杨雪莲
- 作品数：7 被引量：4H指数：1
- 供职机构：南京工业大学生物与制药工程学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学理学轻工技术与工程更多>>
- 酿酒酵母糖酵解途径中酶量变化对乙醇浓度影响的模拟分析
- ＜正＞在高通量技术盛行的今天,数据的获得已经不是一个难以逾越的鸿沟,面对着天文数字般的数据,传统的技术手段已经力不从心,换一种新的思路和新的方法才能更有效的从中获得有价值的信息。代谢组通常是指一个细胞,组织或物种内所有代...
- 孔德翀杨雪莲严明柳常青许琳
- 文献传递
- 酿酒酵母蛋白质组双向电泳样品制备方法的建立与优化
- ＜正＞随着后基因组时代的到来,蛋白质组研究越来越受到国内外科学工作者的密切关注,它已成为目前国际上的前沿和热点领域。蛋白质组研究是对基因组研究的重要补充,它是对生物体在蛋白质水平定量、动态、整体性的研究。蛋白质组研究最有...
- 柳常青杨雪莲严明孔德翀许琳
- 文献传递
- 六种工业微生物代谢网络的解析
- 利用系统生物学的方法和手段研究微生物是目前生命科学的前沿及热点之一。本文利用相关系统生物学软件和数据库,整合恶臭假单胞菌、谷氨酸棒杆菌、乳酸乳球菌、枯草芽孢杆菌、运动单胞菌、嗜热球细菌六种常见工业微生物的代谢模块并分别构...
- 杨雪莲王成涛孙宝国严明
- 关键词：代谢网络工业微生物拓扑性质网络特性系统生物学
- 文献传递
- 几种重要工业微生物代谢网络的构建与分析
- ＜正＞系统生物学是近年来兴起的一门尖端学科,它是在细胞、组织、器官和生物体整体水平研究结构和功能各异的各种分子及其相互作用,并通过计算生物学来定量描述和预测生物功能、表型和行为。后基因组时代的一个重要挑战就是从系统生物学...
- 杨雪莲唐雯
- 关键词：代谢网络系统生物学工业微生物
- 文献传递
- AspC基因导入前后E·coli BL21蛋白质组的解析被引量：1
- 2005年
- 为了考察表达天冬氨酸转氨酶工程菌在转基因前后蛋白质水平的差异变化,采用固相pH梯度-SDS聚丙烯酰胺双向凝胶电泳对转基因前后的大肠杆菌(E.coliBL21)的总蛋白进行分离,银染、显色后,使用2D蛋白质图象分析系统Image Master 2D Platinum 5.0和SWISS-2D PAGE蛋白质组数据库对双向电泳图谱进行分析,识别了近600个蛋白点,比较分析了与苯丙氨酸合成途径相关的关键蛋白的差异,初步探讨了AspC基因的导入后大肠杆菌蛋白质水平的精细调控。
- 杨雪莲严明许琳方志翔
- 关键词：双向凝胶电泳蛋白质组天冬氨酸转氨酶大肠杆菌
- 酿酒酵母糖酵解途径中酶量变化对乙醇浓度影响的模拟分析被引量：3
- 2007年
- 代谢组学是系统生物学的一个重要组成部分,应用相关方法获得了大量的数据。如何处理这些数据以及如何将这些数据与其他组学数据结合起来的问题不容忽视。在酶的反应动力学方程中引入“酶量倍数因子”能够解决其中的部分问题。如果反应动力学方程中酶的量发生变化,只需要改变相应的酶量倍数因子的数值。为了观察酿酒酵母糖酵解途径中酶量变化对乙醇浓度的影响,设定了高低两个酶量水平进行计算机模拟,对应的酶量倍数因子分别为10和0.1。基于计算机模拟结果,使用聚类分析方法,12种酶被分为两类。属于第一大类的四种酶ADH、HK、PFK和PDC,均催化不可逆反应。第二大类8种酶中的6种,ALD、GAPDH、GlcTrans、lpPEP、PGI和TIM均催化可逆反应。第二大类中另外两种酶lpGlyc和PK催化不可逆反应。按照这种方法,代谢组和蛋白质组数据能较容易地结合起来对系统作出较全面的分析。
- 孔德翀杨雪莲严明柳常青许琳
- 关键词：代谢组学酿酒酵母乙醇计算机模拟聚类分析
- 六种工业微生物代谢网络的解析
- 利用系统生物学的方法和手段研究微生物是目前生命科学的前沿及热点之一。本文利用相关系统生物学软件和数据库,整合恶臭假单胞菌、谷氨酸棒杆菌、乳酸乳球菌、枯草芽孢杆菌、运动单胞菌、嗜热球细菌六种常见工业微生物的代谢模块并分别构...
- 杨雪莲王成涛孙宝国严明
- 关键词：代谢网络工业微生物拓扑性质网络特性系统生物学
- 文献传递
