王自强
- 作品数:28 被引量:149H指数:8
- 供职机构:中日友好临床医学研究所更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学医药卫生自动化与计算机技术机械工程更多>>
- 遗传密码格式的组合编码数分析
- 2002年
- 用N个密码子对m个编码对象进行编码的编码格式是m元N维空间中的一个顶点。64个密码子对20种氨基酸和终止密码子进行编码格式的组合编码数是一个十分巨大的数字。对多元高维编码空间的拓扑特性进行了分析和研究 ,并由此推导出m -N空间的特性三角的排列方式以及给出特性三角公式的数学证明。指出 ,目前的遗传密码的编码格式是21元64维编码空间的一个顶点。应用组合数学分析的方法 ,计算了遗传密码格式的最大组合编码数CM =4.19×1084 ,基因组遗传密码的组合编码数CG =1.13×1080 以及线粒体遗传密码的组合编码数CT =1.38×1079 等。分析结果表明 ,遗传密码的指定是一个小概率事件 。
- 陈惟昌陈志义陈志华王自强
- DNA序列的高维空间数字编码与遗传密码简并法则
- 本文按分子量大小排列对DNA序列碱基进行高维空间数字编码:C(00),T(01),A(10),G(11)。二进制数字编码可以对碱基的化学性质进行编码,如嘌呤与嘧啶,氨基与酮基,强氢键与弱氢键以及碱基的互补关系等。DNA序...
- 陈惟昌陈志华王自强
- 文献传递
- 遗传密码和DNA序列的高维空间数字编码被引量:23
- 2000年
- 二进制数字化编码是信息科学最基本的编码方式。用0(00)、1(01)、2(10)和3(11)4个数码对4种碱基(C、T、A、G)进行二进制数字编码 ,共有24种可能的编码组合 ,其中8种满足碱基互补法则 ,它们是拓扑等价的。按碱基分子量大小排列的编码格式 :0123/CTAG是最理想的编码格式。用二进制数对DNA的字符序列进行编码 ,有以下优点 :1)压缩信息冗余度 ,提高编码效率 ;2)可以对碱基的结构、功能基团、碱基互补、氢键强弱等性质进行编码 ;3)DNA序列的数字编码具有严格的大小顺序 ,即具有全序性质 ;4)DNA数字编码的对称性程度 ,与遗传密码简并度的对称性一致 ,并可得出氨基酸遗传密码的高维空间连通性简并法则 ;5)可以方便求出任意碱基重复单元的重复系列的数字编码法则 ;6)根据高维空间汉明编码距离的定义 ,可以确定任意多个DNA序列之间的信息距离和它们的交空间和并空间 ,对DNA序列生物信息学的分析研究有重要意义 ;7)DNA序列的数字编码可以方便进行各种数学运算和逻辑运算 ,对促进DNA生物计算机的发展 ,可有重大推动作用。
- 陈惟昌陈志华陈志义王自强邱红霞
- 关键词:DNA序列遗传密码高维空间
- 医学显微CT(μ-CT)的原理、进展和应用前景
- 本文对提高医学CT空间分辨率所面临的技术问题,进行了详细的分析与讨论.我们认为:应用微焦点X射线光源,X射线球管高压可调,双能束光锥扫描,虚拟式准直技术,缩小检测器探头尺寸,增加检测器探头的数目,采用集成光刻钨酸镉阵列C...
- 陈惟昌王自强
- 关键词:诊断金标准CCD空间分辨率
- 文献传递
- 双能光子吸收法提高CT衬度(密度)分辨率的研究被引量:2
- 2002年
- 目的提高CT衬度的分辨率。30年来,医学CT经历了原始的第一代CT发展至目前第5代高分辨率CT和高速电子束CT,其成像的空间分辨率和时间分辨率均有明显提高。但CT成像的衬度(密度)分辨率提高并不显著,而衬度分辨率与图像的灰度等级(灰阶)密切相关,是图像清晰度的重要参数。本文对应用双能量光子扫描吸收法以提高CT衬度(密度)分辨率的原理进行分析,并探讨其实际应用的可行性。
- 陈惟昌陈志华赵天德王自强
- 关键词:CT成像分辨率
- 可视化人体的整体坐标系统被引量:3
- 2004年
- 可视人数据集是人体解剖结构的基础信息数据集。为了确定人体结构在三维空间中的准确定位以及在不同个体之间便于比较,文中提出和建立了可视化人体的整体坐标系统。以通过耻骨联合上缘中点的水平横切面为标准原点平面,将人体分为上、下部:上部包括头,颈、胸、腹、上臂、前臂等重要部位;下部包括骨盆、下肢和手。人体的整体坐标系可以确定人体重要结构的每一个体元的空间绝对坐标及相对坐标,在图像的分割、匹配、重建中起重要作用。通过坐标系统的变换,人体整体坐标系统可以方便地应用于临床的定位定量诊断,手术导航,放射定位治疗以及人体运动功能等领域的研究。
- 陈惟昌陈志华赵天德王自强
- 关键词:图像分割耻骨联合体元
- 遗传密码的高维空间对称性被引量:4
- 2001年
- 对称性是由均衡比例产生的匀称美。对称性和对称破缺在自然界和生命现象中普遍存在。20种氨基酸和终止码共有64个遗传密码子 ,组成一个6维的编码空间。遗传密码空间以对称轴将空间分成对称的两大部分 :嘌呤空间和嘧啶空间。遗传密码子的简并以对称轴为参考轴 ,呈平行排列。高简并度氨基酸 (6 ,4,3 ,简并度 )和低简并度氨基酸 (1 ,2简并度 )的简并子空间近似呈周期性的双交错方式排列。遗传密码的简并与4种核苷酸的二进制数字编码 ,具有密切的关系。经过分析 ,可得出遗传密码的连通性λλ简并法则 :“除丝氨酸的密码子分成两个与对称轴平行的 ,分离的子空间之外 ,其余氨基酸和终止密码的密码子 ,都通过与空间对称轴平行的λλ平面或λ边简并 ,组成独立的 ,单一的连通子空间。”并对氨基酸密码子的惯用率与编码空间的对称关系 ,以及数字生物学的意义进行了分析和讨论。
- 陈惟昌陈志华邱红霞王自强
- 关键词:对称性遗传密码密码子
- 脑科学进展的跨世纪回顾与展望被引量:16
- 2000年
- 2 0世纪脑科学取得十分辉煌的成就。当此世纪之交 ,回顾 2 0世纪百年来脑科学的重大进展以及展望 2 1世纪脑科学的发展趋势 ,有重要意义。 2 0世纪脑科学的进展可概括为三大里程碑 :( 1)神经元学说 ;( 2 )离子通道理论 ;( 3)脑功能成像。 2 1世纪脑科学将取得更大的飞跃。预期在 2 1世纪除继续发展 2 0世纪已有的成就之外 ,将可望在以下 5个方面取得突破性进展 :( 1)神经元功能成像 ;( 2 )神经系统多基因病定位及老年性痴呆发病机理的阐明 ;( 3)神经系统信息编码的研究 ;( 4 )后基因组时代分子神经生物学 ;( 5)意识、思维与情绪本质的进一步探讨。本文首次提出启动人类神经组计划 (HumanNeuromeProject,HuNP)研究和建立神经数据库 (NeuroBank)的建议 ,并提出其系统构建和具体实施的方案。人类神经组计划将是继人类基因组计划之后的又一伟大的生物学系统工程 ,它的开展对破译人脑思维起源之谜 ,有重大意义。
- 陈惟昌邱红霞王自强
- 关键词:脑科学
- DNA计算机的研究和展望被引量:7
- 2001年
- DNA计算机是计算机科学和分子生物学互相结合、互相渗透而产生的新兴交叉研究领域 .目前已取得较大进展 .DNA计算机是以编码的DNA序列为运算对象 ,通过分子生物学的运算操作以解决复杂的数学难题 .DNA计算机的重要特点是信息容量的巨量性和密集性 ,和处理操作的高度并行性 ,通过强力搜索策略迅速得出正确的答案 ,从而使其运算速度大大超过常规计算机的计算速度 .介绍了DNA计算机的近期进展和工作原理及其分子生物学的运算操作过程 .并对DNA计算机的未来发展前景及在生物信息学中的意义 ,进行了分析和讨论 .
- 陈惟昌陈志华邱红霞王自强
- 关键词:DNA计算机NP完全问题并行处理
- 大鼠大脑皮质与纹状体显微拉曼光谱的研究被引量:3
- 2001年
- 用Spex -1428显微激光拉曼光谱仪测定正常大鼠大脑皮质和纹状体的激光拉曼光谱的变化 ,发现正常大鼠大脑皮质和纹状体的激光拉曼光谱在模式上大同小异 ,包含有十分丰富的生物大分子结构信息。结果如下 :(1)在大脑皮质和纹状体同时出现且性状亦相似的有以下一些特征峰 :808cm-1 的特征峰 ,对应于A型DNA的特征峰 ;832cm-1 和836cm-1 对应于酪氨酸(Tyr)环的振动峰 ;1020cm-1 和1046cm-1 相当于蛋白质中氨基酸内的C -N伸缩振动峰 ;1330cm-1相当于腺嘌呤环的C=C和C -N伸缩振动峰 ;1544cm-1 相当于酰胺Ⅱ的N -H平面内弯曲振动和C -N伸缩振动峰 ;1684cm-1 对应蛋白质二级结构中的转角 (turn)结构。(2)大脑皮质较纹状体明显的特征峰 :1092cm-1 为DNA骨架的对称振动峰 ;1350cm-1 的色氨酸峰 ;1690cm-1 为尿嘧啶的C=O振动峰。(3)纹状体较大脑皮质明显的特征峰 :1450 -1463cm -1为蛋白质CH2 弯曲振动的特征峰带 ,纹状体在此区段内有1454cm-1 峰 ,而大脑皮质在此区域比较低平 ;1490cm-1为鸟嘌呤的特征峰。结果显示 :显微拉曼光谱揭示的大脑皮质和纹状体的生物大分子的结构成分信息十分丰富 ,既有共性也有差异 ,显微拉曼光谱是一种十分灵敏的研究手段。
- 邱红霞陈惟昌王自强刘玉龙朱恪张昊
- 关键词:显微拉曼光谱生物大分子大脑皮质纹状体