陈梅
- 作品数：3 被引量：3H指数：1
- 供职机构：北京大学信息科学技术学院软件研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中国博士后科学基金国家教育部博士点基金更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术生物学更多>>
- 基于Riboswitch的细胞与门构建
- 2014年
- 利用Riboswitch调控原理,在大肠杆菌BL21(DE3)菌株中构建一个细胞与门。该与门以实验室常见的阿拉伯糖和异丙基-β-D-硫代吡喃半乳糖苷(IPTG)为输入信号,黄色荧光蛋白YFP为输出信号,流式细胞仪检测结果显示该细胞与门成功地实现与逻辑运算。该与门利用大肠杆菌BL21(DE3)菌株的特性,减少了基因线路的负载。此外,该与门还具有可复用的特点。
- 陈梅张路许进
- 关键词：核糖开关
- 最小支配集问题的活体分子计算模型被引量：2
- 2009年
- 生物体内分子网络中信息的传输、储存、放大、整合等大量任务可以看成是一种生物分子计算过程.文中提出了一种活体分子计算模型,借助RNA干扰技术和乳糖操纵子调控模型,在细胞内构建了一个基因网络,用于求解图的最小支配集.该模型展示了利用生物体自身的信息处理能力进行计算的能力,在生物体内建立具有一定智能的分子机器,这将在计算科学、生物学、医学上有着深远的应用前景.
- 刘向荣王淑栋郗方陈梅
- 关键词：基因网络RNA干扰
- 可满足性问题生物砖翻转细胞计算模型被引量：1
- 2013年
- 细胞内丰富的信息处理机制和细胞计算的巨并行性一直吸引着科学家构建细胞计算机.科学家利用细胞内的信息处理机制开发了不少模仿简单电子器件功能的细胞计算部件,如细胞布尔逻辑门、细胞记忆单元等,但这些部件没有充分利用细胞计算的巨并行性特点.DNA重组酶Hin能催化DNA片段的翻转反应,通过切换DNA片段的方向来调控基因的表达.该文利用DNA重组酶Hin的这一性质,以合成生物学中广泛使用的生物砖为材料,以大肠杆菌Escherichia coli为宿主细胞,以DNA重组酶Hin为计算工具,构建了一个解决可满足性问题的细胞计算模型.该模型中,每个细胞可独立地生成并判定可满足性问题的一个解,数以亿计的细胞可检查数以亿计的可能解.该模型充分利用细胞计算的巨并行性,显示了细胞计算的巨大潜力.
- 陈梅陈向群张路许进
- 关键词：基因调控
