李崇奇
- 作品数：6 被引量：38H指数：4
- 供职机构：海南医学院更多>>
- 发文基金：国家教育部“211”工程山西省回国留学人员科研经费资助项目更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 基于线粒体序列变异探讨野猪系统地理学及家猪起源
- 野猪(Susscrofa)是家猪的祖先，广泛栖息于亚洲、欧洲及非洲北部。该文首先对系统地理学研究进展进行了综述，然后分别基于线粒体控制区(D-loop)序列、细胞色素b(cytb)基因的遗传变异分析，探讨野猪的系统地理演...
- 李崇奇
- 关键词：野猪家猪控制区细胞色素B基因系统地理学
- 文献传递
- 东北亚地区野猪种群mtDNA遗传结构及系统地理发生被引量：19
- 2005年
- 研究测定了中国东北、华北及四川西部72个野猪(Susscrofa)个体线粒体控制区全序列,并结合GenBank报道的日本野猪(S.s.leucomystax)、琉球野猪(S.s.riukiuanus)72个同源区序列,分析了东北亚地区野猪线粒体DNA的变异及系统地理格局。在东北亚地区野猪的线粒体控制区共发现42个变异位点,均为转换,共定义了34个单元型。单元型之间的系统发生分析表明,东北亚地区野猪来自同一祖先。东北亚地区野猪现生种群具有显著的种群遗传结构,其中日本野猪与分布于中国东北地区的东北野猪之间亲缘关系较近;而琉球野猪则与华北野猪间亲缘关系较近,与日本野猪和东北野猪间的关系相对较远。嵌套进化枝系统地理分析(Nestedcladephylogeographicalanalysis,NCPA)表明:东北亚地区野猪由同一祖先经过长距离的迁徙而形成现生各种群(或亚种);琉球野猪应起源于大陆野猪,其种群演化可能经历了片断化事件;华北野猪呈现南部种群遗传多样性高的特点。
- 李崇奇常青陈建琴张保卫朱立峰周开亚
- 关键词：野猪控制区种群遗传结构系统地理学系统发生分析MTDNA线粒体控制区
- 基于微卫星标记的中国大陆地区野猪种群结构分析与亚种分化被引量：10
- 2008年
- 对中国大陆地区分布的野猪亚种分类尚存在争议。本研究通过对野猪11个微卫星位点的变异分析,探讨了中国大陆地区野猪的遗传结构,以期对野猪亚种分类问题有所启迪。对野猪华北、华南和东北种群的分析表明,各种群基因库中都维持了较高的遗传变异水平。基于遗传距离构建的系统树分析发现,研究中所涉及的所有亚种在系统树中混杂,没有任何亚种在其中构成显著的支系。基于微卫星变异的FCA分析不能区分华南、华北、东北三个种群。基于Fst检验的遗传差异分析发现,长江两侧的华南、华北种群之间的遗传差异较小(Fst=0.014),表明长江两侧的野猪可能存在着较高水平的基因流,长江并非是一个有效的空间隔离;东北地区野猪和华北、华南地区野猪之间的遗传差异相对较大(Fst=0.040、0.042),东北野猪可以作为独立的亚种S.s.ussuricus。
- 张保卫张晨岭陈建琴丁栋李崇奇周开亚常青
- 关键词：野猪亚种微卫星亚种分化
- 中国野猪核DNA SANDX-2位点遗传变异分析
- 2007年
- 研究测定了89个中国野猪和1个家猪未知功能核基因SANDX-2位点的序列.在序列比对后长510bp左右,发现有2处4种类型碱基缺失,30个位点发生碱基替换,共定义了19种单元型.在野猪中共发现18种单元型,其中7种只在某一地方种群中发现,11种为地方种群间共享单元型.用邻接法基于核苷酸Kimura 2-parameter模型构建系统发生树中,19种单元型被明显分为2大枝.尽管各枝得到的Bootstrap值均较低,且各地方种群中出现的单元型散布在不同的进化枝中,但单元型在野猪亚种内的分布已出现了一定的地理分布格局.若不考虑碱基的插入/缺失,用TCS构建19种单元型网络表明,HAP2单元型为一古老单元型,其他为衍生单元型.
- 霍爱玲张晨岭李崇奇陈建琴周开亚常青
- 中国大陆野猪SLA DRB基因exon2的序列变异分析被引量：3
- 2008年
- 本文基于135头野猪样本中检测到的15种SLA DRB基因exon 2序列的遗传变异分析,探讨DRB基因在不同地理区域中自然选择的变化特征。研究发现DRB基因exon 2抗原结合位点的非同义替换率为同义替换率的2.95倍,表明该位点受到平衡选择的强烈作用。在系统发生分析中,在基于核苷酸序列构建的NJ树中,野猪DRB位点的15种等位基因全部聚为一枝,没有发现跨种多态现象;而在基于氨基酸序列构建的系统发生树中,野猪SLA-DRB*nnu6和人DRB基因exon 2片段聚在一起,这种氨基酸残基的高度相似可能是由于自然选择压力下产生的趋同。野猪DRB基因exon 2的序列多态性分析表明,东北野猪基因多态性低于四川野猪和华南野猪,这可能与不同气候条件和地理环境下的寄生虫等因素对SLA等位基因变异的影响存在差异有关。
- 丁栋沈菲菲张保卫李崇奇张晨岭周开亚常青
- 关键词：野猪DRBEXON
- 临汾附近两种蛙类染色体特征研究被引量：4
- 2003年
- 本文利用骨髓细胞空气干燥法 ,对临汾附近两种蛙类染色体组型进行分析 .其中中国林蛙 (Rana chensinensis)的二倍体染色体数目为 2 n=2 4 ,包括 1 2个大型染色体 (相对长度大于7.0 )和 1 2个小型染色体 (相对长度小于 6.0 ) .全部染色体可配成 1 2对 .黑斑侧褶蛙 (Pelo-phylax nigromaculata)的二部体染色体数目为 2 m=2 6,全部染色体可配成 1 3对 ,5对大型、8对小型染色体 .与北京郊区同种蛙类染色体比较 。
- 庞春花王丽红张丽平李崇奇
- 关键词：中国林蛙黑斑侧褶蛙染色体组型核型
