陈宏彬
- 作品数：22 被引量：100H指数：6
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- 2018-2019年福建省禽类外环境H5亚型禽流感病毒分子特征和遗传进化分析
- 2023年
- 目的分析2018-2019年福建省禽类外环境H5亚型禽流感病毒的分子特征和遗传进化特点,为禽流感防控提供参考依据。方法对2018-2019年福建省禽类外环境H5亚型单阳性标本进行复核,筛选出Ct值小于30的标本,对HA和NA基因进行靶向扩增和二代测序,从NCBI和GISAID数据库下载参考序列,使用生物信息学软件分别对HA和NA基因进行分子突变位点和遗传进化分析。结果共完成12株H5亚型HA和NA全基因测序。序列比对结果显示,HA基因最高一致性在98.59%~99.89%,NA基因最高一致性在98.19%~99.85%。遗传进化分析显示,HA基因归属于Clade 2.3.4.4h分支,NA基因归属于欧亚谱系H5N6和H6N6分支。12株毒株的裂解位点均为高致病性禽流感病毒分子特征,受体结合位点为禽源受体,但S123P、S133A、I151T、T156A突变可增强病毒与人源受体的亲和力。HA基因糖基化位点分析显示,常见154位糖基化位点缺失,在124位(-NHTS)新增潜在糖基化位点。结论2018-2019年福建省禽类外环境中存在Clade 2.3.4.4h进化分支H5N6高致病性禽流感病毒,并且N6基因在进化上具有多样性,提示基因进化重组的可能,需加强对病毒分子进化的持续监测。
- 吴晶晶陈宏彬林琦张炎华鄢育青翁育伟
- 关键词：禽流感病毒遗传进化
- 一株达菲耐药的甲型H1N1流感病毒全基因特征分析被引量：9
- 2016年
- 目的分析1株甲型H1N1流感达菲耐药病毒株的全基因特征,为指导流感临床治疗与防控提供依据。方法采用鸡胚进行病毒分离,提取病毒RNA,通过RT-PCR扩增其全基因组8个基因片段,测定核苷酸序列,利用生物信息软件拼接全基因组序列,绘制基因进化树并分析重要基因位点变异情况。结果 A/Fuzhou/SWL11609/2013(H1N1)流感毒株的8个节段基因均处于2013-2014年度进化簇中,且与A/California/07/2009(H1N1)疫苗株高度同源,8个基因同源性均在97.4%以上;其HA和NA基因与A/Hubei-Wuchang/SWL1322/2013(H1N1)达菲耐药株同源性最高,分别为100.0%和99.6%;初步判断该毒株未发生重配现象,其重要致病性基因位点未发生变异;NA基因中具有H275Y典型达菲耐药位点特征,缺失一个糖基化位点(N386K),降低了基因结构的稳定性,同时在V241I和N369K的作用下降低了病毒的适应性。结论本次研究的甲型H1N1流感达菲耐药病毒株表现为低致病性流感病毒特征,但具备较好的人传人能力,需进一步加强监测,谨防耐药株的广泛流行。
- 谢剑锋张炎华赵琳修文琼陈宏彬翁育伟郑奎城
- 关键词：甲型H1N1流感病毒
- 2014-2016年福建省H3N2亚型流感病毒血凝素基因特征分析被引量：3
- 2018年
- 目的了解2014—2016年福建省H3N2亚型流感病毒血凝素(HA)基因特征及其变异情况。方法随机选取44株病毒,对病毒的HA基因进行扩增和测序;然后利用生物信息学软件和在线分析网站对序列进行拼接、校对、相似性与差异性比较以及基因进化树构建等基因特征分析。结果44株H3N2亚型流感病毒HA基因核苷酸相似性在97.3%-100.0%之间,2014年、2015年与2016年流行株与对应疫苗株之间的平均基因差异分别为0.012、0.008和0.009。2014年流行株的基因型为3C.3a,与疫苗株3C.1不同,2015年与2016年流行株与疫苗株的基因型相同,但其抗原表位、受体结合位点和糖基化位点发生了变异。结论2014-2016年福建省H3N2亚型流感病毒逐年发生变异,显示出逃避疫苗免疫作用的能力,应加强流感监测,以及时发现变异情况,为流感防控提供科学依据。
- 张炎华陈宏彬赵琳修文琼谢剑锋翁育伟郑奎城
- 关键词：H3N2亚型流感病毒血凝素基因特征
- 美国《Emerging Infectious Diseases》2014年第4期有关人兽共患病论文摘译
- 2014年
- P532 1997年3月-2011年5月非洲感染的与旅行相关疾病的区域差异／／Marc Mendelson，Pauline V．Han，Peter Vincent，等
为了解非洲不同地区感染的与旅行相关疾病的区域差异，我们采用监测网络数据库分析了14年间从非洲返回的患病旅客16893例。结果显示，到非洲北部的旅客最常见的是胃肠道疾病和狗咬伤。与其它地区相比，从撒哈拉以南地区返回的旅客中发热性疾病更常见。11名死亡旅客中有9个死于疟疾，
- 陈宏彬翁育伟
- 关键词：DISEASES人兽共患病论文摘译相关疾病
- 2014年福建省南平市登革病毒E基因序列分析被引量：9
- 2016年
- 目的测定2014年南平市登革暴发相关登革病毒E基因序列,探讨其输入来源及基因型别。方法将患者急性期血清接种C6/36细胞,分离登革病毒,通过RT-PCR进行血清型鉴定,扩增全长E基因,测定序列并绘制系统进化树。结果共分离到4株DENV-1,2株DENV-2,扩增并测序获得E基因全长序列,4株南平地区DENV-1型分离株之间同源性为100%,与D13459(Donguang)分离株同源性也高达99.7%;2株DENV-2型分离株与DENV2/CN/GZ05/2014分离株的同源性均达100%。系统进化分析发现,4株DENV-1病毒株与来自广东及印度的毒株处于同一进化树分支,均为基因Ⅴ型;2株DENV-2病毒株与来自广东及新加坡的毒株处于同一进化树分支,均为基因Ⅳ型。结论福建省南平市本次登革热本地病例暴发可能是由广东或者东南亚地区的登革热输入病例引起的。
- 王金章陈宏彬张拥军翁育伟吴春敏郑奎城严延生
- 关键词：登革病毒E基因系统进化树
- 福建省2009-2014年登革热流行特征分析被引量：13
- 2015年
- 目的了解福建省登革热流行特征,为制定防治对策提供依据。方法收集2009—2014年福建省登革热病例资料,建立数据库并分析。结果 2009-2014年福建省共报告登革热病例477例,其中输入性病例200例,本地病例277例,输入性病例全年均有报告,主要集中在6-10月份;年龄以20~49岁为主,男女比例为1.78∶1,病例主要分布于泉州（63/200）、福州（57/200）、莆田（39/200）。输入来源地遍布东南亚、南亚、非洲、大洋洲、南美洲、拉丁美洲等地区,其中以东南亚地区为主要来源,国内输入地包括广东省、云南省和海南省。本地病例发病主要集中于莆田和南平市（269/277）,发病时间集中在9-10月份,10~69岁间各年龄组之间差距不大,男女比例为0.71∶1。所有病例职业分布以商业服务、家务及待业、农民、学生为主。结论福建省登革热流行仍以输入性病例为主,但输入引起本地暴发的风险较高,需重点加强入境旅客的登革热检疫工作。应加强全省登革热的监测和防蚊、灭蚊工作,防止登革热疫情的暴发。
- 陈炜王金章张拥军陈宏彬吴生根翁育伟郑奎城严延生
- 关键词：登革热输入性病例
- 新型冠状病毒在Vero-E6细胞中的增殖特征分析被引量：1
- 2021年
- 目的了解新型冠状病毒(2019-nCoV)在Vero-E6细胞中的增殖特征,为病毒的分离培养、抗病毒药物研究以及疫苗研制等工作提供基础。方法将2019-nCoV做半对数系列稀释,测定病毒的半数组织培养感染剂量(TCID 50);以1.74×10^-4 TCID 50/cell的病毒量感染Vero-E6细胞,在病毒吸附后第0~6 d分别收集病毒培养上清,测定上清中病毒感染滴度和病毒核酸拷贝数;测定病毒储存液冻融/非冻融、不同细胞悬液浓度、病毒吸附后洗涤/不洗涤等不同实验条件下的TCID 50。结果2019-nCoV感染Vero-E6细胞后,48 h内培养上清中的病毒TCID 50和病毒核酸拷贝数到达或接近峰值,平均复制周期约为3.29 h;48 h后上清中病毒核酸拷贝数维持在较高水平但病毒感染滴度逐渐下降。病毒储存液的冻融、细胞浓度以及病毒吸附后洗涤等培养条件可轻微影响病毒TCID 50。结论2019-nCoV感染Vero-E6细胞在早期增殖迅速,感染后期病毒感染滴度逐渐下降,但病毒核酸拷贝数在上清中维持在较高水平。
- 张炎华何文祥朱颖陈炜吴冰珊修文琼陈宏彬俞婷婷鄢育青吴晶晶袁平张小鸿骆婧翁育伟郑奎城
- 关键词：新型冠状病毒VERO-E6细胞体外
- 福建省人感染H5N6禽流感病毒与外环境禽流感病毒相关性分析被引量：8
- 2018年
- 目的分析福建省外环境H5亚型禽流感病毒分布情况及与人感染H5N6禽流感的关系,为人感染禽流感的科学防治提供依据。方法收集2013-2017年福建省外环境常规监测标本信息,进行统计分析。从数据库下载相关禽流感病毒基因序列,进行基因同源性比对和系统进化分析。结果外环境监测结果统计分析显示:2013-2017年共采集样本4 903份,H5亚型阳性率为4.24%,且不同的网络实验室(χ~2=101.033)、监测场所(χ~2=45.526)、标本类型(χ~2=31.751)和季节(χ~2=48.174)阳性率均存在统计学差异(P<0.05)。福建省首例人感染H5N6禽流感(A/Fujian-Sanyuan/21099/2017)病毒全基因序列与6株福建省外环境H5N6病毒的同源性在85.1%~98.5%,与病家院中采集的1株加强监测外环境标本的HA和NA基因同源性分别为100.0%和99.9%。系统进化分析显示:福建省人感染H5N6病毒HA基因与加强监测的外环境H5N6病毒的进化距离最近,与其余6株距离较远,处在不同的进化分枝中,其基因源于H5N8病毒;而NA基因则与7株外环境H5N6病毒的进化距离较近,源于H5N6病毒。结论福建省冬春季外环境中禽流感活动较为活跃,应加强活禽交易市场的卫生管理工作。福建省发现的首例人感染H5N6禽流感与外环境禽流感病毒的重配可能存在一定的相关性。
- 陈平谢剑锋林琦赵琳张炎华陈宏彬翁育伟郑奎城
- 关键词：进化分析
- 2017—2021年福建省外环境禽流感病毒监测被引量：1
- 2023年
- 目的分析2017—2021年福建省外环境禽流感病毒流行特点, 为禽流感防控、预测工作提供参考。方法在福建省6地市监测点的4类禽类相关不同场所进行6类不同类型标本的采样, 采用荧光定量PCR法对环境标本进行A型、H5、H7和H9亚型核酸检测, 并采用流行病学方法对检测结果进行分析。结果 2017—2021年共采集6个监测点标本4 214份, 其中A型禽流感病毒阳性率为41.53%(1 750份), H5、H7和H9亚型阳性率分别为2.33%(98份)、1.16%(49份)和23.16%(976份), H5+H7亚型阳性率为0.05%(2份), H5+H9亚型阳性率为1.83%(77份), H7+H9亚型阳性率为0.83%(35份), H5+H7+H9亚型阳性率为0.09%(4份), A型阳性未分型的阳性率为12.08%(509份)。不同检测场所和不同类型标本A型阳性率的差异具有统计学意义(χ^(2)=517.57,P<0.001;χ^(2)=51.58,P<0.001):城乡活禽市场的禽流感病毒阳性率最高(49.72%);不同类型标本中笼具表面擦拭标本(48.09%)、清洗禽类的污水(47.34%)和宰杀或摆放禽肉案板表面(45.66%)的阳性率较高。不同地区监测点的A型阳性率差异具有统计学意义(χ^(2)=458.34,P<0.001):A型阳性率最高和最低的地市分别是三明市(56.00%)和漳州市(3.34%)。在时间分布方面, 冬春季(11月至次年2月)和夏季(6~8月)的阳性率较高。结论福建省禽流感病毒总体阳性率较高, 以H9亚型为主, 应重点加强冬春季和夏季禽流感病毒的监测, 加强对城乡活禽市场的监管力度。
- 吴晶晶林琦张炎华王金章陈宏彬鄢育青翁育伟
- 关键词：禽流感禽流感病毒
- 福建省1例不明原因肺炎病例中甲型H1N1流感病毒的全基因组特征分析被引量：3
- 2017年
- 目的了解1例不明原因肺炎病例中甲型H1N1流感病毒的生物学特性和变异情况,为临床治疗与疫情防控提供依据。方法利用MDCK细胞分离不明原因肺炎病例中的甲型H1N1流感病毒,分离的毒株经全基因组测序后分析其抗原性、致病性和耐药性等特征。结果从该病例的咽拭子标本中分离得到1株甲型H1N1流感病毒并命名为A/FujianGulou/SWL64/2016(H1N1),其8个节段的核苷酸和氨基酸序列与A/California/07/2009(H1N1)疫苗株的相似性分别为96.9%~98.9%和96.7%~99.5%。氨基酸序列分析显示HA蛋白共有18个位点发生突变,其中K163Q、S185T、S203T和D222N变异涉及到3个不同的抗原位点,提示病毒发生抗原漂移;与受体结合位点相关的D222N突变还提示病毒感染下呼吸道的能力增强。耐药性分析显示该病毒对金刚烷胺耐药,对达菲仍然敏感。结论本次研究的甲型H1N1流感病毒具有抗原漂移现象,且具备引发重症肺炎的分子特征,应进一步加强监测,为疫情防控奠定基础。
- 张炎华翁育伟张建明修文琼陈宏彬赵琳何文祥朱颖谢剑锋郑奎城
- 关键词：不明原因肺炎甲型H1N1流感
