柴文琼 作品数:6 被引量:38 H指数:4 供职机构: 甘肃农业大学 更多>> 发文基金: 甘肃省自然科学基金 甘肃省农业科技创新项目 国家农业科技成果转化资金 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
3种虹鳟养殖群体的遗传结构及遗传多样性分析 被引量:7 2010年 从40个随机引物中筛选出20个,采用随机扩增多态DNA(RAPD)技术,对甘肃金鳟、道氏虹鳟和美国金鳟3个群体进行了遗传结构和遗传多样性分析。结果表明,甘肃金鳟、道氏虹鳟、美国金鳟群体多态位点百分比分别为82.79%、73.33%、77.87%;平均等位基因数分别为1.8239、1.7429、1.7887,有效等位基因数分别为1.4823、1.4281、1.4527;基因多样度分别为0.2820、0.2528、0.2675,Shannon遗传多样性指数分别为0.4219、0.3801、0.4022;以上参数表明,3个群体的遗传多样性均处于偏高的水平,且以甘肃金鳟的遗传多样性最为丰富。甘肃金鳟与美国金鳟之间的遗传距离最大,道氏虹鳟与美国金鳟之间的遗传距离最小。遗传分化指数表明,种内群体间的遗传分化程度很低,而群体内个体间的分化程度很高,变异主要来源于群体内个体间。综合分析认为,甘肃金鳟遗传多样性偏高,有进一步选育的遗传潜力;同时,群体内遗传分化程度较大,说明品种的纯度可能较低,经济性状不够稳定,需进一步选育。 刘哲 李勤慎 蔡原 王建福 黄进强 柴文琼 康鹏天关键词:虹鳟 RAPD 绒山羊DQA1基因第2外显子遗传特征分析 本研究以864只河西绒山羊、223只柴达木绒山羊和633只陇东绒山羊(共计1720只)为研究对象,采用PCR-SSCP和克隆测序技术分析3个山羊群体DQA1基因第2外显子的多态性和遗传特征,并进行河西绒山羊流产关联性分析... 柴文琼关键词:基因 PCR-SSCP 多态性 流产 绒山羊 文献传递 5个绵羊群体微卫星多态性分析 被引量:13 2012年 采用微卫星DNA标记对甘肃高山细毛羊、滩羊等5个绵羊群体(125只个体)的5个微卫星座位等位基因进行检测,分析5个绵羊群体的遗传多样性和亲缘关系。结果表明:5个绵羊群体中共发现78个等位基因,其中在甘肃高山细毛羊肃南县群体中发现的等位基因数最多(57个),滩羊最少(43个)。多态信息含量、期望杂合度和观察杂合度的数据分析表明:在研究的5个绵羊群体中甘肃高山细毛羊天祝县群体和肃南县群体的遗传多样性较丰富,而滩羊的遗传多样性相对较低。DA遗传距离和DS遗传距离构建的邻接(NJ)系统发育树均表明:甘肃高山细毛羊天祝县群体和肃南县群体与藏羊的亲缘关系较近,为一类;而滩羊与小尾寒羊的遗传距离较近,为另一类。 柴文琼 成述儒 靳建华 罗玉柱关键词:绵羊 微卫星DNA 系统发育 河西绒山羊GOLA-DQA1基因第2外显子遗传特征分析 被引量:7 2013年 采用PCR-SSCP和测序技术,分析864只河西绒山羊(有流产表型记录)GOLA-DQA1基因的遗传特性及其与山羊流产的关联性。研究结果表明,在河西绒山羊DQA1基因第2外显子上检测到9个等位基因,其中GOLA-DQA1*B、GOLA-DQA1*E和GOLA-DQA1*H3个等位基因为本研究首次发现。9个等位基因中存在42个核苷酸多态位点,占分析位点总数的12.65%,包括23个转换位点,13个颠换位点,5个转换和颠换共存位点及1个插入位点。相关性分析结果表明,不同表型间的等位基因分布差异显著(P<0.05),病例组中等位基因GOLA-DQA1*A的频率显著高于正常组(P<0.05),等位基因GOLA-DQA1*H的频率显著低于正常组(P<0.05)。由此推测等位基因GOLA-DQA1*A与山羊流产的易感性相关,GOLA-DQA1*H与流产抗性相关。 柴文琼 王继卿 胡江 刘秀 李少斌 罗玉柱关键词:河西绒山羊 PCR-SSCP 流产 甘肃金鳟种质特性研究 刘哲 钱续 蔡原 李勤慎 张昌吉 王建福 黄进强 邵东宏 杨联 张玉斌 康鹏天 柴文琼 该项目为甘肃省自然科学基金项目(编号0803RJZA030)。项目以甘肃金鳟为主要研究对象,以虹鳟其它品系为参照,从外形特征、血液生化指标、养殖性能、遗传结构和遗传多样性、肌肉营养成分等方面对甘肃金鳟的种质特性进行了研究...关键词:关键词:品种选育 冷水鱼 鱼类血液基因组DNA提取方法优化 被引量:9 2009年 以冷水性虹鳟鱼抗凝冷冻全血为材料,分别采用氯仿-醋酸钾法、RGDE(Rapid genomic DNA extraction)法、改进的RGDE法、传统酚-氯仿法、试剂盒法提取基因组DNA,琼脂糖凝胶电泳检测显示改进的RGDE法可以获得较高质量的鱼类基因组DNA。进一步将改进的RGDE法提取血液基因组DNA的效果与传统酚-氯仿法提取血液、肌肉基因组DNA及试剂盒法提取血液基因组DNA的效果通过紫外分光光度计测定浓度和纯度进行比较。结果表明,改进RGDE法提取的基因组DNA平均浓度为1050ng/μL,极显著高于用试剂盒从血液中提取的DNA浓度,显著高于酚-氯仿法从血液和肌肉中提取的DNA浓度,DNA产量为1575μg/mL,A260/A280比值1.65-1.97。采用改进的RGDE法提取DNA,全过程只需2h,具有速度快、成本低、无污染、无需特殊设备的明显优点,而且随机扩增的结果稳定,电泳条带清晰。 刘哲 康鹏天 柴文琼 王太 刘晓敏关键词:鱼类 基因组DNA