韩月彭
- 作品数:33 被引量:26H指数:3
- 供职机构:中国科学院武汉植物园更多>>
- 发文基金:国家苹果产业技术体系建设专项山东省农业良种工程项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学医药卫生更多>>
- 控制苹果果肉有机酸含量的苹果酸转运体基因及其应用
- 本发明公开了一种控制苹果果肉有机酸含量的苹果酸转运体基因及其应用,涉及苹果分子遗传育种领域。基因序列如SEQ ID NO.1所示,其编码的蛋白序列如SEQ ID NO.2所示。其应用是:①根据其序列设计分子标记,用于育种...
- 韩月彭马百全王鲁谷超
- 文献传递
- 过表达MdCBF1基因提高植物抗冷性被引量:1
- 2020年
- 本试验将从‘嘎啦’苹果中克隆的MdCBF1转化到‘王林’苹果愈伤组织和野生型拟南芥幼苗中,进行低温冷处理,观察并比较分析野生型与转MdCBF1材料在成活率和表达量间的差异,以研究MdCBF1基因对植株抗冷性的影响。结果显示,低温处理后,与野生型植株相比,转基因苹果愈伤组织抗冷性更高,转基因拟南芥成活率更高,抗冷性相关基因表达水平更高。可以看出,MdCBF1过表达能够显著提高植株的抗冷性,表明其在植物的冷胁迫响应过程中发挥着重要作用。
- 毕思琦安建平郝玉金芮麟李彤韩月彭由春香
- 关键词:苹果冷胁迫抗冷性
- 用于栽培桃离体芽段组培生根的方法
- 本发明公开了一种用于栽培桃离体芽段组培生根的方法,属于植物快繁及细胞工程领域。本方法包括下列步骤:①培养基配制;②外植体制备;③不定根诱导培养;④不定根伸长生长培养;⑤炼苗与移栽。本发明主要是利用生根培养基和根伸长生长培...
- 韩月彭徐胜利郑蓓蓓赖恩惠
- 蔷薇科苹果、梨和桃RKD转录因子家族比较分析被引量:2
- 2020年
- RKD(RWP-RK domain protein)蛋白是植物中重要且保守的一类转录因子,模式植物拟南芥(Arabidopsis thaliana)中的研究表明其在配子发育与胚胎发生中具有至关重要的作用。基于全基因组公开数据,利用RWPRK保守氨基酸序列模型进行检索,在3种蔷薇科果树苹果(Malus pumila)、西洋梨(Pyrus communis)、桃(Prunus persica)中分别筛选到10个MpRKD、8个PcRKD、4个PpRKD成员。通过比较基因组学分析,对苹果、梨、桃RKD基因的系统进化关系、结构域组成与差异、核酸信号序列与蛋白结构比较进行初步探究。苹果、梨、桃RKD蛋白与拟南芥、蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)RKD蛋白聚类提示存在两类RKD蛋白,即Ⅰ类蛋白与Ⅱ类蛋白,其中Ⅰ类蛋白分为Ⅰ-1~Ⅰ-3三个分支。多序列比对与保守位点分析发现4组RKD已出现分化;在结构域组成上,部分RKD成员(MpRKD5和PcRKD7等)还具有除RWP-RK结构域的其他结构域,同时利用蛋白三维建模比较它们之间的差异,暗示此类蛋白产生亚功能化或新功能化现象。在RKD基因结构组成上,分组内的外显子-内含子模式更为相似,相比于苹果、梨,桃RKD基因外显子数目较少。苹果、梨、桃RKD基因亚细胞定位预测结果显示大部分蛋白位于细胞核中,有些成员可能有细胞质定位;启动子顺式元件分析发现具有组织特异性调控元件,涉及分生组织、胚等;苹果RKD基因电子表达数据也证实此类基因的组织特异表达模式,并且不同基因存在差异。由此推测,蔷薇科3个物种苹果、梨、桃RKD基因功能具有保守性与独特性。
- 王寻张天恩由春香韩月彭王小非郝玉金
- 关键词:系统进化结构域组织特异表达
- 苹果阳离子氨基酸转运蛋白(CAT)的鉴定、比较与表达分析被引量:2
- 2020年
- 阳离子氨基酸转运蛋白(CAT)在植物氨基酸转运与氮素代谢中具有重要作用,重要经济作物苹果中尚未见此类蛋白的相关报道。本文利用生物信息学和分子生物学的方法,对苹果CAT (命名为MdCAT)成员进行鉴定、比较与表达分析。根据拟南芥CAT蛋白序列,在苹果基因组中共鉴定出15个MdCAT成员,它们不均衡地位于8条染色体上。大多数MdCAT具有10个及以上的跨膜区,并具有相似的二级结构组成和三维空间构象。遗传进化树分析表明, MdCAT蛋白分为4组(I、II、III和IV),并且4组成员在保守基序分布上,表现出各自的独特性。电子表达谱分析显示, MdCAT广泛表达于各组织中,尤其在花和果实等表达较高,不同成员稍有差异。在果实发育中, MdCAT3/7/6/14等转录丰度有明显的增加,在果实的氨基酸转运中可能扮演关键角色;休眠芽的表达数据提示,部分MdCAT参与到苹果芽的休眠过程。除此之外,利用实时荧光定量PCR试验,检测了氮素匮乏状态下MdCAT的相对表达,结果表明MdCAT1/6/10/13响应氮饥饿,可能在氮素代谢中发挥重要作用。
- 王寻韩月彭由春香王小非郝玉金
- 关键词:苹果跨膜区蛋白结构
- 一个参与桃果实成熟调控的转录因子PpWRKY14及其应用
- 本发明公开了一个参与桃果实成熟调控的转录因子PpWRKY14及其应用,涉及植物分子生物技术和基因工程技术领域。提供了一个调控桃果实成熟的重要基因PpWRKY14,所述PpWRKY14核苷酸序列如SEQ:NO.1所示。Pp...
- 韩月彭刘玉頔张若西肖雯张巍瀚曹运鹏
- 苹果NF-YA转录因子家族的生物信息学和表达分析被引量:5
- 2021年
- NF-YA是植物中一类保守的转录因子,广泛参与调控植物生长发育与响应胁迫。苹果(Malus pumila)GDDH13高质量参考基因组的释放,为本文NF-YA的全基因组分析提供了基础。基于蛋白同源比对与结构域模型扫描2种生物信息学方法,共筛选出11个苹果NF-YA (MpNF-YA)成员,它们均包含CBFBNF-YA核心保守结构域,亚细胞定位预测都位于细胞核中。MpNF-YA分布于10条染色体上,具有相似的基因组结构与内含子相位组成。结构域序列比较发现,它们的保守域由2个典型区段(A1和A2)构成。遗传进化与保守基序分析表明, 11个MpNF-YA分为3组,且都具有motif 1和motif 2。顺式元件扫描、miRNA预测及表达模式分析暗示MpNF-YA基因受多种调控因素影响,呈现组织差异表达的特点,并且在果实发育与氮饥饿响应等环节起到重要作用。
- 王寻冯资权由春香韩月彭王小非郝玉金
- 关键词:苹果生物信息学遗传进化
- 一种与桃果形性状共分离的染色体倒位及其应用
- 本发明公开了一种与桃果形性状共分离的染色体倒位及其应用,涉及植物分子生物学技术。与桃果形性状共分离的染色体倒位近断点附近核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,远断点附近核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。利用倒位断...
- 韩月彭周晖廖燎郑蓓蓓
- 多花海棠叶绿体基因组分析被引量:4
- 2022年
- 多花海棠(Malus floribunda Siebold.)是世界范围内广泛栽培的苹果属物种,具有较高的观赏价值和育种意义。对其进行叶绿体基因组比较分析,有利于完善苹果属系统进化以及种质利用的研究内容。基于全基因组测序数据,组装获得一个完整的具有四分体结构的多花海棠叶绿体基因组。该基因组包括大单拷贝区(88142 bp)、反向重复区B(26353 bp)、小单拷贝区(19189 bp)与反向重复区A(26353 bp),共计160037 bp。多花海棠叶绿体全基因组共注释到111个基因,包括78个蛋白编码基因、29个tRNA基因和4个rRNA基因。此外,在其基因组中识别到大量的重复序列,与三叶海棠和变叶海棠略有差异。通过计算相对同义密码子使用度,发现其高频密码子共30种,并且密码子具有偏向A/T结尾的使用模式。种间序列比对、边界分析的结果表明,大单拷贝区序列变异较大,8种苹果属植物SC区与IR区扩张收缩情况整体上较为相似。基于叶绿体基因组序列的系统进化分析,将多花海棠、湖北海棠和变叶海棠聚为一类。多花海棠叶绿体基因组的研究可为今后遗传标记开发与种质资源利用等提供数据支持。
- 王寻冯资权王大儒韩月彭王小非沈向由春香
- 关键词:叶绿体基因组系统进化生物信息学
- 一种用于苹果果实糖含量表型筛选的SSR分子标记及其应用
- 本发明公开了一种用于苹果果实糖含量表型筛选的SSR分子标记及其应用。本发明通过基因分型关联糖含量表型数据确定候选分子标记,成功开发了一个SSR分子标记SugarA3。利用SugarA3进行PCR扩增并结合测序确定(AG)...
- 韩月彭彭倩马百全
- 文献传递