朱世佳
- 作品数：3 被引量：1H指数：1
- 供职机构：哈尔滨工业大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术生物学更多>>
- 基于Petri网和SBML的可视化生物建模语言的研究
- 随着后基因时代的到来，生物过程的模拟已经显示出了越来越重要的作用，它有力地支持了生物学家以及其他研究人员在医学和制药等相关领域的研究。但是在生物过程模拟的研究中，如何直观有效地表达出复杂的生物模型却是一个困难的问题，也是...
- 朱世佳
- 关键词：PETRI网生物模型可视化技术图文法
- 文献传递
- 基于TGG的SBML与其他生物建模语言间的自动转换研究被引量：1
- 2011年
- 基于XSLT技术的SBML与其他生物建模语言之间的转换方法存在无法保证转换结果的确定性、语法正确性及不能满足模型转换的工业化需求等缺陷.针对以上问题,提出了利用图文法定义SBML Schema及其他生物建模语言,并且利用Triple Graph Grammar构造SBML与其他建模语言之间的转换方法.在此基础上,提出了一种基于单路径尝试条件的转换算法,该算法具有多项式时间复杂性,能够保证转换目标对象的确定性与语法正确性,给出了相关证明,并且讨论了该条件在生物模型转换中的适用性.与传统方法相比,该方法利用可视化方法实现转换,简化了定义过程;无需动态检查转换过程,只要转化规则正确即可保证转换结果正确;同时支持扩增传播以及模型间双向转换.最后,通过Petri网与SBML之间的转换例子证实了该算法的正确性与有效性.
- 朱世佳王亚东季春光陶海军
- 关键词：图文法XML
- 面向基因表达调控的组蛋白修饰网络构建方法研究
- 随着上千种生物基因组测序工作的完成和研究者们对于基因组功能研究的不断深入,人类对于生命的认知已经进入了后基因组时代。探索基因表达的调控方式已经成为当下科研工作者的重要任务。 真核生物的基因组包裹在核小体上,形成一种染色...
- 朱世佳
- 关键词：组蛋白修饰基因调控外显子染色质结构
- 文献传递
