表型值的关联程度。结果表明:目标群体中存在3个亚群。基因组中多态性标记关联分析初步显示,标记Xcfd36(2AS、2DS)和Xcfd88(4AL)与小麦雌性育性两种表型值相关联,两个标记对D.F.和I.F.的效应分别是0.1585,0.113和0.087,0.0596。进一步分析发现2DS和4AL连锁群上存在一些与小麦雌性育性更加紧密关联的标记,如Xwmc25(2DS)和Xwmc232(4AL),其效应分别可达到0.5833和0.2841,而2AS上未找到独有的关联标记。分析认为小麦染色体2DS和4AL各存在一个控制雌性育性的基因位点,其中2DS上的QTL被连锁分析所证实。对与表型紧密关联的标记的鉴别对于小麦雌性育性QTL发掘的重要作用进行了探讨。
- 窦秉德朱晓滨张新玲徐海明侯北伟徐海风杨晋彬高爱农
- 关键词：SSR小麦雌性育性
- 小麦雌性育性遗传位点的基因组关联标记扫描
- 2011年
- 以含小麦雌性不育系(S)的由小麦品种(系)组成的含S种质双向极端小群体和不含小麦雌性不育系的品种双向极端小群体各60个品种(系)为目标群体,以小麦基因组中42个多态性SSR标记为背景控制标记,用STRUCTRE软件进行结构评估,并用TASSEL软件的MLM模型检测小麦基因组中均匀分布的210个多态性标记与小麦雌性育性D.F.(国内法育性)和I.F.(国际法育性)两种表型值的关联程度,再在含S种质(或品种)组成的较大群体中验证初选的关联标记,并对候选位点进行标记加密。结果发现背景控制标记间不存在明显的连锁不平衡。品种双向极端小群体和含S双向极端小群体中分别发现13个SSR标记和35个SSR标记与小麦雌性育性表型极显著关联;经关联分析,在两个极端小群体里发现的45个标记中,有17个标记在较大品种群体和含S种质群体中得到验证,除两个大群体中共同与性状关联的标记外,11个标记为小麦雌性不育系所在的含S种质群体分析中发现的新突变位点或互作位点,结合标记加密分析结果,最终发现的候选关联标记不仅支持了2D和4A位点与表型的关联,而且找到2B或3B等新的表型关联位点。
- 童婷窦秉德张新玲朱晓滨张雪妮杨晋彬刘福霞杨文杰
- 关键词：小麦雌性育性
- 小麦染色体2DS雌性育性位点的连锁不平衡分析被引量：1
- 2009年
- 小麦生态遗传型雌性不育系XND126的育性受两对主效基因和微效多基因联合控制。通过SSR分子标记连锁分析,在2DS上定位了一个主基因位点。为了精细定位该位点,并验证其真实性,在59个育性正常的普通小麦品种(系)与XND126组成的较小自然群体中,用2DS参考连锁图上的14对SSR研究了标记与位点间的连锁不平衡(LD)程度,发现所有标记均存在LD现象,并找到了与XND126多态性高的品种(系),作为进一步精细定位的研究材料。依据连锁分析结果,对260个品种(系)与XND126组成的较大自然群体的连锁不平衡研究发现,主效基因位点与其最近的标记Xbarc95间的LD值最大,LD衰减在大群体中同样存在,进一步表明雌性育性主基因位点的确存在于2DS。提示利用连锁分析和关联分析相结合策略进行QTL精确定位是一种有益的尝试。
- 侯北伟窦秉德张新玲王芳朱晓滨徐海明
- 关键词：小麦雌性不育SSR标记自然群体
- 小麦品种面粉色泽相关PPO基因的多态性分析被引量：3
- 2011年
- 以261个小麦品种(系)组成原始群体,利用其多态性分子标记信息,通过模拟核心种质抽提的方法精选了100个品种(系),对入选种质进行了群体遗传结构分析,并对属于3个亚群100个品种(系)的PPO基因的等位变异进行了检测,分析发现100个小麦品种(系)中Ppo-A1 a、Ppo-A1 b、Ppo-D1 a和Ppo-D1 b的基因频率分别为43%、57%、72%、28%,为小麦PPO活性的分子标记辅助选择(MAS)提供了基础资料。
- 王欣窦秉德叶建董红梅孙美娟马跃冯雪娇朱晓滨童婷张瑞越顾正中高爱农
- 关键词：小麦面粉色泽多态性分析
- 小麦雌性育性QTL的高效定位策略被引量：4
- 2009年
- 为了高效地定位小麦雌性育性QTL,以选择表型及连锁不平衡结合策略筛选候选标记.对选取的SSR标记在实验群体中以隐性极端不育亚群体估算其重组频率(c值),确定染色体2AS、2DS上可能存在QTL.再对候选染色体上18个标记分别计算c值,并用育成品种与小麦雌性不育系XND126组成的品种(系)群体计算标记与可能位点间的连锁不平衡值(LD值).结合c值和LD值提供的位点信息构建部分连锁群,通过实验群体F2的连锁分析定位了小麦雌性育性位点taf1.结果发现与taf1位点连锁较紧密的标记,其c值较小而LD值较大.分析认为结合连锁分析和关联分析优势,同时选择c值较小而LD值较大的多态性标记有利于快速确定与位点紧密连锁的标记,从而达到高效定位QTL的目的,并有助于揭示小麦雌性育性的遗传机制.
- 窦秉德侯北伟徐海明朱晓滨徐海风
- 关键词：小麦雌性不育QTL定位
- 小麦基因组中与雌性育性关联标记的初步扫描被引量：2
- 2009年
- [目的]发掘与小麦雌性育性紧密关联的SSR分子标记,并估算其表型效应。[方法]选择遍布基因组的40个多态性标记,对包括小麦雌性不育系的261个小麦品种(系)组成的目标群体使用STRUCTRE软件进行群体结构评估,并利用TASSEL软件的GLM模型检测40个多态性标记与小麦雌性育性D.F.(国内法育性)和I.F.(国际法育性)2种表型值的关联程度,确定入选标记。[结果]群体结构评估表明,目标群体中存在3个亚群。基因组多态性标记关联分析结果显示,标记Xcfd36(2AS、2DS)和Xcfd88(4AL)与小麦雌性育性2种表型值相关联,2个标记对D.F.和I.F.的效应分别是0.1585、0.113和0.087、0.0596。[结论]2DS、4AL和2AS可能存在控制小麦雌性育性的QTL。与表型紧密关联的标记的鉴别对于小麦雌性育性遗传机制的研究具有重要的意义。
- 窦秉德朱晓滨张新玲徐海明侯北伟徐海风杨晋彬刘福霞
- 关键词：SSR小麦雌性育性
