杨官品
- 作品数：134 被引量：860H指数：16
- 供职机构：中国海洋大学海洋生命学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学农业科学环境科学与工程天文地球更多>>
- 基于高通量测序的青石斑鱼基因组微卫星开发及评价被引量：8
- 2017年
- 本研究采用基因组高通量随机测序的方法对青石斑鱼(Epinephelus awoara)微卫星标记进行了发掘,结果共获得青石斑鱼(Epinephelus awoara)基因组原始数据2.860G。采用MISA(MIcroSAtellite)软件进行微卫星位点搜索,获得967 657条微卫星序列。随机选取了96条微卫星序列设计引物并利用8尾青石斑鱼个体进行多态性位点筛选,共获得60个具有多态的微卫星标记。利用其中16个微卫星标记对一个青石斑鱼亲鱼群体的种群遗传学特征进行评价,共检测到129个等位基因,单个标记的表观等位基因数(NA)分布范围为2~14,平均为7.167;表观杂合度(HO)分布范围为0.422~1.000,平均为0.678 6;期望杂合度(HE)分布范围为0.481~0.893,平均为0.676 8。有5个标记的等位基因频率不符合"哈迪-温伯格平衡",其中EAW-55596、EAW-21755、EAW-30334 3个标记表现为杂合子显著缺失(P<0.05),而EAW-33674和EAW-52520 2个标记表现为杂合子显著过剩(P<0.05)。连锁不平衡检测表明各位点间无连锁不平衡现象。多态信息含量(PIC)分布范围为0.362 3~0.872 2,平均PIC=0.639 7>0.5,说明该亲鱼群体的遗传多样性比较高。而这些微卫星标记将对于青石斑鱼的遗传变异分析、亲缘关系鉴定提供了技术支持,这也将为青石斑鱼的分子遗传育种奠定了基础。
- 高峰涛邵长伟崔忠凯王升鹏魏敏陈松林杨官品
- 关键词：青石斑鱼高通量测序微卫星标记多态性
- 依据减数分裂特异基因判定三角褐指藻生殖方式的研究被引量：1
- 2013年
- 生殖方式既是重要的生物学特征,也关乎遗传改良策略的选择。在三角褐指藻(Phaeodactylun tricornutum)中,真核生物中广泛存在的有性生殖过程从未被观察到。除直接观察有性生殖过程和依据遗传后果判定,还可根据减数分裂特异基因存在与否判定是否存在有性生殖。在三角褐指藻基因组序列中搜索减数分裂特异基因,用ClustalX进行序列比,用Mrbaye3.2软件构建分子系统学树,进行分子系统学分析,发现三角褐指藻缺失7个减数分裂特异基因中的3个,分别是Hop1,Mnd1和Dmc1。不能观察到有性生殖时,绝大多数(或全部)减数分裂特异基因存在可佐证有性生殖存在,而这些基因缺失则意味着减数分裂丧失和专营无性生殖。因三角褐指藻缺失部分减数分裂特异基因,故推论其专营无性生殖。无性生殖可维持遗传稳定,研究结果有助于通过选择优良藻株培育三角褐指藻的优良品种。
- 郭栗杨官品
- 关键词：三角褐指藻有性生殖无性生殖
- 牙鲆蛋白质感染因子蛋白基因的克隆和结构分析被引量：2
- 2005年
- 采用RT-PCR方法分离牙鲆(Paralichthys olivaceus)蛋白质感染因子蛋白编码基因序列。推测的牙鲆蛋白质感染因子蛋白由472个氨基酸组成,分子量约49.6 kD,具有信号肽、短肽顺接重复、疏水区、糖基化位点、二硫键、糖基缩醛磷肌醇锚定位点等蛋白质感染因子蛋白特征结构域,与红鳍东方(Fugu rubripes)和大西洋鲑(Atlantic salmon)蛋白质感染因子蛋白的相似性分别为71.9%和66.4%。牙鲆蛋白质感染因子蛋白编码基因序列的获得为蛋白质感染因子进化与功能研究以及可能存在的鱼类传染性海绵样脑病研究奠定了基础。
- 廖梅杰张之文杨官品孙修勤邹桂伟危起伟汪登强
- 关键词：牙鲆基因序列
- 微生物标志物在土壤污染生态学研究中的应用被引量：9
- 2008年
- 微生物标志物已被广泛用于土壤污染生态毒理学诊断和土壤污染的预防与修复效果的评价。本文综述了在土壤污染生态学研究中广泛应用的微生物标志物及相关技术,介绍了常用的土壤酶活性测定方法。同时,着重阐述了近几年发展起来的PCR-DGGE和PLFA技术及其应用进展和优缺点。建议实践中应联合使用多种方法,综合不同技术和方法的优势,确保评价的科学性。
- 王菲杨官品李晓军刘宛
- 关键词：土壤酶活性PLFA
- 鲢InDel-RFLP标记开发及其在连锁图谱构建中的应用被引量：2
- 2011年
- 基于随机测序的鲢(Hypophthalmichthys molitrix)基因组片段,尝试开发基于InDel的限制性片段长度多态性标记(InDel-RFLP)。结果显示:共133个片段中,65个在一个野生鲢群体(该野生鲢群体采自长江流域荆州段,31个个体)中表现多态性。共检测到163个等位基因,每位点等位基因数从2到4不等,平均2.5个。65个多态性标记中,有35个被添加到鲢SSR-AFLP性别平均连锁图谱上。长约2 kb的片段比长约1 kb的片段更适用于InDel-RFLP标记开发。设计特异引物,扩增基因组片段,用4种限制性内切酶(BsuR I、Hha I、Taq I和Vsp I)之一切成适宜聚丙烯酰胺凝胶电泳分离的小片段,电泳分离、银染分型。该标记系统避免了对InDel精确定位的困难,通过高分辨PAGE分型,可为鲢连锁图谱构建和性状定位提供丰富的标记位点。
- 张鹏杨官品张立楠危起伟邹桂伟
- 关键词：限制性片段长度多态性
- 工程微生物发酵褐藻碳水化合物生产乙醇：生物乙醇开发新方向被引量：2
- 2014年
- 生物质（biomass）是生产生物燃油和日用品的天然可再生资源。用生物质生产燃油和日用品有助于解决粮食、环境、能源等重大问题。遗传育种、生物技术、化学加工、工程技术等领域的技术进步和整合，正在逐步使利用生物质生产燃油和日用品成为可能。其中，最具代表意义的是发酵生物质生产乙醇。攀升的油价和保护化石燃料资源的压力，使人们力图用工程微生物发酵生物质生产生物燃油和日用品，遗传工程修饰和改造工业微生物，规模化开发多样生物质。玉米和甘蔗可做工业用，但“食物-燃油”忧虑（concerns）可能终结这一路经。木质纤维素来源丰富，但处理木质纤维素释放单糖，成本高，环境压力大。因此，需要全新思路和策略开发利用非木质纤维素生物质，海洋大型褐藻是新希望。
- 杨官品李斐斐
- 关键词：微生物发酵生物乙醇碳水化合物褐藻木质纤维素
- 16SrRNA基因与16S-23SrRNA转录单元内间隔区序列分析及其在节旋藻和螺旋藻分类鉴定中的应用被引量：20
- 2001年
- 测定了节旋藻属 3个品系和螺旋藻属 1个品系的全长 1 6SrRNA基因和 1 6S 2 3SrRNA转录单元内间隔区序列 (ITS) ,分析了已知的节旋藻、螺旋藻和相关品系的相应序列的同源性 ,构建了系统发生树 ,并评价了这两段DNA序列在节旋藻、螺旋藻种属分类和种质鉴定中的意义。结果表明 :( 1 ) 1 6SrRNA基因序列和ITS序列均可用于节旋藻属和螺旋藻属的属间分类 ,以两序列为基础的系统学分析结果一致 ;( 2 )ITS序列变异程度高于 1 6SrDNA序列 ,适用于节旋藻和螺旋藻属内品系或种质鉴定 ;( 3)节旋藻属可明确界定 ,1 6SrRNA基因序列相似性大于 98% ,ITS序列相似性大于 88% ;( 4 )螺旋藻属某些品系间 1 6SrDNA序列和ITS序列相似性较低 ,与不同属间的序列相似性程度为同一水平。
- 茅云翔杨官品张宝红张学成
- 关键词：16SRRNA基因聚类分析螺旋藻属养殖
- 北方用维尼纶苗帘培育海带夏苗的实验研究
- 2017年
- 根据南方和北方海带夏苗培育采用苗帘苗绳差异,在山东烟台国家级海带良种场海带育苗基地进行两种夏苗培育工艺的实验研究。在同一个育苗车间内,利用种海带采集游孢子并附苗,跟踪观测维尼纶苗帘和棕绳苗帘对海带育苗期间配子体发育、孢子体(幼苗)生长的影响,并比较两种不同苗帘育苗成本差异。结果显示:相同育苗条件下,维尼纶苗帘采苗后,配子体发育速度、孢子体形成速度显著优于棕绳苗帘上的配子体和孢子体;转化孢子体后,在育苗第15~31天时间内,维尼纶苗帘海带幼苗相对生长速率(RGR)显著大于棕绳苗帘幼苗(P<0.05);维尼纶苗帘幼苗经55天培育,幼苗平均长度长至1.53 cm±0.13 cm,达到出库下海暂养规格,此时棕绳帘幼苗平均长度约0.47 cm±0.03cm。至70天,棕绳苗帘幼苗平均长度约1.78 cm±0.19 cm,维尼纶绳苗帘幼苗平均长度达7.87 cm±1.35cm,显著大于棕绳苗帘幼苗。采用维尼纶苗帘育苗,每1m3育苗水体育苗量约为60万株,综合育苗成本约为23元/万株,采用棕绳苗帘育苗,每1m^3育苗水体育苗量约40万株,综合育苗成本约为31元/万株。综上所述,北方采用维尼纶帘进行海带育苗在生产上具有可行性,并且可降低生产成本约25.8%。
- 潘金华张壮志孙娟李晓捷曲善村盛宝利杨官品
- 关键词：海带夏苗培育
- 海草场生态系统及其修复研究进展被引量：13
- 2012年
- 海草场能够提供重要的生态系统服务。自20世纪末以来,由于人类活动和自然灾害的影响,全球范围内的海草场出现了急剧衰退,由此也促进了海草场生态系统的研究以及海草场人工修复技术的发展。近年来,针对海草场生境流失的现状,中国也开始开展海草场修复工作。从以下方面进行论述:(1)海草的种类、分布,海草场生态系统功能及其生态系统服务:与陆地系统相比,全球海草物种多样性较低,了解海草的分布特征有助于通过了解海草如何适应当地环境压力,以揭示海草适应环境的能力;海草场提供重要而广泛的自然生态系统服务,特别是在维护近岸生态系统健康和满足人类需求过程中起到重要的作用;(2)海草场的衰退及其原因:认识并缓解人类压力对海草场的危害是促进海草场生态系统可持续发展的重要一环;(3)国内外海草场修复现状:以此阐明海草场修复原理,为海草场修复提供科学的方法;(4)总结与讨论:基于科学研究背景,为中国海草场生态系统保护和修复提出建议。海草场的修复和保护应当相辅相成,并与我国海岸长远规划相结合,以此推动我国海草场生态系统服务的可持续发展。
- 潘金华江鑫赛珊周文江吴家奇李晓捷杨官品
- 关键词：生态系统功能生态系统服务
- 弧菌16S rRNA基因特异引物设计及海洋弧菌菌群结构分析被引量：3
- 2010年
- 弧菌是海水中最常见的细菌类群之一。弧菌属的一些种是致病菌,能引起海洋生物弧菌病,给养殖业造成损失。根据已有弧菌16S核糖体RNA基因(16S rDNA)序列,设计了3条弧菌属特异引物VF169、VR744和VR1150,与细菌16S rDNA通用引物VF27一起,组成VF169/VR744、VF169/VR1150和VF27/VR744 3引物对。从海水中直接提取浮游生物总DNA,用VF169/VR744,VF169/VR1150和VF169/VR744(巢式)以及VF27/VR744引物分别扩增弧菌16SrDNA片段并克隆,分别构建了弧菌16S rDNA片段变异类型文库。从各文库中分别随机选取一定数量的克隆测序,共获得72条序列。系统学分析表明所有72个序列都与已知的弧菌属细菌的序列聚类,具有很高的相似性,证明所设计的引物能用于海水样品弧菌菌群分析。另外,VF27/VR744既具有对海洋弧菌的高度特异性,也具有恰当的海洋弧菌覆盖面,是1对选择扩增海水中弧菌16S rDNA的较理想引物。从获得序列的分布情况看,胶州湾存在较高的弧菌多样性,其中,类灿烂弧菌菌群(Vibrio splendidus-related group)是优势类群。
- 孙颖刘泳王华磊陈吉祥杨官品
- 关键词：弧菌RRNA基因
