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田瑞: 作品数：19 被引量：64H指数：4; 供职机构：中国医学科学院北京协和医学院基础医学院基础医学研究所更多>>; 发文基金：国家自然科学基金北京市自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>; 相关领域：医药卫生生物学更多>>

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一种验证性筛选目的结构域结合配体的方法: 本发明公开了一种验证性筛选目的结构域结合配体的方法。该方法包括以下步骤：1)以目的结构域家族中结合特性有代表性的成员为诱饵蛋白筛选酵母双杂交文库；2)收集步骤1)筛选获得的结合配体克隆以及其它已知或可能的目的结构域结合配...; 高友鹤宋婀莉高诗娟田瑞马素参黄海明; 文献传递

生长抑素经血管灌流大鼠离体胃抑制胃运动被引量：1: 1994年; 采用血管灌流大鼠离体胃制备，探讨生长抑素对胃运动的影响。结果表明：（１）生长抑素能抑制胃窦自发和胃动素兴奋的胃运动；（２）生长抑素可抑制离体胃内源性胃泌素释放；（３）抗生长抑素血清或前列腺素合成酶抑制剂消炎痛可阻断生长抑素对胃窦运动的抑制作用。上述结果提示：生长抑素的抑制作用除通过直接作用于生长抑素受体外，还可能部分通过胃窦局部前列腺素介导来抑制胃的运动。; 田瑞周洁周吕; 关键词：胃运动生长抑素前列腺素

通过筛选随机多肽文库研究Veli3 PDZ结构域配体结合特性被引量：1: 2009年; 目的研究Veli3 PDZ结构域配体的结合特性。方法用Veil3 PDZ为诱饵蛋白,用酵母双杂交方法筛选随机多肽文库。结合生物信息学方法在各种数据库中检索与Veli3 PDZ识别规律相符合的天然人类蛋白质。然后根据蛋白质的功能和细胞定位等性质选择14个潜在新配体用酵母双杂交验证相互作用。文献检索与Veli3 PDZ配体结合的其他PDZ蛋白。结果Veli3 PDZ结构域配体C-末端保守的氨基酸序列通式可以表示为:[E/X][S/T]X[V/I/L]-COOH(X表示任意氨基酸)。这是ClassⅠPDZ结构域配体的特点。用酵母双杂交实验证实14个生物信息方法预测的潜在配体中有6个配体与Veli3相互作用。另一个PDZ蛋白PSD-95与已报道的Veli3 PDZ配体和本研究新发现的潜在配体有多个相互作用。结论新发现的6个Veli3PDZ潜在配体为进一步研究Veli3的生物学功能提供新的线索。另外Veli3与PSD-95可能易于同时竞争结合同一配体,其生物学意义还有待进一步研究。; 田瑞马素参杨涛高友鹤; 关键词：蛋白质相互作用 PDZ结构域酵母双杂交生物信息学

PDZ结构域低丰度配体的筛选方法: 低丰度配体的筛选是研究蛋白质相互作用连锁图的一个难点,本研究旨在改进以往的研究方法,建立更加有效的筛选低丰度配体的平台。PDZ结构域是一种重要的蛋白质相互作用结构域,在蛋白质定位、信号转导和蛋白复合体的组装等方面发挥重要...; 宋婀莉田瑞马素参高友鹤; 文献传递

通过筛选随机多肽文库研究ZO-1中PDZ1结构域的配体结合特点被引量：1: 2006年; 选择ZO-1的PDZ1结构域作为研究对象,以酵母双杂交为筛选系统,筛选随机多肽文库和与其它PDZ结构域的配体进行相互作用,阐明ZO-1PDZ1的配体结合特性.ZO-1PDZ1识别配体C末端保守的氨基酸序列通式可以表示为[S/T][F/Y/W][V/I/L/C]-COOH、[S/T][K/R]V-COOH、V[F/Y/W][L/C]-COOH、EYV-COOH.研究发现ZO-1PDZ1的配体同时具有3种传统PDZ结构域配体的特点,不同的是其结合配体-1位对芳香族氨基酸具有强烈的偏好性.并且某些PDZ结构域配体的-1位和-3位对结构域与配体相互作用的特异性和亲和力有重要的作用.随后通过生物信息学的方法在Swiss-Prot数据库找到与此识别规律相符合的天然人类蛋白质.根据蛋白质的功能和细胞定位等性质选择10个配体用酵母双杂交验证相互作用.证实的相互作用配体有4个.本研究希望用这样的研究策略建立一种有效的研究蛋白质相互作用的方法,通过在全蛋白质组规模上对含有结合配体保守氨基酸序列的蛋白质的查询,理论上可以找到现有数据库中所有可能与目的结构域结合的潜在配体蛋白,特别是那些筛选cDNA文库不容易获得的低丰度配体.; 田瑞李英娜宋婀莉高诗娟黄海明张玲马素参高友鹤; 关键词：蛋白质相互作用 PDZ结构域酵母双杂交

验证性筛选PDZ结构域结合配体文库快速研究HtrA2/Omi PDZ结构域的结合特性被引量：2: 2007年; HtrA2/Omi是一种线粒体丝氨酸蛋白酶,在哺乳动物细胞中具有双重功能,即诱导细胞凋亡和参与维持线粒体活性的动态平衡.PDZ结构域是最重要的蛋白质相互作用结构域之一,参与多种生物学过程,如细胞信号转导、蛋白质降解、细胞骨架组织等.最近研究发现,HtrA2/Omi蛋白的PDZ结构域与配体的相互作用,可以调节HtrA2/Omi蛋白自身的水解酶活性.以HtrA2/Omi PDZ结构域为研究对象,用酵母双杂交系统验证性筛选PDZ结构域结合配体文库,快速研究该结构域的结合特性,并在人类全蛋白质组范围内预测并发现该结构域新的相互作用蛋白,最后分析这些新的相互作用所能够形成的最小相互作用网络来评估其可信度.研究结果揭示了HtrA2/Omi PDZ结构域新的结合特性,即:不仅能够结合已报道的II类PDZ配体而且还可以结合I类和III类PDZ配体,并且配体-3位氨基酸具有一定范围内的可变性.而且,发现了7个新的HtrA2/Omi PDZ结构域相互作用蛋白,为进一步阐明HtrA2/Omi蛋白的生物学功能提供了重要线索.同时证明了验证性筛选目的结构域结合配体文库,这一结构域结合特性研究新策略的实用性和高效性.; 马素参宋婀莉高诗娟田瑞高友鹤; 关键词：PDZ结构域蛋白质相互作用生物信息学