金晔
- 作品数:8 被引量:45H指数:3
- 供职机构:上海市血液中心更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学更多>>
- PCR-SSP在HLA低分辨中常见问题及解决措施被引量:4
- 2007年
- 目的探讨PCR-SSP在HLA低分辨分型中常见问题的原因,提出解决的措施。方法应用盐析法提取基因组DNA,用PCR-SSP法对参加造血干细胞资料库志愿者的血样进行HLA分型,琼脂糖凝胶电泳后紫外光灯下分析判读,并进行统计学分析。结果在4800份血样标本中,4187份标本能够准确判读出结果,检出率为87.2%,其余613份样本无法判读出确定的基因型。在这613份血样标本中所遇到的问题包括有漏检占41.9%(其中单孔漏检多达90.2%);假阳性及非特异性所占比例也较大,为29.2%;模棱两可的结果所占比例为23.2%;人为因素影响分析的占4.4%;仪器因素影响分析的占1.3%。结论SSP法用于HLA分型时,有99.5%问题可找到其原因所在,并通过相应的方法加以解决。
- 孙瑛傅敏金晔谢军华季芸杨剑豪杜可明
- 关键词:HLAPCR-SSP假阳性
- 慢性粒细胞白血病和HLA基因的关联性研究
- 目的探讨慢性粒细胞白血病与HLA等位基因多态性的遗传相关性。方法采用PCR-SSOP分型技术对266 位慢粒病人进行HLA-A,B,DRB1基因分型,并以9996位上海骨髓库志愿捐献造血干细胞的健康供者作为对照,对 2组...
- 季芸杨剑豪傅敏杜可明孙瑛孙继丽金晔谢军华嵇月华张铮毛臻
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- PCR-SSP在HLA低分辨中常见问题及解决措施
- 目的探讨PCR-SSP在HLA低分辨分型中常见问题的原因,提出解决的措施。方法应用盐析法提取基因组 DNA,用PCR-SSP法试剂盒对参加造血干细胞资料库志愿者的血样进行HLA分型,琼脂糖凝胶电泳后紫外光灯下分析判读,并...
- 孙瑛杜可明傅敏金晔谢军华季芸张铮杨剑豪孙继丽嵇月华毛臻
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- 20596名汉族造血干细胞供者HLA多态性分析
- 目的分析中国汉族人群中人类白细胞抗原(HLA)- A,B,DRB1基因和单体型频率分布特征。方法采用聚合酶链反应-序列特异性引物和序列特异性寡核苷酸探针技术,对20596例健康汉族无关供者进行HLA基因分型,并翻译为相应...
- 孙继丽杜可明傅敏孙瑛金晔谢军华季芸杨健豪稽月华张铮毛臻刘达庄钱开诚
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- 20596名汉族造血干细胞供者HLA多态性统计学分析被引量:20
- 2006年
- 目的了解中国汉族人群中HLA-A,B,DRB1基因和单体型频率分布特征。方法采用聚合酶链反应-序列特异性引物和序列特异性寡核苷酸探针技术,对20596名健康汉族无关供者进行HLA基因分型,并翻译为相应的抗原特异性;采用最大数学预期值算法(expectation-maximization,EM)计算HLA基因和单体型频率,并统计相关的遗传参数。结果20596名汉族无关供者中,频率>0.1的A、B、DRB1座位特异性分别为A2、A11、A24,B46、B13、B60,DR9、DR12、DR4、DR15;频率>0.05的A-B、B-DRB1单体型为A2-B46、A33-B58、A30-B13、B46-DR9、B13-DR7,频率>0.03的A-B-DRB1单体型为A30-B13-DR7、A2-B46-DR9、A33-B58-DR17;频率>7.27×10-5的有意义两座位单体型中,A30-B13、A69-B52、A33-B58、B8-DR17连锁不平衡强度最高(RLD>0.8)。结论中国汉族人群HLA基因和单体型多态性较为丰富,其频率分布数据和相关遗传参数为临床移植供者的选择、资料库志愿者招募策略的制定提供了重要参考。
- 孙继丽杜可明傅敏孙瑛金晔谢军华季芸杨健豪稽月华张铮毛臻刘达庄钱开诚
- 关键词:汉族人群基因频率单体型频率PCR-SSOP
- HLA-A,B,DRB1单体型频率计算及其在骨髓库中的应用被引量:21
- 2005年
- 目的从群体资料计算HLAA,B,DRB1三座位单体型频率,并用于骨髓库寻找HLA匹配供者。方法根据HLA表型群体资料,使用最大数学预期值算法(ExpectationMaximization,EM)计算HLA三座位单体型频率。通过实例运算介绍HLA表型频率以及发现HLA匹配无关供者的概率。结果①使用DNA基因分型技术鉴定12193例无关汉族健康个体HLA表型,计算求得HLAA,B,DRB1单体型频率。②预期概率与观察结果吻合,并用于评估骨髓库的最适大小。结论使用EM算法估计大样本汉族群体HLAA,B,DRB1三座位单体型频率,结果可靠,可用于评估骨髓库的最适大小和组份。
- 孙继丽杜可明傅敏季芸谢军华孙瑛金晔杨剑豪稽月华刘达庄钱开诚赵桐茂
- 关键词:EM算法
- HLA-A、B血清学分型与基因分型结果的比较
- 目的分析血清学分型和基因分型对HLA-A、B分型结果的差异。方法采用PCR-SSO方法对需骨髓移植的病人进行HLA-A、B基因分型,同时用微量淋巴细胞毒试验进行血清学分型。结果 691例样本中有88例血清学分型与PCR-...
- 傅敏杜可明季芸杨剑豪嵇月华孙继丽孙瑛金晔张铮谢军华
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