崔喜燕
- 作品数:1 被引量:5H指数:1
- 供职机构:吉林农业大学生命科学学院生物反应器与药物开发重点实验室更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 红花(Carthamus tinctorius L.)不同开花时期的转录组测序及黄酮合成相关基因的验证被引量:5
- 2015年
- 应用454测序技术对红花(Carthamus tinctorius L.)初花期和盛花期两个样本进行转录组测序,分别获得了577 664和562 930条Clean reads片段,其平均长度分别为427 bp和436 bp。差异表达分析结果发现,在初花期获得40 139个基因,盛花期获得39 768个基因,在两个时期同时表达的基因有28 316个。COG/KOG分析中,获得了大量与代谢相关的功能注释信息,注释到比例最高的为功能预测,占24.681%。KEGG Pathway富集分析中,找到红花黄酮化合物合成途径中的关键酶基因,利用Real-time PCR方法验证了三个基因的正确性。表达量分析表明,查尔酮合酶在两个红花品种中各个开花时期的相对表达量最高。
- 刘秀明张宇姚娜崔喜燕王立勇董园园王南李晓薇李海燕李校堃
- 关键词:红花转录组测序