姬长虹
- 作品数：2 被引量：33H指数：2
- 供职机构：中国水产科学研究院黑龙江水产研究所农业部北方鱼类生物工程育种重点开放实验室更多>>
- 发文基金：国家科技基础条件平台建设计划更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 用磁珠富集法快速制备银鲫微卫星标记被引量：12
- 2007年
- 将磁珠富集法和用γ-32P标记的放射性探针法相结合,快速制备银鲫Carassius auratus gibelio微卫星。用限制性内切酶MboI对银鲫完整基因组DNA酶切,用不同蔗糖浓度梯度离心收集400-900 bp大小的片段,连接Brown接头,构建银鲫全基因组文库。用生物素标记的（CA）16寡核苷酸探针进行筛选,磁珠富集含有微卫星的DNA单链序列;对DNA模板进行PCR扩增,连接pMD18-T载体,转入用CaCl2制备的感受态大肠杆菌Escherichia coliDH5α中,得到微卫星序列文库;经用同位素γ-32P标记的探针（CA）16二次筛选,获得235个阳性克隆,对其测序,得224个含微卫星序列,完美型、非完美型、复合型序列分别占总数的52.8%、28.7%、18.5%。除探针中使用的（CA/GT）n重复单元外,还观察到（GA/CT）n、（ACTC）4的重复序列。设计163对引物,选择合成30对引物,经聚丙烯酰胺凝胶筛选,9对可以获得清晰条带,其中3对为单态,6对为多态。
- 姬长虹孙效文
- 关键词：银鲫微卫星磁珠富集
- 长江、珠江、黑龙江水系野生鲢遗传多样性的微卫星分析被引量：21
- 2009年
- 采用34个微卫星分子标记，对长江（湘江、监利、枞阳）、珠江、黑龙江（抚远）鲢共5个群体的观测杂合度（Ho）、期望杂合度（He ）、多态信息含量（PIC）和有效等位基因数（Ne）等进行了遗传检测，根据基因频率计算遗传相似系数和Nei氏标准遗传距离，以卡方检验估计Hardy-Weinberg平衡，以近交系数（FST）和基因流（Nm）分析群体的遗传分化。同时，基于Nei氏标准遗传距离获得NJ聚类图。共检测出154个等位基因，其中有80个共有基因。位点等位基因1～9个不等，平均等位基因4.666 7，平均有效等位基因2.948 9。5群体平均观测杂合度为0.329 5～0.461 9，平均期望杂合度为0.500 2～0.552 9，平均多态信息含量为0.443 5～0.493 0。表明5群体为中度多态，遗传多样性较低，且长江不同地理群体的遗传多样性也有差异，但差异不显著。通过群体间遗传相似性和遗传距离比较显示：长江3个群体间遗传相似系数最大，遗传距离最小；黑龙江与长江鲢群体间相似系数较大（平均0.871 8），遗传距离较小（平均0.137 4）表明二者遗传分化亦最小；珠江鲢与长江鲢间的相似系数最小（平均0.831 0），遗传距离最大（平均0.185 2），其遗传分化差异较大，结果未显现出群体间遗传差异的大小与其地理距离远近呈正相关。
- 姬长虹谷晶晶毛瑞鑫朱新平孙效文
- 关键词：微卫星
