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施清芸
作品数:
1
被引量:3
H指数:1
供职机构:
浙江大学生命科学学院植物生理学与生物化学国家重点实验室
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发文基金:
国家自然科学基金
国家重点基础研究发展计划
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相关领域:
农业科学
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合作作者
何飞
浙江大学生命科学学院植物生理学...
吴平
浙江大学生命科学学院植物生理学...
陈铭
浙江大学生命科学学院植物生理学...
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作者
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施清芸
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陈铭
1篇
吴平
1篇
何飞
传媒
1篇
中国水稻科学
年份
1篇
2007
共
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RiceDB:基于Web界面的水稻基因芯片注释整合数据库
被引量:3
2007年
开发了1个基于Web界面在生物学背景下注释水稻基因芯片的整合数据库RiceDB,它的注释信息比同类针对水稻Affymetrix 57K全基因组表达谱芯片的注释数据库更全面、更快捷且可以自动更新。它由8个功能模块组成,RiceMap建立水稻Affymetrix 57K探针组与基因的对应关系,从而提供来自各个水稻生物信息学数据库功能描述信息;RiceGO整合Gene Ontology数据库从生物学途径/分子功能和细胞构建对Affymetrix 57K探针组进行注释;RiceKO确定Affymetrix 57K探针组代表的基因可能参与的代谢与调控路径;RiceUP、RiceDO、RiceMR、RiceCD、RiceGF分别确定Affymetrix 57K探针组代表的基因上游小于1 kb启动子序列、结构功能域组成、受哪些水稻MicroRNA调控、染色体定位、基因家族分类。
何飞
施清芸
陈铭
吴平
关键词:
水稻
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