陈荣军
- 作品数：16 被引量：156H指数：7
- 供职机构：四川农业大学更多>>
- 发文基金：安徽省国际科技合作基金中国科学院“百人计划”引进国际先进农业科技计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 全基因组分析PEG胁迫下水稻根系转录因子表达变化被引量：13
- 2009年
- 转录因子在植物抗逆境中起重要的调节作用。本文使用Affymetrix水稻60K芯片全基因组研究PEG胁迫时2个耐旱性不同的水稻品种的转录因子及转录因子家族的变化,结果表明,在PEG胁迫下,耐旱品种湘丰早119根系共有95个转录因子转录本与对照处理比较表达发生变化(24个为转录水平下调表达,71个为转录水平上调表达);干旱敏感品种爱华5号根系有129个转录因子转录本表达发生变化(转录水平上调的转录因子转录本60个,转录水平下调的转录因子转录本69个);2个品种PEG胁迫响应转录因子隶属的转录因子家族都为30个,但各转录因子所属的30个家族并不完全相同;PEG胁迫逆境中,PEG胁迫响应转录因子转录本表现出品种特异性,湘丰早119有72个为特异响应转录本,爱华5号有106个特异响应的转录因子转录本;2个品种在干旱胁迫下响应的转录因子有23个为重叠转录本,其中有16个在转录水平上调表达,7个在转录水平下调表达;2个品种的PEG胁迫响应转录因子基因在染色体上的分布不同,重叠转录因子基因主要位于第2染色体0.432～26.139 Mb和第5染色体0.076～20.597 Mb之间。
- 马廷臣陈荣军余蓉蓉曾汉来张端品
- 关键词：水稻根系基因芯片转录因子
- 水稻逆境响应基因OsMsr15的表达分析与克隆被引量：2
- 2012年
- 应用Affymetrix水稻表达芯片,分析了苗期和孕穗期的培矮64S水稻基因在高温、干旱和低温逆境处理条件下的表达模式,发现多个与逆境反应相关基因.其中,OsMsr15(Oryza sativa L.multiple stresses responsivegene 15)受高温、干旱和低温胁迫诱导,表达水平均显著上调.实时定量PCR分析结果与芯片数据基本吻合.序列分析表明,该基因无内含子,ORF(open reading frame)全长为717 bp,编码一个由238个氨基酸残基组成、具有典型C2H2结构域的锌指蛋白,推测相对分子质量约为2.46 kD,pI值约为8.90,蛋白分子的氨基端和羧基端分别存在一个推测的核定位信号B-box和EAR(ERF-associated amphiphilic repression)基序.对OsMsr15可能的启动子区域进行分析,发现多种与逆境诱导相关的调控元件.该基因编码的蛋白在不同物种中存在高度相似性,显示OsMsr15基因可能作为一个保守的耐逆基因,参与植物的多种耐逆反应过程.
- 张新陈荣军王曼玲宋书锋夏新界
- 关键词：水稻逆境基因芯片基因克隆
- PEG-6000模拟干旱对水稻幼苗期根系的影响被引量：44
- 2010年
- 试验研究了不同PEG-6000浓度(0g·L-1、50g·L-1、125g·L-1和200g·L-1)对"湘丰早119"(耐旱)和"爱华5号"(干旱敏感)2个水稻品种的根体积、根粗、最长根长、侧根长、不定根长、根总长度、根数量、根系质膜相对透性和POD活性的影响。结果表明:耐旱水稻品种和敏感水稻品种根部的形态指标除根数量外都受严重干旱(200g·L-1PEG-6000)抑制,敏感品种更为明显;形态指标在各浓度PEG-6000处理下随着处理时间的延长而增大,且这些指标一般在不同浓度PEG处理3～4d后产生明显差异;根系POD活性随处理浓度升高而增大,随处理时间延长,耐旱品种POD活性的上升速度大于敏感品种;根系质膜相对透性随处理浓度升高而增加,随处理时间延长而增大,敏感品种的质膜相对透性高于耐旱品种;耐旱品种的根系较敏感品种更粗、更长,根系茁壮程度优于敏感品种。根数量和根系质膜相对透性不应作为耐旱选择指标。
- 马廷臣余蓉蓉陈荣军曾汉来张端品
- 关键词：PEG-6000模拟干旱胁迫抗旱性水稻根系生理指标
- 山兰稻干旱诱导基因OsMSI7的功能研究
- 干旱是制约水稻生长发育的主要环境条件。增强水稻的耐旱性是水稻育种的长期目标。我们从一个抗多种逆境(特别高抗干旱并与巴西陆稻抗旱能力相当)的海南地方稻"山兰稻"中,通过基因芯片技术,研究了它在干旱逆境条件下的基因表达谱,得...
- 刘跃林陆道张琦李利华陈荣军徐正君
- 文献传递
- 全基因组表达分析不同强度干旱胁迫下常规籼稻根系转录因子表达变化被引量：10
- 2013年
- 水稻转录因子对水稻逆境胁迫有着重要的调节作用。本文通过利用不同浓度PEG胁迫模拟不同强度干旱胁迫,通过基因芯片研究不同耐旱性水稻根系转录因子家族和转录因子变化,结果表明:干旱敏感品种转录因子分析显示,共有43个转录因子家族的296个转录因子表达活性在至少一个干旱胁迫处理下发生了变化,在3个不同强度干旱处理之间都表达的23个转录因子家族中重叠转录因子共有20个;耐旱品种转录因子分析表明,29个转录因子家族的243个转录因子表达活性在至少一个干旱胁迫处理下发生了变化,在3个不同强度干旱处理之间都表达的24个转录因子家族中重叠转录因子共有36个;在干旱胁迫下不同耐旱性品种间表达的转录因子有较强的品种特异性,同一品种不同强度干旱处理下,在每个干旱处理下转录因子表达有较强的处理特异性;耐旱品种和敏感品种在3个干旱处理强度下,有18个转录家族的26个转录因子表达发生变化,其中上调的有14个转录因子,下调的有12个转录因子。
- 马廷臣余蓉蓉陈荣军曾汉来张端品
- 关键词：基因芯片转录因子水稻根系
- 水稻低温诱导基因OsMSI3功能研究
- 低温是主要的逆境之一,能引起植物细胞膜脂相变、体内酶的活性降低和光合速率下降,从而影响植物的生长、产量和品质。我国是水稻生产大国,近年来西南地区与南方大部分地区屡屡遭受"倒春寒"等低温袭击,使得水稻生产损失严重。因此,如...
- 李利华徐永菊黄静陈荣军徐正君
- 文献传递
- 一个新的水稻逆境响应基因OsMsr1的表达与克隆被引量：18
- 2008年
- 为深入了解植物的逆境反应机理和发现新的水稻耐逆基因,采用Affymetrix水稻表达芯片(含51279个转录本)分析了超级稻两优培九母本培矮64S不同生长发育时期、不同组织器官全基因组在低温、干旱、高温逆境胁迫下的表达水平,筛选出众多表达水平显著升高与降低的基因。OsMsr1(Oryza sativa L.multiple stresses responsive gene 1,Gen Bank登录号为EU284112)是其中一个受高温、低温与干旱诱导、在各生长发育时期与组织器官均显著上调的基因,用实时定量PCR方法对其表达水平进行了进一步的分析,所得结果与基因芯片结果基本吻合,因此,此基因为一多逆境响应基因。用RT-PCR方法扩增获得了包含其完整ORF(open reading frame)的cDNA克隆。根据其ORF序列进行预测,此基因编码一个包含89个氨基酸残基的小分子蛋白,分子量约为10kD,pI约为5。搜索有关数据库,在水稻、玉米、小麦与拟南芥中找到有高相似性的基因,但功能未知,也未发现相同与类似的已知功能的基因保守结构域。对其可能的启动子序列分析,发现5个与逆境反应有关的顺式作用元件。因此,我们认为该基因为一新的水稻耐逆候选基因,进一步的研究正在进行。
- 徐孟亮陈荣军ROCHA Pedro李落叶王曼玲徐国云夏新界
- 关键词：水稻逆境基因芯片实时定量PCR基因克隆
- 在PEG模拟干旱下水稻根系几个疑似PEG毒害响应转录本研究被引量：3
- 2010年
- 通过差别显示的方法,利用Affymetrix水稻60K芯片研究2个不同耐旱性的水稻品种(湘丰早119和爱华5号)根系对PEG毒害响应的转录本表达变化,结果表明:共发现了17个疑似对PEG毒害响应的转录本,它们均表现为下调表达,且大部分功能是假设的或未知的;其中5个功能假设为水解酶相关的转录本表达活性被PEG抑制;3个功能假设为编码蛋白酶的转录本表达活性被PEG抑制。
- 马廷臣陈荣军余蓉蓉曾汉来张端品
- 关键词：水稻根系
- 宫内发育迟缓对仔猪小肠基因表达的影响(摘要)(英文)
- 2009年
- [目的]比较宫内发育迟缓(IUGR)仔猪与正常初生重(NBW)仔猪粘膜中基因表达的差异,探讨其与生长性能的关系。[方法]根据仔猪体重,于同一批21日龄的哺乳三元仔猪(杜×长×大)中随机选取8头,包括4头体重为(1503±310)g的NBW仔猪和4头体重为(806±35)g的IUGR仔猪。宰杀,取小肠,基因芯片筛选差异基因,然后通过RT-PCR从基因水平验证。[结果]与NBW仔猪相比,IUGR仔猪小肠粘膜中有156个基因表达发生改变,其中61个基因表达下调,95个基因表达上调。上调的基因包括蛋白质酪氨酸磷酸酯酶、肌球蛋白、肌钙蛋白、热应激蛋白、金属硫蛋白、精氨酸升压素诱导因子1、核糖体蛋白L6、抗凋亡转录因子、肌酸激酶、甘露糖苷酶、溶菌酶、雌酮、尿酸转运通道蛋白、吡咯啉-5-羧酸还原酶及腺嘌呤磷核基转移酶等基因。下调的基因包括蛋白激酶、花生四烯酸盐12脂氧合酶、转录因子A、GTP-GDP促解离因子1、丝氨酸或(半胱氨酸)蛋白酶抑制因子、胎球蛋白、多帖醇磷酸甘露糖合成酶、载脂蛋白H、精氨基琥珀酸合成酶、铁调节转运体、α-2-巨球蛋白、免疫球蛋白超家族、巯基转移酶及鸟苷酸转移蛋白2等基因。[结论]宫内发育迟缓导致仔猪小肠中基因的表达发生了改变,这为早期干预生长发育落后提供了理论依据。
- 陈荣军高运苓孔祥峰潘杰李铁军印遇龙
- 关键词：宫内发育迟缓仔猪基因芯片实时定量RT-PCR
- PEG-6000模拟干旱对水稻苗期根系形态和部分生理指标影响的研究被引量：36
- 2010年
- 随着全球气候变化,干旱对农作物的产量的影响越来越大,植物地上部分对干旱逆境的响应的研究较多,地下根系在干旱逆境时的变化研究较少,笔者研究了不同PEG浓度处理对2个不同抗逆性的水稻品种根体积、根粗、最长根长3个形态指标和SOD活性、MDA含量、Pro含量、根系活力4个生理指标的影响。结果如下:耐旱品种和敏感品种根部的形态指标都受严重干旱(T3处理)抑制,敏感品种更为明显;形态指标在T0、T1、T2、T3处理下随着处理时间的增加而增大,不同浓度处理之间一般处理3～4天后才会产生明显差异;CAT活性和SOD活性随处理浓度增加而增大,随处理时间延长,抗旱品种SOD的活性增加的速度快于敏感的品种,下降的速度慢于敏感品种;MDA含量和Pro含量随着处理浓度升高而增加,随处理时间增加而增大,敏感品种高于耐旱品种,作为抗旱选择指标并不合适,作为胁迫敏感指标更合适;根系活力随处理时间增加而增大,其最适的处理浓度为T1;相关分析表明根系活力与形态指标正相关极显著,根粗、CAT活性和SOD活性与MDA含量和Pro含量负相关显著或极显著,MDA含量和Pro为极显著的正相关关系,CAT活性和SOD活性也为极显著的正相关关系。
- 马廷臣余蓉蓉陈荣军曾汉来张端品
- 关键词：PEG-6000水稻根系形态生理指标
