侯廷军
- 作品数：136 被引量：236H指数：9
- 供职机构：浙江大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金浙江省自然科学基金北京市自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生理学化学工程生物学更多>>
- 三种金属硫蛋白聚合物静电效应的研究被引量：3
- 2000年
- 考察了三种金属硫蛋白(大鼠金属硫蛋白亚型Ⅱ,兔肝金属硫蛋白亚型Ⅰ和兔肝金属硫蛋白亚型Ⅱ)的单体、二聚体和三聚体在pH为5.6～8.5和10.6两种缓冲条件下的静电势分布.其中大鼠金属硫蛋白亚型Ⅱ的结构直接来自于晶体数据,兔肝金属硫蛋白亚型Ⅰ和Ⅱ的结构则通过同源蛋白模型搭建.三种金属硫蛋白的静电势通过有限差分方法求解Poisson-Boltzmann方程得到.对于三种金属硫蛋白的二聚体,pH为5.6～8.5时,单体和单体之间的静电势分布具有明显的互补性;但pH≥10.6时,这种互补性会大大削弱.对于三种金属硫蛋白的三聚体,单体和二聚体之间主要表现为静电排斥,而且pH在10.6下的静电排斥力明显强于pH为5.6～8.5时的静电排斥.
- 侯廷军李有勇徐筱杰安钰茹炳根毕汝昌
- 关键词：金属硫蛋白静电势
- 高精度MIEC-SVM模型的构建及其在虚拟筛选中的应用
- MIEC-SVM方法在蛋白-多肽相互作用模式识别中发挥了重要作用,然而这种方法是否适用于蛋白-小分子结合模式的识别和筛选尚无定论,此外,如何构建高效的MIEC-SVM模型目前也没有统一的认识。因此本研究首先采用组合优化策...
- 孙慧涌侯廷军
- 关键词：激酶抑制剂
- 基于对接与MM/GBSA的蛋白-蛋白相互作用预测及分析在线计算平台Hawk Dock的开发
- 蛋白-蛋白相互作用（PPI）在各种生命活动中均扮演着至关重要的角色。因此,破解PPI中的结构信息可对其机制的研究以及相关药物的开发起到关键作用。然而至今为止,仅有一小部分的蛋白-蛋白复合物的晶体结构得到了解析。因此,越来...
- 翁高棋王二成王哲侯廷军
- 关键词：对接蛋白-蛋白相互作用
- 文献传递
- 三种金属硫蛋白动力学稳定性的理论研究被引量：3
- 2000年
- 对三类金属硫蛋白 (大鼠金属硫蛋白亚型II,兔肝金属硫蛋白亚型I和兔肝金属硫蛋白亚型II)的单体和二聚体进行了水溶液条件下的分子动力学模拟.其中大鼠金属硫蛋白亚型II的结构直接来自于晶体数据 ,兔肝金属硫蛋白亚型I和II的结构则通过同源蛋白模型搭建.动力学模拟的结果显示,这三种单体在水溶液中都具有相当大的柔性 ,柔性主要来源于柔性区的氨基酸残基.三类金属硫蛋白单体的动力学模拟均表明α结构域的动力学稳定性都要优于 β结构域.从主链的坐标均方根偏差可以看到,二聚体的动力学稳定性要明显优于单体 ,这主要因为在形成二聚体后柔性区域残基的构象空间受到了一定的限制.
- 侯廷军安钰茹炳根徐筱杰
- 关键词：分子动力学金属硫蛋白动力学稳定性
- 苯基吡唑类化合物及其应用
- 本发明公开了一种苯基吡唑类化合物。本发明还公开了前述化合物在制备治疗前列腺癌药物中的应用。本发明所提供的苯基吡唑类化合物对雄激素受体具有明显的拮抗活性，为前列腺癌的药物开发提供了新的途径。
- 崔孙良陈昌威侯廷军柴昕李丹
- 基于原子表面的蛋白质水合自由能预测模型
- 2003年
- 提出了一种计算蛋白质水合自由能的简化模型(SAWSA2).模型把蛋白质分子中的原子分为20种不同的原子类型,通过每类原子的溶剂可及化表面以及相应的溶剂化参数,就可以得到分子的水合自由能.不同原子类型的溶剂化参数通过110个蛋白质分子水合自由能拟合得到,水合自由能的标准值采用了基于求解Possion-Boltzmann方程(PB)以及分子表面计算(SA)相结合的方法.采用得到的模型,预测了20个蛋白质分子的水合自由能,预测值的相对值和绝对值都能和PB/SA的计算值很好地吻合,大大优于两种已报导的水合自由能模型.
- 侯廷军章威黄钦乔学斌徐筱杰
- 关键词：蛋白质溶剂效应蛋白质
- CLIP1-LTK融合蛋白抑制剂的医药用途
- 本发明提供一种CLIP1‑LTK融合蛋白抑制剂在制备治疗非小细胞肺癌相关疾病的药物中的应用，所述非小细胞肺癌相关疾病为除小细胞肺癌以外，所有来源于肺上皮的各种类型癌症疾病的集合体，常见类型有鳞状细胞癌，腺癌、大细胞癌，临...
- 潘培辰侯廷军张徐俊渠旺林陈世诚
- 吲哚乙酰胺结构类型雄激素受体拮抗剂及其应用
- 本分案申请公开了吲哚乙酰胺结构类型雄激素受体拮抗剂及其应用，属于生物化学技术领域。本发明提供的2种化合物对雄激素受体具有明显的拮抗活性，因此上述化合物可以应用到雄激素受体拮抗剂、前列腺癌细胞增殖抑制剂和抗前列腺肿瘤药物的...
- 侯廷军李丹周文方
- 文献传递
- 10种分子对接程序采样和打分性能的综合测评
- 分子对接方法作为当今最为常用的基于结构的药物设计手段之一,其不仅能给出配体在靶标结合口袋内的正确结合模式,还可以预测两者的结合强度。随着分子对接程序的不断更新和开发,可选的程序越来越多,而对现有对接程序优缺点的全面了解则...
- 王哲侯廷军
- 关键词：分子对接打分函数
- 苯并吡喃酮或喹啉酮类化合物及其应用
- 本发明公开了苯并吡喃酮或喹啉酮类化合物及其在制备治疗前列腺癌药物中的应用，属于医药领域。本发明提供的结构式如式(Ⅰ)的苯并吡喃酮、喹啉酮类化合物对雄激素受体具有明显的拮抗活性，且对不表达雄激素受体的前列腺癌细胞同样具有抑...
- 李丹侯廷军富炜涛张珉魁盛荣汤钦
- 文献传递
