查幸福
- 作品数：17 被引量：86H指数：6
- 供职机构：西南大学生物技术学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 家蚕chi、gluE和fruA基因与微生物相应基因的同源性及基因水平转移初探被引量：9
- 2004年
- 通过对家蚕 (Bombyxmori)大规模EST的分析 ,发现家蚕的chi、gluE和 fruA基因分别与微生物的相应基因存在高度的氨基酸序列同源性 ,且进化关系很近 ,但与线虫 (Caenorhabditiselegans)、果蝇 (Drosophilamelanogaster)、按蚊 (Anophelesgambiae)以及家蚕近缘昆虫的类似基因之间的相似性却非常低。这表明它们可能分别与微生物的同源基因具有共同的祖先 ,即微生物的基因水平转移给了家蚕 。
- 程廷才夏庆友刘春赵萍查幸福徐汉福向仲怀
- 关键词：基因水平转移几丁质酶基因系统进化家蚕
- 家蚕母性基因的表达序列标签分析被引量：6
- 2004年
- 为了研究家蚕Bombyxmori卵中储存的母性遗传信息 ,以未受精的肾脏型和正常型蚕卵为材料构建了cDNA文库 ,并对其随机测序 ,共获得 391条表达序列标签 (EST)序列 ,经拼接后得到 374条非重复序列。生物信息学分析发现 ,172个非重复序列与国际数据库GenBank和silkbase中的已知基因具有较高的相似性。除 3个已知母性基因外 ,其余主要与DNA复制、能量代谢、信号转导、转录、蛋白质结构以及胚胎发育中个体形成等相关。
- 邱咏梅夏庆友程道军沈以红刘春林英查幸福向仲怀
- 关键词：家蚕表达序列标签未受精卵胚胎发育
- 家蚕(Bombyx mori)全基因组框架图被引量：1
- 2008年
- 我们在此报告了家蚕(Bombyx mori)的基因组序列框架图,它覆盖了所有已知家蚕基因的90.9%。我们估计的基因数是18510,超过黑腹果蝇报道的13379个基因。我们将家蚕基因组与果蝇、蚊子、蜘蛛和蝴蝶等进行了比较分析,揭示了它们在基因组成上同时具有相似性和差异性。
- 夏庆友周泽扬鲁成程道军代方银李斌赵萍查幸福程廷才柴春利潘国庆许金山刘春林英钱吉凤侯勇吴正理李关荣潘敏慧李春峰沈以红蓝希钳袁联伟李田徐汉福杨光伟万永继朱勇余茂德沈卫德吴大洋向仲怀于军王俊王俊李瑞强石剑萍李恒李光远苏建宁王晓玲李国庆张增金吴清发李俊张庆鹏韦宁徐建哲孙海波董乐刘东源
- 关键词：全基因组框架图家蚕黑腹果蝇基因组成
- 利用转基因蚕改造茧丝品质被引量：7
- 2003年
- 简述了近年来研究人员突破传统育种法的限制,利用转基因蚕改造茧丝品质的研究结果是可以让蚕吐出与蜘蛛丝相类似的丝以及能吐蓖麻丝、银杏大蚕蛾的丝、天蚕丝等家蚕性状的特种丝。
- 查幸福郑慧
- 关键词：转基因蚕茧丝品质基因导入家蚕
- 家蚕27、28号染色体基因的生物信息学分析被引量：2
- 2009年
- 利用家蚕基因组精细图分析第27、28号染色体上的基因结构及其编码蛋白的功能结构域,可为在家蚕资源库中鉴定这两条染色体上的突变基因以及发现新的形态标记提供重要线索。基因预测及结构分析显示:家蚕第27和28号染色体是基因数目最少的两条染色体,预测基因数目分别是241个和288个,平均每个基因分别具有7.7和5.3个外显子;蛋白质全长编码区序列(CDS)长度主要分布于400-800 bp之间;CDS的GC含量分别是49.72%和46.54%。蛋白质功能结构域分析发现,家蚕第27、28号染色体上基因所编码的蛋白分别具有76和92种结构域,其中最多的3种结构域分别为Sugar_tr、MFS_1、zf-C2H2和UDPGT、DUF、Serpin。将家蚕第27、28号染色体上的预测基因与果蝇突变基因进行同源检索的结果显示,家蚕第27、28号染色体上分别有16和15个基因具有明显的可能突变表型。
- 段彪查幸福沈以红代方银夏庆友向仲怀
- 关键词：家蚕突变基因生物信息学
- 家蚕（Bombyx mori）性别决定网络及其关键基因BmSxl的cDNA克隆和功能研究
- 家蚕性别决定研究既具有模式研究的科学意义，又具有重要的产业价值，因而一直是蚕业科学的一个重大课题。经典遗传学研究推测家蚕W染色体上Fem基因为家蚕性别决定初级信号，最近家蚕性别决定的下游调控基因Bmdsx也已鉴定。然而，...
- 查幸福
- 关键词：家蚕性别决定同源基因选择性剪接
- 文献传递
- 昆虫性别决定的分子机制研究进展被引量：10
- 2006年
- 模式昆虫果蝇的性别决定是由一系列基因通过级联形式调控的,其中Sxl是果蝇性别决定的关键基因,调控体细胞性别决定、剂量补偿和种系分化。目前的研究表明,果蝇性别决定级联X∶A>Sxl>tra>dsx在昆虫中是部分保守的。性别决定的研究是人们进行昆虫性别控制的基础,阐明其分子机制将使人们更有效地防治害虫和利用益虫。
- 查幸福夏庆友向仲怀
- 关键词：昆虫性别决定基因
- 与家蚕细胞凋亡相关的Caspase基因BmIce的克隆和序列分析被引量：13
- 2005年
- DrIce基因在果蝇的细胞调亡代谢途径中起着重要作用。采用tblastn程序将DrICE在家蚕EST数据库中进行同源性检索,检索到的EST序列进行电子延伸,根据延伸结果设计引物,用RT-PCR检测和克隆测序验证,成功地克隆到家蚕第二种Caspase基因的全长cDNA(GenBank登录号为:AY885228)。克隆的cDNA长1410bp,ORF长825bp,编码275个氨基酸残基,预测分子量为31.8kD,等电点为6.15,基因名定为BmIce。将BmIce的cD-NA与家蚕基因组序列进行比对,结果表明该基因具有6个外显子,外显子/内含子边界处均符合GT-AG规则。BmICE在氨基酸水平上与果蝇DrICE、线虫的CED-3的一致性分别为34%和29%,在第169个氨基酸残基处具有QACRG的五肽活性位点,该活性位点是Caspase家族的典型结构。与果蝇Caspase家族聚类分析中,BmICE与果蝇中具有短的N端结构域的DrICE、DCP-1及DECAY聚为一类,根据其结构分析和聚类分析,推测家蚕BmIce基因可能参与细胞凋亡的执行作用。
- 段军朱虹查幸福赵萍夏庆友
- 关键词：细胞凋亡CASPASE家蚕
- 家蚕和野桑蚕脂肪酸脱氢酶desat4全长cDNA和启动子的克隆及其原核表达被引量：2
- 2012年
- 【目的】获得家蚕Bombyx mori和野桑蚕Bombyx mandarina脂肪酸脱氢酶基因desat4的cDNA及其启动子序列,并应用原核表达系统获得目的蛋白质,为进一步研究该基因的功能提供基础。【方法】利用RACE技术克隆家蚕和野桑蚕desat4基因全长cDNA序列,基于家蚕全基因组序列设计引物克隆它们的启动子,并采用原核表达技术对该基因进行异源表达。【结果】克隆得到家蚕与野桑蚕desat4基因全长cDNA,长度分别为1717 bp和1718 bp,ORF长度为1059 bp,编码352个氨基酸残基,结构上有3个组氨酸保守区和4次跨膜结构域,说明该蛋白质是膜蛋白。同源性分析发现Desat4氨基酸序列与烟草天蛾Manduca sexta MsexKPSE脱氢酶拥有88.9%相似性。克隆获得的家蚕和野桑蚕desat4基因启动子序列长度分别为1808 bp和870 bp,该区域包含有热休克因子HSF(heat shock factor)结合位点、NIT2结合位点和CdxA(caudal type homeobox transcription factor A)结合位点等等,并未发现有典型的TATA-box,但在靠近5'-UTR区域发现了转录起始因子特征序列。时期表达谱分析显示desat4基因从刚产下卵到成虫(蛾)的36个不同发育时间点都有持续稳定的表达。应用原核表达系统成功地表达了Desat4蛋白质,并用温和变性剂十二烷基-β-D-麦芽吡喃糖苷(dodecy l-β-D-maltoside,DDM)就能很好地促进该蛋白质的溶解。【结论】本研究成功地克隆了家蚕和野桑蚕desat4基因全长cDNA及其启动子序列并进行了序列比对分析,构建了desat4基因的原核表达载体并成功表达,为进一步研究该基因的功能提供参考。
- 陈全梅程道军马振刚胡晓明查幸福赵萍
- 关键词：家蚕野桑蚕脂肪酸脱氢酶全长CDNA启动子原核表达
- 家蚕脂肪体组织基因表达谱的研究 Ⅰ.家蚕5龄中期幼虫脂肪体组织基因表达分析被引量：13
- 2004年
- 以大规模EST测序为基础 ,用生物信息学方法分析了家蚕 5龄 3d脂肪体组织基因表达的特征 ,共获取脂肪体组织EST 12 72 1个。经Phrap程序拼接得到 2 316个非冗余序列 ,其中包括 82 4个contigs,14 92个singletons。在鉴定出的已知基因中 ,基因表达频率有明显差异 :物质代谢相关基因表达量最高 ,占总量的 5 8 2 % ;其次为转录翻译调节相关基因和酶类基因 ,分别占 15 5 %和 14 5 %。在高量表达基因中 ,有贮藏蛋白、蛋白酶抑制剂、类IDGF蛋白、抗菌蛋白、谷胱甘肽 S转移酶等。结果表明 ,脂肪体组织基因表达的种类很多 ,特征明显 ,与脂肪体在蚕体内的贮藏功能、蛋白质合成功能、代谢调节功能以及变态发育有密切关系。
- 沈以红程道军查幸福夏庆友向仲怀
- 关键词：家蚕基因表达谱表达序列标签
