刘金龙
- 作品数:9 被引量:10H指数:2
- 供职机构:中国科学院成都生物研究所更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国际科技合作与交流专项项目更多>>
- 相关领域:生物学环境科学与工程医药卫生农业科学更多>>
- 胎生与与母体免疫系统的协同进化:以密点麻蜥MHC基因为例
- 在胎生的演化中,脊椎动物复杂的免疫系统对'半外来'(semi-foreign)的胎儿构成潜在威胁.哺乳动物胚胎要避免母体的免疫排斥,通过改变胎盘两种类型的主要组织相容性复合体基因(MHC)的表达来得以实现,即经典的MHC...
- 原秀云刘金龙郭宪光
- 关键词:密点麻蜥
- 干旱荒漠区虫纹麻蜥谱系地理结构和群体历史动态研究
- 新生代以来剧烈的地质和气候变化,特别是第四纪冰期和间冰期的反复交错对现代生物区系的地理分布格局和遗传结构产生了极为深刻的影响。这些影响可能随地区不同而不同,随物种不同而不同,很大程度上取决于有机体的适应性(比如环境耐受性...
- 周天和刘金龙郭宪光
- 新疆天山以北发现爬行动物虫纹麻蜥被引量:2
- 2014年
- 2013年6月,在新疆维吾尔自治区精河县两栖爬行动物多样性调察中,采集到麻蜥属(Eremias)标本20余号,经鉴定其中4号为虫纹麻蜥(E.vermiculata),为该种在新疆维吾尔自治区天山以北地区的首次发现,增加了其在国内的分布点。此发现能为研究虫纹麻蜥的地理分布和生物地理格局提供基础资料。
- 刘金龙原秀云周天和李大江Tatjana N.Dujsebayeva郭宪光
- 爬行动物MHC基因研究进展被引量:1
- 2014年
- 主要组织相容性复合体(MHC)是有颌脊椎动物中发现的编码免疫球蛋白受体的高度多态的基因群,因其在免疫系统中的重要作用而备受关注。脊椎动物不同支系间MHC的结构和演化差异较大。尽管MHC基因特征在哺乳类、鸟类、两栖类和鱼类中已被较好地描述,但对爬行动物MHC的了解仍较少。鉴于爬行动物对于理解MHC基因的演化占据很重要的系统发育位置,研究其MHC具有重要意义。本文就近年来爬行动物MHC的分子结构、多态性维持机制、功能和主要应用的研究现状进行了系统地回顾和总结,并展望了其研究前景。
- 原秀云刘金龙李大江郭宪光
- 关键词:基因爬行类
- 快步麻蜥谱系遗传分化和群体历史动态与亚洲中部干旱区时空演化的关系
- 亚洲中部干旱区(Arid Central Asia)位于欧亚大陆核心区,是世界上最大和最典型的干旱地区,也是世界干旱区生物多样性的关键区域。其干旱化起源、演化与青藏高原隆升、副特提斯海消亡和全球变冷等相关。
- 刘金龙Tatjana N.Dujsebayeva周天和Marina Chirikova龚雄郭宪光
- 关键词:生物多样性保护
- 新疆博乐和伊犁河谷敏麻蜥的种下分类地位探讨被引量:1
- 2018年
- 敏麻蜥Eremias arguta是麻蜥属Eremias在欧亚大陆分布最广的物种之一,主要栖息在欧洲东部和亚洲中部,从罗马尼亚到蒙古国和中国西部的干旱草原和半荒漠中。先前认为敏麻蜥有6个亚种,我国分布有2个亚种,由于种群间形态变异较大,一些亚种的分类地位尚有争议。本研究采用形态比较和基于线粒体细胞色素b基因序列的分子系统发育分析,对新疆博乐和伊犁河谷的敏麻蜥4个种群28号样本进行种下分类地位探讨。联合GenBank中的敏麻蜥细胞色素b基因序列,采用最大简约法、最大似然法和贝叶斯推断法构建系统发育树进行亚种界定。采用贝叶斯因子,通过比较限制性和非限制性贝叶斯树的拓扑结构检验有关敏麻蜥亚种分类的几种相互竞争的假设。结果表明,博乐种群的形态特征与伊犁河谷支系一致,雄性的背侧在繁殖季节有醒目的蓝色或绿色眼点。系统进化树也表明,来自博乐的单倍型属于伊犁河谷支系,为一个尚未描述的分类群Eremias arguta ssp.。以往有关伊犁河谷种群属于指名亚种E.a.arguta或东方亚种E.a.potanini或乌兹别克斯坦亚种E.a.uzbekistanica的观点均被显著拒绝。伊犁河谷支系最有可能与乌兹别克斯坦亚种和伊塞克湖亚种E.a.darevskii二者构成的支系形成姐妹群,但并没有强的证据拒绝备择假说,即伊犁河谷支系位于树的基础位置,与其余支系形成姐妹群。此外,重建的系统发育树中指名亚种与东方亚种形成了交互单系,尽管自展支持率很低且后验概率不高;其备择假设,即东方亚种嵌在指名亚种支系中,也没有很强的证据拒绝。总之,博乐种群不属于东方亚种,而属于一个单独的伊犁河谷支系,同时,这也是伊犁河谷支系在准噶尔盆地有分布的新纪录;伊犁河谷支系不应该被划分为指名亚种、东方亚种或乌兹别克斯坦亚种,而是属于尚未描述的新亚种;伊犁河谷支系的�
- 龚雄刘金龙周天和周天和郭宪光
- 关键词:伊犁河谷种下分类形态学细胞色素B基因分子系统发育
- 3种麻蜥MHC I类基因外显子3和外显子4序列特征被引量:1
- 2014年
- 主要组织相容性复合体(Major histocompatibility complex,MHC)是有颌脊椎动物基因组中的一个高度多态性的基因家族,与免疫系统密切相关,MHC基因特征在哺乳类、鸟类、两栖类和鱼类中已被较好地描述.为了解爬行动物MHC基因的序列特征,通过PCR技术从胎生种密点麻蜥(Eremias multiocellata)、荒漠麻蜥(Eremias przewalskii)及卵生种山地麻蜥(Eremias brenchleyi)的肝脏中克隆了MHC I类基因外显子3和4的DNA片段,采用RT-PCR(逆转录-PCR)从这3种麻蜥的妊娠期子宫组织克隆了这两个外显子的cDNA片段.结果表明,3种麻蜥MHC I类基因均发生基因重复,密点麻蜥和山地麻蜥至少有4个基因座位,荒漠麻蜥至少有5个基因座位.在山地麻蜥获得的其中一条DNA片段中编码氨基酸的密码子突变为终止密码子,推测其为MHC I类基因的假基因.在外显子3编码的α2结构域中检测到多个多肽结合位点和β-2微球蛋白结合位点以及一个保守的半胱氨酸位点.在外显子4编码的α3结构域中检测到多个β-2微球蛋白结合位点和CD8分子结合位点以及一个保守的半胱氨酸位点.基于氨基酸的系统发育分析提示3种麻蜥的子宫均表达经典的MHC I类基因,可能有一些MHC基因座位未在子宫中表达.DNA系统发育重建揭示3种麻蜥MHC I类基因谱系没有表现出物种特异性进化,而表现出跨种多态性.上述结果为进一步研究胎生繁殖方式与母体免疫系统的协同进化及有鳞目MHC的演化奠定了基础.
- 原秀云刘金龙曾晓茂郭宪光
- 关键词:主要组织相容性复合体外显子基因重复麻蜥
- 基于Roche 454 GS FLX高通量测序的叶城沙蜥基因组微卫星特征分析被引量:5
- 2019年
- 叶城沙蜥Phrynocephalus axillaris是我国特有的一种小型爬行动物,广泛分布于新疆塔里木盆地、吐鲁番-哈密盆地和甘肃敦煌盆地。本研究利用Roche 454 GS FLX高通量测序技术进行叶城沙蜥微卫星位点筛选,获得了91 190条高质量序列。用Krait搜索微卫星位点,共得到1~6个碱基重复类型的完美型微卫星序列29 890个。不同类型微卫星中,单碱基重复类型数目最多,有14 630个,占总数的48. 95%,其次是二碱基,约占28. 60%,四碱基、三碱基、五碱基和六碱基分别占10. 73%、10. 48%、0. 92%和0. 32%。二碱基微卫星中AC重复类型数量最多,三碱基、四碱基、五碱基和六碱基中分别是ATC、AAAT、AAAAT和AATCCC。叶城沙蜥完美型微卫星中数量最多的11种重复拷贝类型分别为C、A、AC、AG、AAAT、ATC、AT、AAT、ATAG、AGG和AAC。本研究深化了对叶城沙蜥基因组的了解,并为以后开发和筛选大量高质量微卫星标记提供了数据支持,也为利用微卫星标记研究叶城沙蜥种群遗传结构和谱系地理模式奠定了基础。
- 宋琪刘金龙郭宪光
- 关键词:基因组序列微卫星
- 亚洲中部干旱区快步麻蜥谱系遗传分化和群体历史动态
- <正>本研究采用线粒体DNA cyt b和12S rRNA基因序列分子标记,对亚洲中部干旱区快步麻蜥Eremias velox的分子系统地理学模式进行了分析,并将其与干旱区的地质历史和更新世冰期引起的环境气候变化相关联,...
- 刘金龙周天和龚雄曾晓茂郭宪光
- 文献传递