王晓蔓
- 作品数：20 被引量：54H指数：5
- 供职机构：广州医科大学更多>>
- 发文基金：广州市科技计划项目广东省科技计划工业攻关项目广东省医学科学技术研究基金更多>>
- 相关领域：医药卫生政治法律生物学更多>>
- 单精子测序结合PCR-反向点杂交技术在1例东南亚缺失型α地中海贫血患者胚胎植入前遗传学检测中的应用
- 2023年
- 目的探讨单精子测序结合PCR-反向点杂交(PCR-reverse dot blot,PCR-RDB)技术在东南亚缺失型α地中海贫血胚胎植入前遗传学检测中的应用价值。方法选取2020年4月24日就诊于广州医科大学附属第三医院妇产科的一对东南亚缺失型α地中海贫血携带者夫妇,针对男方无法提供家系成员样本的情况,本案例采用上游法结合显微操作移液管挑选其5份单精子样本并进行全基因组扩增,通过PCR-RDB技术确定男方单精子样本的地中海贫血基因分型,在--^(SEA)区域的上下游1 Mb范围内选择单核苷酸多态性位点(single nucleotide polymorphism,SNP)作为遗传标记,进行二代测序分析构建双亲单体型。对6份囊胚活检样本进行全基因组扩增后行二代测序,通过单体型分析胚胎是否携带致病变异,并选取非患病囊胚进行移植。孕20周抽羊水进行产前诊断,验证与单基因病胚胎植入前遗传学检测(preimplantation genetic testing for monogenetic disease,PGT-M)结果是否一致。结果女方的致病变异来源于其母亲,男方5份单精子样本的地中海贫血基因分型结果显示有4份为野生型。单精子测序筛选出男方有效位点10个,女方家系连锁分析得到女方有效位点6个,PGT-M结果显示4枚囊胚为αα/--^(SEA),2枚为--^(SEA)/--^(SEA),产前诊断结果显示胎儿基因型为αα/--^(SEA),与PGT-M结果一致,并于孕40周分娩一健康女婴。结论对于家系不全的男性东南亚缺失型α地中海贫血携带者,可采用单精子测序结合PCR-RDB技术筛选SNP位点,通过连锁分析行PGT-M。
- 何健淳黎青王燕超冼嘉嘉张敏聪何文智马晓燕叶国新王晓蔓李少英
- 关键词：植入前诊断
- 广东汉族人群H19基因上游差异甲基化区SNP被引量：1
- 2016年
- 目的 调查广东汉族人群中H19基因上游差异甲基化区（differentially methylated region,DMR）的单核苷酸多态性（SNP）及单倍型.方法 应用PIA分型法,以限制性内切酶McrBC、HpaⅡ消化基因组DNA分别获得个体单亲源DNA模板链,经测序,分别获得个体H19基因上游DMR单亲源SNP等位基因、基因型及单倍型数据.结果 共检出13个SNP（rs10840167、rs2525883、rs12417375、rs4930101、rs2525882、rs2735970、rs2735971、rs11042170、rs2735972、rs10732516、rs2071094、rs2107425、rs4930098）及1个突变点（g7351c）.所有位点经统计学分析均符合Hardy-Weinberg平衡定律（P〉0.05）.除rs12417375位点DP值为0.279,其余12个SNP DP值在0.446~0.614;g7351c突变点DP值为0.013,提示为南方汉族民族特异性位点.共检出8种单倍型（命名为单倍型1~8）,其中有3种为新发现的单倍型,其DP、PIC、PE及H分别为0.891、0.714、0.524和0.758.结论 PIA分型法获得的H19基因上游DMR SNP位点及其单倍型遗传标记系统具有较高的鉴别能力,在法医学鉴定中具有较好的实用价值.
- 马晓燕何文智袁天丽冼嘉嘉王晓蔓李少英刘海波黎青
- 关键词：法医遗传学DNA甲基化
- 中国人群中抗肌萎缩蛋白基因突变类型和分布特点及其与临床症状的相关性被引量：5
- 2011年
- 假性肥大型进行性肌营养不良症(Duchenne’s muscular dystrophy,DMD)是源于横纹肌的一种X-连锁隐性致死性遗传病,由编码抗肌营养不良蛋白(dystrophin)基因突变所致。为了探讨中国人群中DMD患者的dystrophin基因突变类型和分布特点及其与临床症状的相关性,文章采用Multiplex Ligation-Dependent Probe Amplification(MLPA)方法对720例DMD患者及其母亲和20例正常成年男性进行dystrophin基因分析。结果显示,检出率为64.9%(467/720),54.3%(391/720)的患者为基因缺失;10.6%(76/720)的患者为基因重复。累及Exon45-54缺失突变型占全部缺失型患者的71.9%(281/391);重复突变型累及Exon1-40占全部重复型患者82.9%(63/76);检出的患者中,DMD型和中间型营养不良症(Intermediate muscular dystrophy,IMD)型占90.6%(423/467),Becker型营养不良症(Becker muscular dystrophy,BMD)型占9.4%(44/467)。表明假肥大型肌营养不良症以dystrophin基因缺失突变为主,突变发生在整个基因中非均匀分布,存在突变热区,在缺失和重复的位置和片段长度与肌病的临床症状严重程度之间并不存在简单的相关关系。
- 李少英孙筱放黎青张慧敏王晓蔓
- 关键词：抗肌萎缩蛋白
- Expressmarker22系统检测广东汉族人群中的标准梯度外等位基因被引量：6
- 2018年
- 【目的】分析Expressmarker22(EX22)系统检测广东汉族人群中的梯度标准物范围之外(OL)等位基因频率及序列组成,完善频率数据库。【方法】应用EX22系统对3495例广东汉族无关个体进行STR分型,统计等位基因分型OL的等位基因频率并筛选稀有等位基因。通过比对STRBase数据库和相关文献,对暂未报道的OL样本进行单基因座扩增及克隆测序。【结果】共发现分布于10个基因座中的33种OL等位基因,频率为0.3‰~4.6‰,其中稀有等位基因25种,11个未见报道。测序结果显示以核心序列的不完整重复多见。【结论】OL等位基因数据有助于提高个体识别率和非父排除率,有效补充法医DNA多态性数据,完善数据库建设。
- 马晓燕李少英何文智王燕超王晓蔓冼嘉嘉黎青
- 关键词：短串联重复序列测序
- 广东汉族人群21个STR基因座的稀有等位基因
- 目的分析广东汉族人群21个STR基因座的稀有等位基因频率及序列组成,为进一步研究基因多态性提供基础数据。方法检测3495例广东汉族无关个体的21个STR基因座分型,统计等位基因分型标准物之外(Of f-Ladder,OL...
- 马晓燕李少英何文智王燕超王晓蔓冼嘉嘉黎青
- 文献传递
- 畸型精子症患者精子DNA完整性与年龄及常规精液参数的关系被引量：9
- 2018年
- 【目的】探讨畸形精子症患者的精子DNA完整性与年龄及常规精液参数的相关关系。【方法】收集2013年1月至2016年12月在我院生殖中心就诊的255例畸型精子症患者的精液标本,将患者按年龄分为≤30岁、30~35岁和≥35岁3组,按WHO第5版手册进行精液常规分析,采用精子染色质扩散法(SCD)检测精子DNA完整性。【结果】畸形精子症患者精子DNA碎片指数(DFI)与前向运动精子百分率(PR%)、精子总活力呈负相关(P <0.001;P <0.001),与年龄、正常形态精子百分率(NF%)可能存在弱相关关系(P=0.003;P=0.027)。精子浓度、总精子数与精子DFI之间的相关关系无统计学意义(P=0.260;P=0.541)。不同年龄组患者的精子DFI水平差异具有统计学意义(P=0.021);年龄≥35岁组的精子DFI水平显著高于≤30岁组和30~35岁组(P=0.030,P=0.035);而≤30岁组和30~35岁组间的精子DFI水平差异无统计学意义(P=1.000)。年龄≥35岁组的精子DFI异常率明显高于≤30岁组和30~35岁组(P=0.002)。在年龄≥35岁组中,年龄、PR%及精子总活力在DFI正常患者与DFI异常患者之间的差异具有统计学意义(P=0.006;P <0.001;P <0.001)。【结论】畸形精子症患者的PR%是与其精子DFI最密切相关的精子参数;年龄越大的畸形精子症患者的精子DNA完整性越差。
- 郭丽媛周华王晓蔓刘敏
- 关键词：畸形精子症精子DNA完整性年龄精液参数
- 三核苷酸重复引物PCR和甲基化特异性多重连接探针扩增技术在脆性X综合征产前诊断中的应用被引量：4
- 2017年
- 目的探讨脆性X综合征(FXS)产前基因诊断的方法。方法采用三核苷酸重复引物PCR法(TP-PCR)及甲基化特异性多重连接探针扩增技术(MS-MLPA)检测2个FXS家系及30例正常对照胎儿样本FMR1基因CGG重复数、AGG排布及FMR 1基因Cp G岛甲基化状态。结果正常对照FMR1基因(CGG)n重复数介于23~40之间,频数最大的重复数为29,AGG排布式以9A9A9最为常见。2个FXS家系中前突变等位基因向子代遗传过程中均发生了CGG扩展。正常对照及前突变携带者FMR1基因Cp G岛均为低甲基化状态,全突变患者Cp G岛为高甲基化状态。结论 TP-PCR和MS-PCR联合应用能够检出胎儿FMR1基因CGG重复数和Cp G岛甲基化状态,从而判断胎儿是否为脆性X综合征患儿,为优生干预提供可靠的依据。
- 何文智李少英王晓蔓王燕超马晓燕冼嘉嘉刘海波王鼎黎青
- 关键词：产前基因诊断
- 应用基因芯片技术快速检测G-6-PD基因突变被引量：3
- 2002年
- 目的 :建立基因芯片实验平台 ,并应用本技术检测G 6 PD基因突变。方法 :对我院用酶学方法筛查出的G 6 PD缺乏患者 45例 ,抽血提取DNA ,用五对荧光引物进行PCR扩增后与芯片进行杂交 ,用ScanArray芯片扫描仪读片。结果 :检测出G1388A ,G 1376T ,C10 2 4,A95G和G392T ,C5 92T等类型的G 6 PD基因突变 ;图像清晰稳定。结论 :基因芯片技术检测G 6 PD基因突变方法稳定、快速 ,在临床上应用可行。
- 黎青肖国宏孙筱放麦卫阳王晓蔓
- 关键词：葡糖磷酸脱氢酶缺乏基因芯片技术基因诊断
- 广东汉族人群21个STR基因座的稀有等位基因
- 马晓燕李少英何文智王燕超王晓蔓冼嘉嘉黎青
- 广东汉族人群21个STR基因座的稀有等位基因
- 目的分析广东汉族人群21个STR基因座的稀有等位基因频率及序列组成,为进一步研究基因多态性提供基础数据。方法检测3495例广东汉族无关个体的21个STR基因座分型,统计等位基因分型标准物之外(Of f-Ladder,OL...
- 马晓燕李少英何文智王燕超王晓蔓冼嘉嘉黎青
