马玉韬
- 作品数：12 被引量：61H指数：4
- 供职机构：天津大学电子信息工程学院更多>>
- 发文基金：宁夏回族自治区自然科学基金国家自然科学基金宁夏高等学校科学技术研究项目更多>>
- 相关领域：生物学电子电信自动化与计算机技术理学更多>>
- 基于傅里叶分析的蛋白质编码区预测中功率谱密度计算方法研究被引量：6
- 2011年
- 提出一种新的功率谱算法——多滑动窗周期图法.新算法和传统周期图功率谱密度算法在ALLSEQ和HMR195两个DNA序列集上进行了基因预测实验.以近似相关系数AC作为预测准确率测度,实验结果表明,新算法的预测准确率比基于传统周期图法的傅里叶分析基因预测算法有较大提高.
- 马玉韬车进刘大铭
- 关键词：傅里叶分析
- 基于滤波理论和特征统计的蛋白质编码区预测算法研究
- 真核生物的DNA序列结构较原核生物更加复杂,因此尽管在过去几十年间种类繁多的基因预测算法有了很大的发展和进步,并且持续受到关注,但迄今为止,在蛋白质编码区(外显子,特别是短外显子)的预测准确率仍然不能满足对DNA片段或基...
- 马玉韬
- 关键词：滤波理论线性相位映射方法
- 文献传递
- 用反馈神经网络对非线性离散系统进行实时建模被引量：3
- 2000年
- 利用时变反馈神经网络的概念及二维线性系统理论给出了非线性离散系统的一种实时建模方法 .理论及仿真实验结果均表明 ,这种实时模型能够任意逼近非线性离散系统 .
- 李晓东马玉韬
- 关键词：非线性离散系统反馈神经网络
- DNA序列映射方法对蛋白质编码区预测准确率的影响被引量：7
- 2012年
- [目的]探讨当前主要的DNA序列映射方法对蛋白质编码区的预测准确率的影响,寻找有效的映射方法。[方法]以AC(Approxi-mate Correlation)为碱基层的预测准确率的测度,采用FIR(Finite Impulse Response)窄通带滤波器预测算法研究各种映射方法对预测准确率的影响。[结果]在ALLSEQ和HMR195 2个DNA序列集上,Voss法和Z-curve方法是较PN(Paired Numeric)法、EIIP(Electron-IoInteraction Potential)法和复数法更为有效的映射方法。[结论]该研究结果为用预测结果的AC值来验证新映射方法的有效性奠定了基础,对利用生物信息学方法正确揭示DNA序列的结构具有重要意义。
- 马玉韬张成杨泽林李琦杨婷
- 关键词：蛋白质编码区映射方法加窗
- DNA序列映射方法对蛋白质编码区预测准确率的影响(英文)
- 2011年
- [目的]探讨当前主要的DNA序列映射方法对蛋白质编码区的预测准确率的影响,寻找有效的映射方法。[方法]以AC(Approximate Correlation)为碱基层的预测准确率的测度,采用FIR(Finite Impulse Response)窄通带滤波器预测算法研究各种映射方法对预测准确率的影响。[结果]在ALLSEQ和HMR195 2个DNA序列集上,Voss法和Z-curve方法是较PN(Paired Numeric)法、EIIP(Electron-Io Interaction Potential)法和复数法更为有效的映射方法。[结论]该研究结果为用预测结果的AC值来验证新映射方法的有效性奠定了基础,对利用生物信息学方法正确揭示DNA序列的结构具有重要意义。
- 马玉韬张成杨泽林李琦杨婷
- 关键词：蛋白质编码区映射方法加窗
- 基因预测算法中阈值的傅里叶质谱分析
- 2014年
- 蛋白质编码区预测中阈值选择对预测结果的影响不容忽视。研究提出以归一化的功率谱密度作为判别DNA序列编码区和非编码区的阈值,以FIR(Finite impulse response,FIR)窄通带滤波器NPBF(Narrow pass band filter,NPBF)作为编码区预测算法核心,采用DNA序列集HMR195和ALLSEQ作为测试集,以碱基层的近似相关系数(Approximate correlation,AC)为预测准确率测度指标,对所提出方法与现有方法的预测结果做了比较。结果表明,采用新阈值得到的预测准确率最高,算法简单直观。
- 刘平马玉韬孙学宏张成杜勇
- 《数字信号处理》教学思考
- 《数字信号处理》课程理论性强、公式推导较多,课程内容抽象、学生学习难度大;调整教学内容,改革教学方法、增加教学手段和实验教学内容等,是增加学生兴趣,提高该课程教学质量的重要途径;注重师德教育、专业技能培训和工程技术进步,...
- 马玉韬
- 关键词：教学改革教师素质教学内容专业技能培训
- 文献传递
- 基于全相位滤波理论的基因预测
- 基于全相位滤波理论,设计了一种新的FIR窄通带滤波器-APNPBF.它能精确控制通带增益,且不需反复进行参数调试.使用频率采样、Chebyshev窗和全相位窄通带滤波器分别作为蛋白质编码区预测算法的核心,在ALLSEQ和...
- 马玉韬轩秀巍车进滕建辅
- 关键词：基因预测窗函数
- 文献传递
- 密码子使用偏性量化方法研究综述被引量：41
- 2013年
- 在基因组学水平上研究密码子使用偏性模式、成因并分析进化过程中的选择压力在基因组学研究中有重要意义。文章概述了目前提出的密码子使用偏性的量化方法及实现原理。目前研究发现:有些量化密码子偏性的方法受高表达基因参考数据集未完全注释的限制,不同密码子位置对变异和选择的影响不同,以及不同密码子位置处GC含量和嘌呤含量的贡献不同。由此展望密码子偏性量化方法发展方向为:需要设计不需要相关参考基因集合先验知识的密码子使用偏性量化方法;考虑不同位置处背景核苷酸组成的密码子使用偏性的量化方法;同时考虑基因表达水平的密码子使用偏性量化方法。最后,归纳了目前可用的密码子使用偏性的量化工具和数据库。
- 唐晓芬陈莉马玉韬
- 关键词：同义密码子密码子使用偏性高表达基因
- 加窗窄通带滤波器蛋白质编码区预测算法被引量：5
- 2013年
- 改进Gabor小波变换(Modified Gabor wavelet transform,MGWT)蛋白质编码区预测算法给出的预测结果在当前所有的独立预测算法中准确率最高。本文提出了有限脉冲响应(Finite impulse response,FIR)加窗窄通带滤波器蛋白质编码区预测(Windowed narrow pass-band filter,WNPBF)算法。算法的主要部分包括:以F56F11.4序列为例给出了WNPBF阶数选择的依据,并据此设计WNPBF;为消除滤波器群延迟对预测结果产生的不良影响,对信号用边界对称延拓法进行预处理并对窄带滤波器滤波输出信号进行截取;为改善预测结果,设计滑动平均滤波器平滑功率谱密度曲线。在ALLSEQ和HMR195两个DNA序列集上获得预测准确率分别接近或达到独立预测算法的最高水平。通过比较后发现,所提出的WNPBF算法较MGWT算法效率更高,使用该算法可以直观和客观地比较不同滤波器的预测结果。
- 马玉韬车进关欣滕建辅
- 关键词：FIR滤波器窗函数法群延迟
