应康
- 作品数：125 被引量：562H指数：15
- 供职机构：复旦大学生命科学学院遗传工程国家重点实验室更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金上海市现代生物与新药产业发展基金国家科技型中小企业技术创新基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学电子电信化学工程更多>>
- 胶质母细胞瘤基因表达谱及相关基因的聚类研究被引量：6
- 2004年
- 目的 探讨人脑胶质母细胞瘤发生、发展中相关基因的表达及功能。方法 用含 13939种人类基因的BioStarH14 0S型表达谱芯片 ,以正常成人脑及不同级别胶质瘤组织总RNA制备的探针杂交芯片 ;ScanArray 4 0 0 0扫描芯片荧光信号 ,提取脑及胶质瘤组织差异基因并进行生物信息分析 ;用Hierarchical聚类对胶质瘤差异基因进行特征提取 ;用Northern杂交验证及进行初步功能研究。结果正常脑与 18例不同级别胶质瘤组织间筛选出多类差异表达基因 ,通过生物信息学和Hierarchical聚类 ,发现α 连环素、微型染色体维护蛋白 7、细胞周期素B2、FBX0 5、着丝粒蛋白F基因与胶质母细胞瘤密切相关 ,该类基因在低级别胶质瘤中表达差异不明显 ,但胶质母细胞瘤中表达明显上调。Northern杂交显示该类基因与胶质母细胞瘤密切相关 ,与芯片结果一致。结论 基因表达谱芯片可快速、高效地筛选胶质瘤相关基因 ,发现的 5条基因与胶质母细胞瘤侵袭性强密切相关 。
- 陈菊祥卢亦成胡国汉骆纯楼美清应康李瑶谢毅
- 关键词：脑胶质母细胞瘤基因芯片表达谱
- 生物芯片技术及在中药研究中的应用展望被引量：16
- 2001年
- 生物芯片是近几年来发展起来的一种尖端技术 ,可用于中药药理的分析、新药的研制开发、中药鉴定、毒理观察等方面 ,有利于在分子生物学水平上阐明中医药治病的机制 ,促进中药的现代化 。
- 金伟马昱澍程海鹏倪晓华周宗祥应康谢毅毛裕民
- 关键词：生物芯片中药
- 变应性鼻炎基因芯片检测及其基因表达谱的研究被引量：20
- 2002年
- 目的 运用基因芯片技术研究变应性鼻炎的基因表达谱。方法 对变应性鼻炎和非变应性鼻炎鼻黏膜组织进行总RNA抽提 ,纯化后的mRNA进行逆转录制备杂交探针 ,应用含有 12 80 0个人类全长互补DNA(complementaryDNA ,cDNA)的表达谱芯片对 8例变应性鼻炎与非变应性鼻炎鼻黏膜组织进行差异表达谱分析。结果 在变应性鼻炎的基因表达谱中差异表达基因共有 734条 ,上调的基因 4 30条 ,下调的基因 30 4条 ,共存性差异表达基因有 2 1条 ,其中上调基因 15条 ,下调基因 6条 ,在差异表达的基因中 ,其中有些是炎性反应、免疫应答、免疫调控、神经内分泌网络系统及信号传导的相关基因 ,这些基因可能与变应性鼻炎发病机制有关。结论 运用基因芯片技术研究变应性鼻炎相关基因 。
- 章如新余少卿应康谢毅李东方倪鑫温武沈小华毛裕民
- 关键词：变应性鼻炎基因芯片基因表达
- 人红细胞嘧啶5′-核苷酸酶Ⅰ分子量鉴定、氨基酸组成分析及其微量测序被引量：1
- 2003年
- 为进一步探讨遗传性红细胞嘧啶 5′ 核苷酸酶Ⅰ (P5′N Ⅰ )缺乏症的发病机制 ,在纯化人红细胞P5′N Ⅰ的基础上 ,分别用质谱仪和氨基酸分析仪分析其分子量及氨基酸组成 ,同时将该酶经胰蛋白酶水解后进行微量测序 ,并行生物信息学分析。研究结果 :质谱分析表明在蛋白电泳呈一条带的纯化的人红细胞P5′N Ⅰ中发现 3种分子量成倍数关系 ,且质谱图曲线非常吻合的蛋白 ,分子量分别为 2 6 95 2 .9,5 5 4 76及 110 938。测出 1个酶解肽片段N末端的 10个氨基酸序列为 :I E G P T I R Q I E。在数据库中未发现同源性片段。氨基酸分析表明该酶至少由 18种氨基酸 ,约 2 5 3个氨基酸残基组成。结论 :人红细胞P5′N Ⅰ可能为一种多亚基组成的变构酶 ,生理状态下可能存在同源二聚体或四聚体。所测氨基酸序列可作为筛选目的基因的探针。所测氨基酸组成为确定其蛋白一级结构提供了重要依据。
- 潘竹林李津婴闵碧荷应康周虹许小平宋献民韩凤来章卫平张娴
- 关键词：红细胞氨基酸成分贫血
- 人脑胶质瘤相关的二条全长新基因报导及染色体定位被引量：1
- 2002年
- 目的 报导与人脑胶质瘤相关的二条新基因及其在染色体上的定位。方法 对发现的脑胶质瘤相关的二条新基因进行测序,Northern blot和序列局部对比查询（BLAST）分析,同时运用染色体辐射杂交（RH）技术对其进行染色体定位。结果 这二条新基因都是全长新基因,基因库登录号分别为AF 225513和AF 329277。经Northern blot证实436 F11基因在人正常脑组织中高表达,而在人脑胶质瘤中低表达,而另一条基因507 E08则相反。RH染色体定位显示436 F11基因在6q 21-q23的D6S304和D6S2156Marker之间,507E08基因在D14S1066 Marker和D14S265 Marker之间。结论 找到了二条与人脑胶质瘤相关的全长新基因及其在染色体上的相应定位,这为胶质瘤的基因治疗提供了新思路。
- 祁震宇惠国桢王兆吴海应康顾少华谢毅
- 关键词：脑胶质瘤神经胶质瘤染色体定位基因测序
- 人类Neuritinc DNA的克隆和表达被引量：18
- 2001年
- 从人胎脑ｃＤＮＡ文库筛选出一条 １６１８ ｂｐ的 ｃＤＮＡ．此ｃＤＮＡ含有一个４２６ ｂｐ的最大开放阅读框，编码一个１４２个氨基酸的蛋白质，预测分子质量为 １５．３ ｋｕ．与目前数据库中序列比较，该ｃＤＮＡ与鼠 ｎｅｕｒｉｔｉｎ基因同源性达 ９８ ％．多组织 Ｎｏｒｔｈｅｒｎ ｂｌｏｔ分析显示 ｎｅｕｒｉｔｉｎ在脑组织高度表达．ｎｅｕｒｉｔｉｎｃＤＮＡ的读框片段正确插入到ｐＱＥ４０表达载体中，获得了预期的表达产物，并初步得到了其纯化蛋白．
- 黄谨杨磊应康吴海潘泽民袁红玲谢毅
- 关键词：NEURITINCDNA基因克隆神经再生核苷酸序列氨基酸序列
- 前列腺癌相关基因表达谱研究被引量：1
- 2003年
- 目的 寻找前列腺癌相关基因以用于前列腺癌的诊断和治疗。 方法 应用含有4 36 6条人类全长基因cDNA基因表达谱芯片 ,研究一组前列腺癌和正常前列腺组织样本的基因表达谱 ,找出研究前列腺癌组织和正常前列腺组织中差异表达的基因。 结果 前列腺癌与正常前列腺组织有差异表达基因 2 87条 ,其中未知基因 16 5条 ,已知基因 12 2条 ,从已知基因中筛选出有显著差异表达的基因 5 6条 ,其中上调基因 2 0条 ,下调基因 36条。 结论 运用cDNA微矩阵基因芯片对基因表达谱进行分析 ,能有效筛查出新的前列腺癌相关基因。
- 习小庆胡映波吴勇潘正跃葛根彭瑞元应康谢毅
- 关键词：前列腺癌基因表达谱
- 裸鼠高致瘤性人白血病细胞系肿瘤相关基因的表达被引量：1
- 2002年
- 目的 :探索 K 5 6 2和 K5 6 2 - n细胞在裸鼠体内致瘤性不同的分子生物学机制。 方法 :应用基因芯片技术 ,检测 K5 6 2细胞和 K5 6 2 - n细胞的差异表达基因。 结果 :K5 6 2 - n细胞中表达上调的与白血病及其他肿瘤发生、发展相关的基因包括如dek基因和 DP1基因 (结肠直肠多发性息肉病位点基因 )。许多肿瘤抑制基因或包含潜在的肿瘤抑制基因的序列在 K5 6 2 - n细胞中表达下降 ,如染色体 12 p13序列 (U 4792 4)。锌指蛋白 12 7- Xp基因和锌指蛋白 198基因 ,prohibitin基因、DNF15 s2基因、h MSH2基因 (遗传性非息肉性结肠癌基因 ,为碱基错配修复基因 )、环孢素受体基因。结论 :K5 6 2 - n细胞的裸鼠高致瘤特性与一系列癌基因的表达上调和抑癌基因的表达下调有关。
- 吕书晴许小平夏放李瑶应康毛裕民
- 关键词：白血病致瘤性癌基因肿瘤抑制基因
- 应用表达谱芯片研究胶质母细胞瘤相关基因的表达及功能(英文)被引量：2
- 2004年
- 目的:应用基因表达谱芯片筛选研究人脑胶质母细胞瘤发生,发展中相关基因的表达及生物信息分析功能。方法:采用含13939条基因(设置173个对照点)的BioStarH140S型表达谱芯片;用改良的"一步法"抽提2例正常脑及6例胶质母细胞瘤组织总RNA,制备杂交探针;杂交芯片后用ScanArray4000扫描芯片荧光信号,提取正常脑及胶质母细胞瘤组织差异基因;对差异基因进行生物信息分析,初步分类及Northern杂交研究。结果:按照差异显著标准,在胶质母细胞瘤中共有198条(1.42％)基因表达差异显著,其中77条(0.55％)表达上调,121条(0.87％)表达下调,55条新基IN尚未在GenBank登录;生物信息分析发现肿瘤相关基因与细胞信号和传递蛋白、代谢、蛋白翻译合成、细胞骨架和运动、免疫、原癌基因和抑癌基因、细胞周期、细胞凋亡等9类基因密切相关;Northern杂交结果与表达谱芯片一致。结论:基因表达谱芯片可低成本、高通量、高效率筛选胶质瘤相关基因,并为基因群功能研究提供了方向;本研究结果有助于揭示胶质母细胞瘤分子机制,为指导肿瘤的临床诊断、治疗和预后判断提供依据。
- 陈菊祥卢亦成骆纯胡国汉楼美清吴小军李瑶应康
- 关键词：基因功能胶质母细胞瘤基因芯片基因表达
- 高覆盖率芯片对人脑胶质瘤分子病理分类的研究
- 本课题对不同级别星形细胞瘤的基因表达谱进行分析及Hierarchical聚类，并结合肿瘤的临床表现、病理级别进行分析，探讨低级别和高级别星形细胞瘤之间的分子病理差异，以期发现与胶质瘤发生、进展和复发的相关基因，为临床对胶...
- 陈菊祥卢亦成胡国汉骆纯李瑶应康谢毅
- 关键词：胶质瘤分子病理基因治疗基因芯片
- 文献传递
