李广
- 作品数：2 被引量：6H指数：1
- 供职机构：延边大学农学院更多>>
- 发文基金：国家教育部博士点基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 菌物基因组测定研究进展被引量：5
- 2014年
- 菌物基因组因其相对较小、基因结构较简单、容易被测序和注释、细胞周期短、易于遗传操作等优点而成为真核生物基因组研究的最佳模式生物。文中综述了菌物基因组的结构特点,整理了菌物基因组测序相关信息,并简单描述了重要模式菌物的基因组概况,为进一步开展菌物基因组研究提供重要数据信息。
- 刘淑艳李广李玉
- 关键词：基因组黏菌子囊菌担子菌卵菌
- 盘基网柄菌肌动蛋白的生物信息学分析被引量：1
- 2015年
- 盘基网柄菌Dictyostelium discoideum是目前黏菌中研究最清楚的模式生物,其捕食过程与肌动蛋白的多聚化密切相关。为探讨盘基网柄菌肌动蛋白的序列特征,本研究利用生物信息学方法分析了盘基网柄菌32条肌动蛋白的蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interaction)和可能含有的保守基序。结果表明:盘基网柄菌32条肌动蛋白与其他蛋白存在一组复杂相互作用关系和5组比较简单的相互作用关系;利用MEME SUITE分别分析盘基网柄菌32条肌动蛋白序列的保守基序和与actin17呈最佳匹配的21种生物肌动蛋白的保守基序,结果共获得6个保守基序,即motif1,motif2,motif3,Motif1,Motif2,Motif3。其中motif1,Motif1,Motif3为本研究新发现的保守基序,这3个保守基序可定位于Profilin-actin-VASP202–244(PDB ID:3CHW)三维结构的重要位置。以上结果表明actin3,actin10,actin14,actin15,actin17,actin31可能为盘基网柄菌比较重要的肌动蛋白;motif1,Motif1,Motif3可能是盘基网柄菌肌动蛋白在进化中重要的保守基序。
- 李广刘淑艳李玉陈艳秋
- 关键词：黏菌蛋白相互作用
