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田陆芳
作品数:
2
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供职机构:
燕山大学信息科学与工程学院
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发文基金:
河北省教育厅高等学校自然科学研究项目
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相关领域:
生物学
自动化与计算机技术
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合作作者
刘文远
燕山大学信息科学与工程学院
王宝文
燕山大学信息科学与工程学院
王常武
燕山大学信息科学与工程学院
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作者
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田陆芳
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王常武
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刘文远
传媒
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计算机工程
年份
2篇
2011
共
2
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基于遗传算法的转录因子结合位点识别算法的研究
基因表达调控是理解生物体遗传机制,破解生物体奥秘的关键所在。转录是基因表达至关重要的一步,对转录因子结合位点进行识别与注释,无疑将是研究转录调控规律进而构建表达调控网络的关键步骤。随着生物技术和计算机技术的飞速发展,利用...
田陆芳
关键词:
转录因子结合位点
位置权重矩阵
遗传算法
文献传递
基于Gibbs采样与遗传算法的模体识别
2011年
借鉴Gibbs采样思想,将序列峰值所对应的候选模体作为遗传算法的初始种群,提出一种改进的模体识别算法。将模体在序列中的出现次数作为变量加入到适应度函数中,使其更符合生物数据的特性。在算法变异操作中加入IUPAC简并码保持种群的多样性。对DBTSS数据库中的真实数据进行测试,结果表明该算法具有较高的识别精度和较快的搜索速度。
刘文远
田陆芳
王常武
王宝文
关键词:
模体识别
遗传算法
GIBBS采样
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