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陈伟

作品数：11 被引量：17H指数：3
供职机构：河北联合大学更多>>
发文基金：国家自然科学基金中央高校基本科研业务费专项资金内蒙古自治区自然科学基金更多>>
相关领域：生物学更多>>

合作作者

文献类型

  • 9篇期刊文章
  • 1篇学位论文
  • 1篇会议论文

领域

  • 11篇生物学

主题

  • 5篇核小体
  • 4篇剪接
  • 3篇蛋白
  • 3篇组蛋白
  • 3篇位点
  • 3篇核小体定位
  • 3篇RNA剪接
  • 2篇支持向量
  • 2篇支持向量机
  • 2篇组蛋白甲基化
  • 2篇向量
  • 2篇向量机
  • 2篇小体
  • 2篇甲基化
  • 2篇剪接位点
  • 2篇二次判别分析
  • 2篇RNA
  • 1篇点预测
  • 1篇芋螺
  • 1篇芋螺毒素

机构

  • 9篇内蒙古大学
  • 3篇河北联合大学
  • 2篇电子科技大学
  • 1篇华北煤炭医学...

作者

  • 11篇陈伟
  • 8篇罗辽复
  • 3篇张利绒
  • 2篇邢永强
  • 2篇林昊
  • 1篇丁辰
  • 1篇袁鲁峰
  • 1篇丁辉

传媒

  • 2篇内蒙古大学学...
  • 2篇生物信息学
  • 1篇生物化学与生...
  • 1篇电子科技大学...
  • 1篇中国生物化学...
  • 1篇生物数学学报
  • 1篇生物物理学报

年份

  • 1篇2015
  • 1篇2013
  • 1篇2011
  • 2篇2010
  • 5篇2009
  • 1篇2007
共 11 条 记 录，以下是 1-10
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排序方式：
核小体定位对RNA剪接的影响及组蛋白变体的识别
真核生物的基因组在细胞中被高度地压缩形成染色质。染色质的基本结构单元—核小体—通过阻断蛋白质因子与DNA的接触,在DNA的转录,复制,修复和重组等过程中发挥着重要的调控作用。此外,核小体中组蛋白变体和常规组蛋白的替换对基...
陈伟
关键词：二次判别分析核小体定位剪接位点组蛋白甲基化
文献传递
表观遗传因素在RNA剪接过程中的作用
2011年
RNA剪接是真核生物基因表达过程中的重要环节,增加了蛋白质的多样性和基因表达的可调节性.日益增多的研究表明,RNA剪接并不是独立的生物过程.RNAⅡ型聚合酶(RNApolymerase-Ⅱ,RNA PolⅡ)、核小体定位和组蛋白修饰等因素都与RNA剪接过程密切相关.阐明RNA PolⅡ、核小体定位和组蛋白修饰等因素在RNA剪接过程中的作用,将为剪接位点的准确识别和剪接调控机制的研究提供新思路.本文综述了RNA PolⅡ、核小体定位和组蛋白修饰等因素对RNA剪接的影响以及它们在RNA剪接过程中的调控作用.
陈伟罗辽复
关键词：核小体定位组蛋白修饰RNA剪接
人类基因组中L1元件及其5′UTR的研究
2007年
讨论了L1在人类染色体中的分布密度与染色体长度以及L1的密度与基因密度之间的关系.发现在大多数染色体上L1的密度和染色体的长度表现为正相关,而L1的密度和染色体中基因的密度表现为负相关;对人类L1的5′UTR进行了详细的研究后,发现在L1元件的5′UTR部分含有许多转录因子结合位点.对基因的转录起始位点上游进行统计分析,发现其中含有大量的L1序列.通过对人类的EST数据库进行BLAST分析,新发现了51条和人类L1 5′UTR相似性较高的EST片断,根据它们分布的组织特异性,说明L1元件可能调控与发育过程有关的基因的表达;最后应用多样性增量的方法对人类和大鼠的L1 5′UTR进行了区分,得到了较好的预测结果,说明大部分L1的5′UTR的调控作用是人类特有的.
陈伟罗辽复张利绒
关键词：L1
肠道病毒71型基因组中小干扰RNA的靶位点预测被引量：1
2009年
肠道病毒71型(EV71)已经在世界范围内有过十多次大的爆发与流行,近年来EV71病毒的流行在亚洲逐渐呈上升的趋势,但是目前尚无有效的治疗措施,因此迫切需要一种治疗EV71的有效药物。本文采用生物信息学的方法,对人类EV71病毒三个不同株型(SHZH03,SHZH98和MS)RNA序列的局域二级结构进行了预测,并从这些病毒株的基因组中分别得到了长度在21～25nt的小干扰RNA靶序列碱基片段。这一结果将有助于治疗EV71药物的开发研究,对预防和控制EV71的爆发和流行也会有重要意义。
陈伟罗辽复
关键词：RNA干扰靶位点
基于特征筛选方法预测不同离子通道活性的芋螺毒素
2013年
芋螺毒素是一种具有丰富序列多样性且富含二硫键的多肽.因其能够特异性地结合离子通道,阻断神经冲动的传递,芋螺毒素又具有极大的潜在药用价值.面对庞大的芋螺毒素种类,需借助理论的手段和方法来进行研究,从而降低实验成本,为实验做出理论指导.本文基于二项式分布结合支持向量机算法对芋螺毒素离子通道活性类型进行了预测,jackknife交叉验证的总体精度和平均精度分别达到87.5%和86.8%.结果表明,本文所建模型能够用于芋螺毒素的离子通道活性预测,为基于芋螺毒素新药物的进一步开发提供帮助和理论依据.
袁鲁峰丁辰郭守辉陈伟林昊
关键词：支持向量机二肽
核小体定位与RNA剪接被引量：7
2009年
根据核小体定位序列和缺失序列的碱基分布特征,应用多样性增量二次判别方法(IDQD)构建模型对这两类序列进行了区分,受试者操作特性曲线下的面积达到了0.958.应用这一模型研究了核小体在人类基因组剪接位点(GT/AG)邻近序列中的分布方式,发现外显子所对应的DNA序列通常倾向参与核小体的形成,并且由它所转录的RNA统计上具有较强的刚性,而剪接位点及其邻近的内含子对应的DNA序列则避免参与核小体的形成,所转录的RNA统计上具有较强的柔性.进一步还发现,DNA序列的核小体定位/缺失和RNA的刚性/柔性具有统计相关性,为从机制上解释为何前体RNA剪接事件与DNA序列中的核小体定位信息有关提供了依据.
陈伟罗辽复张利绒邢永强
关键词：核小体定位剪接位点
细菌σ^(54)启动子序列分析与预测被引量：3
2015年
对实验确定的168条σ54启动子序列进行保守性分析,获得两个保守的区域-24区域和-12区域,均为最保守的功能元件。选取保守性最大的17个保守位点的三联体频数作为参数,引入伪计数构建位置权重矩阵,对168条σ54启动子进行预测,分别从编码区和汇聚非编码区共选取168条序列组成阴性集。使用Jackknife交叉验证法对模型进行检验,整体准确度达到82.0%,为σ54启动子的理论和实验研究提供新信息。
丁辉邓恩泽陈伟林昊
关键词：细菌保守性位置权重矩阵启动子
老鼠基因组盒式外显子和内含子保留型可变剪接位点预测被引量：1
2009年
老鼠和人类基因组的同源性超过90%,老鼠基因组的研究为人类基因组序列研究提供了参考数据.统计分析了老鼠盒式外显子和内含子保留型剪接位点附近的序列保守性特征,并据此分别利用基于多样性指标的支持向量机和二次判别法对老鼠基因组中这两种剪接类型的供体端和受体端可变剪接位点进行了预测.独立检验结果表明,盒式外显子和内含子保留型的供体端和受体端可变剪接位点的预测均能达到较高的识别精度.
邢永强张利绒罗辽复陈伟
关键词：可变剪接支持向量机
酵母基因组中核小体偏好序列的识别被引量：3
2009年
应用多样性增量结合二次判别分析(Increment of Diversity with Quadratic Discriminant analysis,IDQD)方法,对酵母基因组中的核小体强/弱偏好序列进行了识别。10交叉检验的预测成功率超过了97%,受试者操作特性(receiver operating characteristic,ROC)曲线下面积达到了0.99,预测成功率高于现有SVM算法。最后利用构建好的分类器对酵母基因组中三类包含TATA盒基因的起始密码子ATG上游400nt下游100nt区域进行了分析。结果表明,IDQD算法有能力应用于基因组中核小体序列的识别。
陈伟罗辽复
关键词：核小体二次判别分析
Definition and application of RNA structural flexibility
The flexibility of RNA in aqueous solution and crystal form has been studied through molecular dynamics simula...
陈伟罗辽复
关键词：RNA
文献传递
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