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用一种新的Motif识别算法识别基因调控元件: 该文对MobyKick算法进行了扩展,使词的范围扩展到包括带有碱基通配符的词.我们为该算法建立了一套基于迭代的数值解法,包括简单迭代、线性化加速迭代和牛顿迭代.还为新的模型重新定义了Q<,w>作为词的质量指标.我们运用该...; 何智良; 关键词：酵母基因芯片; 文献传递

微生物基因组的生物信息学研究平台的建立被引量：3: 2002年; 随着人类基因组计划及其它测序工作顺利进行,人们已经得到了大量的基因序列。如何阐明这些序列的功能和意义,是功能基因组学的主要任务。生物信息学和比较基因组学为加速这一进程提供了有利的工具。该研究建立了对已经完成全基因组测序和部分测序的25种细菌的基因组的生物信息学研究平台,提供了WEB形式的服务(http://202.116.74.108)。25种细菌的全基因组蛋白质序列可以在NCBI的ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/geabank/genomes/bacteria下载。该系统可以按照基因序列号、功能和种属名查询基因序列,根据美国国家信息中心(NCBI)的功能代码表对每个基因进行了自动和手工分类,并可查询分类情况,在此基础上建立了几种亲缘关系相近的种属的同源基因相互注释功能的应用。; 赵贵军何智良卢阳叶兰汀徐安龙; 关键词：微生物基因组生物信息学细菌基因组功能注释

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何智良