李萌
- 作品数：33 被引量：115H指数：8
- 供职机构：中南林业科技大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中南林业科技大学青年科学基金中国博士后科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学医药卫生化学工程更多>>
- 银杏MADS-box基因家族的表达及系统发育分析被引量：11
- 2018年
- MADS-box基因是真核生物中一类编码转录调控因子的基因家族,在植物花器官发育中发挥重要的调控作用。为了探究MADS-box家族基因在银杏花发育中的功能,本文对银杏花芽分化4个时期的样品进行转录组测序,筛选其中的MADS-box家族基因,利用生物信息学方法对筛选到的基因进行表达模式、蛋白结构、细胞定位和系统进化分析。结果显示:共得到15个银杏MADS-box家族基因。表达分析表明,目标基因根据表达模式可以分为3种类型。分析目标基因的编码序列显示,15个银杏MADS-box蛋白的主要构件均为α-螺旋和无规则卷曲;亚细胞定位预测主要在细胞核内;所有表达产物均包含MADS结构域。聚类分析显示,银杏MADSbox基因家族可分为6个亚类。银杏MADS-box基因家族中的new Gb2734、Gb38883、Gb28587和Gb33168可能在银杏开花调控中发挥重要作用;Gb16301可能是银杏花器官的发育过程中的关键基因。
- 董金金刘伟李萌王俊燚何崇单蔡雨蒙王启业王义强
- 关键词：银杏花器官发育
- 珙桐种子败育相关基因CesA的克隆及表达分析被引量：9
- 2016年
- 严重的种子败育是影响珙桐自然繁殖的重要原因之一,调控种子败育的分子机制及关键基因目前尚不清楚。根据本研究小组前期获得的珙桐种子转录组数据,筛选到22个转录本,分属14个纤维素合酶Ces A编码基因,所有转录本在败育种子中均呈现上调表达趋势。分析珙桐种子中的纤维素含量发现,正常种子在发育过程中纤维素含量持续升高,而在败育种子中纤维素含量显著高于正常种子。挑选4个在败育种子中显著上调的Ces A基因进行q PCR分析,结果表明它们表达模式相似,在败育种子中表达量均显著高于正常种子,且在正常种子发育后期上调表达。挑选其中表达差异最显著的c43681.graph_c0进行克隆获得882 bp片段。经序列比对,其编码产物包含292个氨基酸,与拟南芥纤维素合酶Ces A4同源性最高。分析c43681.graph_c0在珙桐不同组织中的表达量发现,该基因在茎中表达量较低,而在果肉中表达量较高,在败育种子中表达量显著高于其它组织。本研究筛选到的c43681.graph_c0可能是一个在珙桐生殖器官中调控纤维素合成的关键基因。
- 熊亚丽曹福祥刘志明董旭杰李萌
- 关键词：种子败育发育
- 珙桐DiCCoAOMT1基因的克隆及生物信息学分析被引量：3
- 2018年
- 种子休眠期长是导致珙桐自然繁殖力低下的重要原因之一。珙桐内果皮在发育后期快速木质化形成坚硬而致密的结构,可能是决定种子休眠时间的重要因素,而这一过程的调控机制尚不明确。本研究小组前期通过对珙桐内果皮发育的4个时期进行转录组测序,发现CCo AOMT基因家族与内果皮快速木质化关系密切。本研究从转录组中筛选到11个珙桐CCo AOMT基因家族基因,并利用生物信息学方法对筛选到的基因进行表达模式、序列特征、细胞定位和系统进化分析。分析显示,11个珙桐CCo AOMT基因根据表达模式可分为2种类型,筛选其中6个表达差异显著的CCo AOMT基因进一步分析其表达规律,最后确定其中差异表达最显著的Cluster-149.63013序列进行克隆及生物信息学分析。结果表明,该基因开放阅读框全长为744 bp,编码247个氨基酸,其氨基酸序列含有植物甲基化酶所共有的A、B、C基序及CCo AOMT蛋白特有的标志性序列D、E、F、G和H,其氨基酸序列与辣椒的CCo AOMT蛋白同源性最高,将其命名为Di CCo AOMT1。本研究克隆得到的Di CCo AOMT1基因可能是珙桐内果皮木质素快速积累的关键调控基因。
- 吴小波李梅李萌董旭杰彭继庆胥雯曹福祥
- 关键词：木质素种子休眠
- 一种提高银杏外种皮银杏酸有效经济产量的方法
- 本发明提供了一种提高银杏外种皮银杏酸有效经济产量的方法。包括外源激素的配制、喷施时间的确定、喷施组合的选择等技术环节。本方法能显著提高银杏种子外种皮的占比，同时外种皮中银杏酸含量也显著提高。本方法由于提高了银杏外种皮的产...
- 王义强刘伟冯致李萌杨竣茹杨果王惠
- 文献传递
- 银杏SQUAMOSA启动子结合蛋白(SBP)基因家族的鉴定及表达分析被引量：2
- 2019年
- SBP转录因子在植物生长发育、信号转导、胁迫应答等方面起着重要的调控作用,由SBP基因家族基因编码。为探究银杏SBP基因家族的特征及表达模式,采用高通量测序技术对银杏的叶、花芽和胚珠进行转录组测序,鉴定SBP基因家族成员,并进行基因定位、miRNA156靶位点预测、进化关系以及表达模式的分析。本研究共鉴定到15个银杏SBP基因家族成员,该基因家族在染色体上分布较分散,编码产物长度差异较大,其中有5个成员具有miRNA156靶位点。蛋白保守基序分析显示,除GbSBP5、GbSBP12、GbSBP14不具有完整的SBP保守结构域外,其余成员编码蛋白均具有SBP保守结构域(包括2个锌指结构和1个核定位信号)。聚类分析表明,银杏SBP基因家族成员可以分为8个亚组。表达分析显示, SBP基因家族成员在银杏叶、花芽、胚珠中的表达水平存在一定差异,且在叶和花芽的不同发育时期呈现出不同的表达模式。本研究为银杏SBP基因家族的功能分析奠定了基础,并为银杏分子育种提供了一定的理论依据。
- 杨果董金金李萌汪贵斌郁万文杨婷婷刘艳玲唐隆平蒋舜村王义强
- 关键词：银杏转录组测序
- 水势和盐胁迫对拟南芥种子萌发和根部生长的影响被引量：3
- 2019年
- 以拟南芥为试验材料,向培养基中添加不同浓度的NaCl模拟盐胁迫、不同比例的PEG-6000模拟水势胁迫,观察并记录种子萌发率、幼苗根长、幼苗存活率等生理指标,检测幼苗中丙二醛(MDA)含量,研究了盐胁迫和水势胁迫对拟南芥种子萌发及幼苗生长的影响,以期明确盐胁迫程度和水势影响拟南芥植株生理状态的规律,为水势和盐胁迫处理提供依据。结果表明:当NaCl浓度等于及高于150 mmol·L-1时,幼苗平均根长为5.2 mm,显著低于对照组(24.8 mm);幼苗平均存活率为52.1%,显著低于对照组(98.1%)。当水势等于及低于-0.7 MPa时,幼苗无侧根生长,平均存活率为89.2%,显著低于对照组(98.7%),由此可知,NaCl浓度150 mmol·L-1和水势-0.7 MPa是拟南芥胁迫处理的阈值,当NaCl浓度高于150 mmol·L-1,或水势低于-0.7 MPa时,拟南芥种子萌发及幼苗生长被明显抑制。
- 高润昕黄凤珍李萌彭继庆彭继庆曹福祥
- 关键词：拟南芥盐胁迫水势
- 珙桐MYB转录因子DiMYB1基因的克隆及表达分析被引量：11
- 2016年
- 根据珙桐转录组测序结果,筛选到一个与原花青素合成相关的基因,通过克隆该基因片段并进行序列分析确定该基因编码一个珙桐MYB转录因子,将其命名为DiMYB1(GenBank登录号KR996175)。该基因开放阅读框全长为924 bp,编码产物包含307个氨基酸。对其编码产物的基本理化性质、亲水性和疏水性、保守结构域、亚细胞定位等方面进行了生物信息学分析和预测。对DiMYB1基因编码产物的氨基酸序列进行聚类分析表明,其与拟南芥MYB123转录因子的同源性最高。应用qRT-PCR分析该基因的表达模式发现,DiMYB1基因在珙桐紫色幼叶中的表达量最高,其次是雄蕊,在芽、茎、成熟叶片、苞片、果肉和种子中只有微量表达。另外,DiMYB1基因的表达量在珙桐败育种子中显著高于正常种子,且在中期败育种子中表达量达到最高。构建原核表达载体pET-28a(+)-DiMYB1,并在大肠杆菌BL21(DE3)中获得高效表达。本研究通过对DiMYB1基因进行克隆与表达分析,为探索该基因在珙桐逆境胁迫、花青素合成和种子发育过程中的调控功能奠定基础。
- 戴鹏辉任锐曹福祥刘志明李萌
- 关键词：MYB转录因子逆境胁迫
- 生态旅游型乡村的乡土景观植物遗传多样性
- 2023年
- 乡村景观植物是生态旅游型乡村营建中的关键因素,研究乡村景观植物遗传多样性,揭示其群体内遗传变异的丰富度和遗传结构的稳定性,为乡村生态景观营建和生物多样性维护提供重要理论依据,对美丽乡村建设具有重要意义。本文以两个生态旅游型乡村为研究对象,选取了8个乡土景观物种,采集了整体村域的植物样品,对表型性状进行了测量并开展了ISSR-PCR试验:通过表型性状和分子标记遗传多样性检测分析,计算植物表型Shan-non指数和Nei’s基因多样性指数等,揭示乡土景观植物在不同区域的遗传多样性水平。研究结果表明:基于表型性状聚类分析划分出5类枫香、6类福建青冈、4类青冈、16类榉树、7类香椿、10类马兰、5类野菊和6类蓬蘽的品系资源。8个乡土景观植物的表型变异系数为0.23~0.58,Shannon指数为1.51~6.74。8种植物在整体村域、人工区域和自然区域的Nei’s基因多样性指数分别为0.240~0.536、0.244~0.540和0.193~0.367,多态性位点百分率范围为45.00%~100.00%,等位基因数范围为1.45~2.00,有效等位基因数范围为1.30~1.64。讨论分析表明,8个乡土景观植物的表型(Shannon指数)和分子(Nei’s基因多样性指数)遗传多样性水平总体高于多种景观植物的平均水平,遗传变异丰富;部分乡土植物总体遗传多样性高,但自然区域和人工区域的遗传多样性水平有所差异。在乡村景观建设中应关注乡土景观植物群体的遗传多样性水平的变化,采取相应措施提高群体的遗传多态性和基因分布均匀度,维护乡土景观植物遗传多样性水平,保证乡村生态景观的稳定性和长效性。
- 冯致姚志孙全李萌吴秀忠陈大华蒋龙范开放唐建路李锴米小琴于咏王义强
- 银杏多态性EST-SSR分子标记引物及其应用
- 本发明公开了银杏多态性EST‑SSR分子标记引物及其应用，属于分子标记开发技术及其应用领域。本发明从银杏转录组数据中筛选出了EST‑SSR位点，并设计合成了100对引物，以全国141份银杏种质基因组DNA为模板通过有效性...
- 王义强吴春文冯致李萌张双全范开范唐建露姚志王惠孙全周涛
- 基于银杏花芽3个分化时期转录组测序的相关基因筛选与表达分析被引量：10
- 2018年
- 鉴定银杏花芽分化调控的关键基因,揭示银杏花芽分化调控的主要分子机制,为缩短银杏童期和选育银杏早花品种提供理论指导。本研究中采用高通量测序技术对银杏花芽分化3个时期(花芽未分化期、花芽分化始期、花芽分化盛期)的样品进行转录组测序,并分析数字表达谱,筛选开花调控相关基因并进行荧光定量PCR(RT-qPCR)表达验证。转录组测序共产生27.52 Gb原始数据,注释到8大功能数据库(GO、COG、KEGG、KOG、NR、Pfam、Swiss-Prot、egg NOG)上的unigene总数为35 179个。通过GO分类和KEGG Pathway富集性分析,将unigene分别归于55个GO类别和126个代谢途径。差异表达基因分析显示,花芽未分化期较花芽分化始期有2 253个基因上调,2 032个基因下调;花芽分化始期较花芽分化盛期有1 770个基因上调,1 901个基因下调;花芽未分化期较花芽分化盛期有1 865个基因上调,2 042个基因下调。发掘出大量的开花相关的基因涉及5个开花调控途径(光周期途径、春化途径、赤霉素途径、自主途径和年龄途径)。筛选出gene.Gb_17618(GI序列)、gene.Gb_19790(FT/TFL1序列)、gene.Gb_16301(AG序列)、gene.Gb_28337(花发育MADS-box序列)、gene.Gb_01884(SOC1序列)和gene.Gb_41704(CO序列)等6个银杏花芽分化差异表达关键基因序列,荧光定量PCR检测表达水平与转录组结果一致。
- 何崇单蔡雨蒙李萌董金金刘伟王俊燚王义强
- 关键词：银杏转录组测序GI
