邓晔
- 作品数：5 被引量：19H指数：2
- 供职机构：浙江大学更多>>
- 发文基金：云南省省院省校教育合作计划项目浙江省科技计划项目国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 微阵列技术中生物信息的利用和挖掘
- 本文分别对两个相对独立的微阵列研究中，生物信息的利用和挖掘进行了阐明。首先是通过对尖孢镰刀菌微阵列的制备、杂交和分析过程的研究，勾勒出微阵列技术中生物信息的挖掘基本过程;然后从微生物功能基因微阵列中gyrB和错配探针微阵...
- 邓晔
- 关键词：微阵列生物信息尖孢镰刀菌表达序列标签微生物
- 文献传递
- 水稻光温敏核不育系培矮64S在不同光周期/温度下表达谱的变化被引量：4
- 2005年
- 用含3328个基因的cDNA阵列分析了水稻光温敏核不育系培矮64S于长日照/高温及短日照/低温下幼穗的基因表达谱特征.统计数据表明,以短日照/低温(花粉可育)为参比,长日照/高温(花粉不育)下表达丰度显著变化的基因高达14.60%,482个基因下调表达,仅4个基因上调表达.以实时荧光定量PCR技术对所有上调表达基因和随机选择的9个下调表达基因进行了检测,各基因表达丰度的变化趋势一致,验证了cDNA阵列杂交结果的可靠性.这些差异表达基因几乎涉及所有的细胞生物学反应,但MAPK同系物MMK1和MMK2在mRNA水平表现出截然不同的基因表达特征,大量参与信号传导的信号分子的表达丰度也发生明显变化.可以推测,花粉形态建成及相应的生理功能所需要的程序性转录调控受严重干扰可能是MAPK信号传导途径发生显著改变所导致.
- 郭小勤董海涛郑康乐骆红梅谭学林方永启王炎钦邓晔戴承恩娄沂春邵菁史文琴赵东李德葆
- 关键词：光温敏核不育水稻CDNA阵列
- 水稻花期特异表达基因的cDNA和RNA阵列检测被引量：1
- 2004年
- 用水稻孕穗期、开花期总mRNA为探针与含有 2 2 0 0个独立基因的cDNA阵列杂交 ,以检测开花期群体基因的表达谱。结果发现 ,在所获得的 172 0个有效克隆当中 ,有 4 72条基因表达下调 (占 2 7.4 4 % ) ,892条为持家基因 (占5 1 86 % ) ,35 6条基因表达上调 (占 2 0 .70 % )。表达上调的基因中有 2 5 0个功能已知 (占 14 .5 3% ) ,10 6个是功能未知的新基因 (占 6 .16 % )。其中S 腺苷甲硫氨酸还原酶、查尔酮合酶、酰基载体蛋白Ⅱ基因、过敏反应蛋白、醇溶蛋白、3 酮脂酰载体蛋白合酶Ⅲ和β D (1→ 3) 葡聚糖外水解酶等基因参与水稻开花和胚胎发育过程。为了进一步验证它们与开花过程的相关性 ,选取查尔酮合酶、酰基载体蛋白Ⅱ、醇溶蛋白、S 腺苷基甲硫氨酸还原酶和过敏反应蛋白等 5个基因为探针 ,与 75 5个水稻RNA斑点阵列进行杂交。结果证实醇溶蛋白和过敏反应蛋白基因受发育调节在乳熟成穗中高表达 ,查尔酮合酶和S 腺苷基甲硫氨酸还原酶基因在叶片中受光诱导、在根中受缺氮胁迫时高表达。在所有表型中 ,查尔酮合酶、S 腺苷基甲硫氨酸还原酶和酰基载体蛋白Ⅱ基因有相近的表达趋势 ,过敏反应蛋白和醇溶蛋白基因的表达趋势也相近。
- 王丽华邓晔方永启谭学林李德葆
- 关键词：水稻花期基因表达谱CDNARNA
- 冻融法纯化水稻胚乳RNA及稻米品质重要相关基因表达谱研究被引量：11
- 2005年
- 提出了一种从水稻胚乳组织中快速分离总RNA的方法,可以简便地去除RNA中存在的淀粉等多糖类杂质,所获的胚乳总RNA其质量可满足Northern印迹、微阵列制备等分子生物学实验要求。将从966个水稻品种的胚乳中分离所得的RNA制备RNA阵列,用于稻米品质重要基因Wx基因的表达谱分析,结果证实:水稻Wx基因表达丰度总体上与水稻胚乳的直链淀粉含量呈正相关;应用于Northern印迹实验,表明在水稻胚乳组织中,淀粉分支酶Rbe1具有两个长度不同的同源基因,其中一个分子量大的为胚乳特异表达,分子量小的则在水稻各组织中共表达。
- 张海燕董海涛姚海根向跃武谭学林方永启邓晔金庆超Cabezas DANIEL姜玉新戴承恩阎文昭李德葆
- 关键词：胚乳WX基因稻米品质淀粉分支酶分子生物学实验
