张岗
- 作品数：131 被引量：514H指数：14
- 供职机构：陕西中医药大学更多>>
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- 相关领域：医药卫生农业科学文化科学生物学更多>>
- 基于通用DNA条形码序列的黄精属药用植物分子鉴定被引量：3
- 2023年
- 目的 分析4个通用植物DNA条形码序列(trn H-psb A、mat K、rbc L和ITS2)及其组合对黄精属药用植物的物种鉴定分辨率,挖掘适用于黄精属种间鉴定的高分辨率分子标记。方法 以《中国药典》2020年版中收录的黄精属药用植物黄精Polygonatum sibiricum、滇黄精P. kingianum、多花黄精P. cyrtonema、玉竹P. odorati及其地方常见同属替代品、混伪品共12种79个野生个体为对象,将4个通用DNA条形码序列独立、联合分析,评估其种间、种内变异情况,并分别基于建树法(tree-based method)和PWG距离法(PWG-distance method)评估不同条形码及其组合的物种鉴定分辨率。结果 ITS2序列扩增成功率低,trn H-psb A、mat K、rbc L序列的引物在黄精属植物中通用性较好;3组叶绿体序列的种间变异依次为mat K>trn H-psb A>rbc L,种内变异差异不显著,种间、种内遗传距离无明显的Barcoding gap;各条形码独立及联合分析的物种鉴定分辨率普遍偏低,其中,组合条形码trn H-psb A+mat K+rbc L在建树法分析中的分辨率最高,为25%,trn H-psb A+rbc L在距离法分析中的分辨率最高,为50%。结论 4个通用DNA条形码序列及其组合都并非黄精属药用植物不同种间有效区分鉴定的理想分子标记,但多序列联合分析能在一定程度上提高物种鉴定成功率。
- 张明英李依民程文萍高静颜永刚杨琳胡锦航张岗
- 关键词：黄精属DNA条形码药用植物物种鉴定黄精滇黄精
- 铁皮石斛转录因子基因DoWRKY3的克隆与分子特性分析被引量：8
- 2017年
- 目的克隆珍稀濒危药用植物铁皮石斛转录因子基因DoWRKY3,并进行生物信息学和表达模式分析。方法采用RT-PCR和RACE技术获取基因全长;利用生物信息学软件预测蛋白的理化性质、结构域和亚细胞定位等分子特性;用软件DNASTAR 6.0和MEGA 6.0分别进行氨基酸多序列比对和进化关系分析;借助定量PCR检测基因表达模式。结果分离到DoWRKY3基因(GenBank注册号KT957549),cDNA全长2 065 bp,编码1条由509个氨基酸组成的多肽,相对分子质量55 580,等电点6.58;推定的DoWRKY3氨基酸序列具有植物WRKY蛋白家族保守的2个WRKY结构域(217~279、381~449)、2个WRKYGQK位点和2个C_2H_2型锌指结构元件(C-X_4-C-X_(22-23)-H-X_1-H);该蛋白预测无信号肽或跨膜域,定位在细胞核;DoWRKY3蛋白与多种植物WRKY蛋白一致性较高(46.3%~57.4%),与拟南芥At WRKY3、At WRKY4和丹参Sm WRKY54蛋白等亲缘关系近,聚在WRKY分子进化树的Group 1分支;DoWRKY3基因具有组织表达特异性,其转录本在石斛根和叶中表达量较高,分别为茎中的2.32倍和1.69倍。结论 DoWRKY3基因全长的分子克隆与特征分析,为深入研究该基因在铁皮石斛生长发育、逆境生理以及次级代谢调控中的生物学功能奠定基础。
- 张岗刘思思彭亮周丽思刘亮亮李欢黑小斌沈霞郭顺星
- 关键词：铁皮石斛WRKY克隆定量PCR
- 铁皮石斛S-腺苷酸脱羧酶基因DoSAMDC1的克隆及特征分析被引量：14
- 2013年
- S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶(S-adenosyl-L-methionine decarboxylase,SAMDC)是多胺合成的关键酶,通过调节多胺的代谢途径参与植物的多项生理生化过程。本文利用cDNA末端快速克隆技术(RACE),首次从铁皮石斛共生萌发种子中分离得到一个新的SAMDC基因,命名为DoSAMDC1(GenBank注册号JX966243),并对其编码蛋白的理化性质、保守结构域等特征进行分析。生物信息学分析表明,DoSAMDC1基因的全长为1979bp,涵盖tiny-uORF、small-uORF和mainORF3个植物SAMDC基因特征ORF。mORF编码一条368个氨基酸的肽链,预测分子质量为40.7kD,等电点为5.2,编码蛋白不含信号肽,具有22个氨基酸的跨膜域(89～110位),具有植物SAMDC的典型结构特点,包括酶原剪切位点、PEST结构域及催化功能必须的氨基酸。序列比对及系统发育树分析结果表明DoSAMDC1与单子叶植物SAMDC具有很高的同源性,与双子叶植物的亲缘关系较远。应用实时荧光定量PCR对DoSAMDC1基因在石斛不同组织中的表达模式分析发现,该基因在未接菌的植物组织中表达变化差异不大,在接菌共生萌发的植物种子中显著上调表达,为未萌发种子的2.74倍,具有受真菌侵染诱导表达的特性,揭示其可能通过参与多胺调控途径在植物?真菌共生方面发挥作用。
- 赵明明张岗张大为郭顺星
- 关键词：铁皮石斛共生萌发
- 基于高通量测序技术的黄三七根茎转录组数据分析被引量：9
- 2018年
- 目的获得黄三七Soulieavaginata根茎转录组信息特征。方法以黄三七根茎为对象,采用二代高通量测序平台IlluminaHi SeqTM2000150PE进行转录组测序并进行系统的生物信息学分析。结果转录组测序分析共获得63 322 086条高质量序列(clean reads),Trinity de novo组装获得52 575个unigenes,平均长度909 nt。BLAST分析显示分别有28 842(54.86%)、10 712(20.37%)、9 245(17.58%)、11 559(21.99%)条unigenes在NR、Swiss-port、KOG、KEGG数据库得到注释信息,可归为GO分类的生物过程、细胞组分和分子功能3大类45分支,涉及126个KEGG标准代谢通路,其中包括17个次生代谢标准通路。蛋白编码框序列2 215个,包含高等植物转录因子55个家族;借助MISA软件发现4 609个SSRs,三碱基重复SSRs数量最丰富,有2106个,出现频率为45.7%,五碱基重复SSRs相对较少,占2.9%。结论利用高通量测序技术和生物信息分析获得黄三七根茎转录组信息特征,为后期黄三七功能基因鉴定、次生代谢途径解析及其调控机制研究奠定基础。
- 李依民彭亮杨冰月张明英任瀛程虎印吴海峰张岗
- 关键词：转录组功能基因代谢通路简单重复序列
- 野生与栽培远志HPLC指纹图谱及化学模式识别研究被引量：21
- 2018年
- 目的建立野生和栽培远志的HPLC指纹图谱,为不同来源远志鉴别和质量评价提供依据。方法利用HPLC法对20批不同产地野生与栽培远志进行测定,采用中药色谱指纹图谱相似度评价系统(2012A版)计算相似度,运用主成分分析(PCA)和最小偏二乘法-判别分析(PLS-DA)对其进行模式识别研究。结果建立了野生与栽培远志HPLC指纹图谱共有模式,标定了24个共有峰,20批不同产地野生与栽培远志指纹图谱与对照指纹图谱的相似度均>0.86。PCA可较好地将不同来源远志归为2类,PLS-DA则能将野生与栽培远志完全区分开,远志酮III和3,6′-二芥子酰基蔗糖等12个成分是导致二者差异的主要标记物。结论建立的远志指纹图谱特征性强,结合化学模式识别方法可有效评价远志质量以及区分其野生与栽培品,为远志的质量控制和化学计量分类学提供参考依据。
- 彭亮杨冰月张琳周可心颜永刚李依民高静陈莹王薇张岗胡本祥
- 关键词：远志指纹图谱化学模式识别
- 不同干燥方法对远志筒及根中主要化学成分的影响被引量：15
- 2018年
- 目的考察晒干、阴干、热风干燥(40、50、60、70℃)、微波干燥和冷冻干燥5种干燥方法对远志筒及根中主要化学成分的影响。方法运用HPLC法测定不同干燥方法对远志筒及根中远志酮III、3,6′-二芥子酰基蔗糖、远志酸、远志皂苷元、细叶远志皂苷的组成和含量变化;采用单因素方差分析和TOPSIS法对数据进行综合分析。结果远志筒和根的干燥方法优选顺序存在差异,远志筒不同干燥方法对有效成分影响的优劣排序为微波干燥>60℃热风干燥>50℃热风干燥>70℃热风干燥>冷冻干燥>40℃热风干燥>阴干>晒干;远志根中,不同干燥方法的排序为微波干燥>60℃热风干燥>阴干>晒干>50℃热风干燥>40℃热风干燥>70℃热风干燥>冷冻干燥。结论结合生产实践,微波干燥和60℃热风干燥是远志筒和根较适宜的干燥方法,可为远志不同规格药材产地干燥方式的确定提供依据。
- 彭亮杨冰月程虎印张岗孙涛张明英杨新杰刘阿萍颜永刚胡本祥
- 关键词：远志远志酸远志皂苷元细叶远志皂苷
- 铁皮石斛DoMAPK5基因的克隆及表达特征分析被引量：5
- 2016年
- 目的克隆及分析铁皮石斛DoMAPK5基因的表达特征。方法利用cDNA末端快速克隆技术(RACE),首次从铁皮石斛接菌共生萌发种子中分离得到1个新的MAPK基因,对其编码蛋白的理化性质、保守结构域等特征及进行了分析。并应用荧光定量PCR对DoMAPK5基因在石斛不同组织中表达模式分析。结果 DoMAPK5基因(Gen Bank注册号KJ472788),全长为2184bp、编码一条597个氨基酸的肽链,预测分子量为67.39KDa,等电点为9.28,编码的蛋白均不含信号肽,在210-232位具有23个氨基酸的跨膜域,具有MAPK蛋白家族保守的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶的结构域及MAPK位点。序列比对及系统发育树分析结果表明DoMAPK5基因与葡萄MAPK基因均具有很高的相似性(82%),与水稻MAPK10亲缘关系最近。应用荧光定量PCR对DoMAPK5基因在石斛不同组织中表达模式分析显示,该基因在未接菌的植物组织中属组成型表达,在接菌共生萌发的植物组织中显著上调,为未萌发种子的10.49倍。结论 DoMAPK5在植物组织中属于组成型表达,具有受菌根真菌诱导表达的特征。
- 赵明明张岗张大为李标郭顺星
- 关键词：铁皮石斛共生萌发
- 水杨酸和茉莉酸甲酯对远志愈伤生长及其总酚总黄酮积累的影响
- 目的 研究水杨酸(salicylic acid,SA)和茉莉酸甲酯(methyljasmonate,MeJA)对远志愈伤组织生长及其总酚总黄酮的影响.方法 以远志继代愈伤组织为材料,于不同SA(0、4、8、12、16、2...
- 李洁彭亮杨冰月罗露曹福麟颜永刚张岗胡本祥
- 关键词：远志水杨酸茉莉酸甲酯总酚总黄酮
- 1种苎麻根腐病线虫的鉴定被引量：6
- 2011年
- 【目的】对分离的一种苎麻根腐病线虫进行形态和分子生物学鉴定,为病原线虫分子生物学检测技术的研发及苎麻根腐病的防治奠定基础。【方法】从感染苎麻根腐病植株根中分离出一种植物病原线虫,利用显微技术观察线虫的形态特征,对其进行初步鉴定;之后采用分子生物学技术,提取单条线虫的DNA,利用通用保守性引物扩增了线虫核糖体DNA内部转录间隔区(rDNA-ITS)序列,并用软件DNAstar和DNAMAN进行序列分析,对该植物病原线虫进行进一步鉴定。【结果】根据形态特征,将获得的苎麻根腐病线虫初步鉴定为咖啡短体线虫。序列分析结果表明,该线虫rDNA-ITS序列与咖啡短体线虫湖北种群、越南种群、台湾种群、日本种群及尼日利亚种群的同源性依次为99.8%,99.0%,98.0%,97.8%和94.6%。该线虫rDNA-ITS序列在GenBank注册号为HQ403649。【结论】形态及分子生物学鉴定结果表明,分离的苎麻根腐病线虫为咖啡短体线虫(Pratylenchus coffeae)。
- 余永廷薛召东曾粮斌张岗陈权朱爱国
- 关键词：苎麻根腐病RDNA-ITS咖啡短体线虫
- 一种采用预先分级的黄芪种子机械破皮处理方法
- 本发明属于破皮处理技术领域，公开了一种采用预先分级的黄芪种子机械破皮处理方法。本发明通过对黄芪种子光谱图像进行增强处理方法调节对比度增强参数，根据调节后的对比度增强参数确定结果黄芪种子光谱图像，可以提高对比度增强参数的准...
- 颜永刚王育朋王红艳张岗杨冰月彭亮高静李依民王祥安佳王七龙井亚江黄建萍夏泽冰邹远荣
