冯世鹏
- 作品数：17 被引量：19H指数：3
- 供职机构：海南大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金海南省教育厅项目海南省自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学文化科学医药卫生更多>>
- Perl语言整合5款软件进行真菌效应蛋白预测
- 2015年
- 目的:效应蛋白在真菌与植物互作过程中发挥了重要的作用,它由真菌分泌进入植物体内引起植物细胞结构和功能改变,使植物表现出抗性抑制病菌侵染或者加速病菌侵染表现为感病。效应蛋白的预测目前尚无公认的方法,我们拟建立真菌效应蛋白预测流程,供研究人员参考。方法:根据真菌效应蛋白无典型结构及属于胞外分泌蛋白的特点,利用Perl语言整合5款软件(Signal P、Prot Comp、TMHMM、Target P、Wo LF PSORT),设计2种真菌效应蛋白预测方法。结果:对香蕉枯萎病菌蛋白质组进行测试,发现348个潜在效应蛋白,该结果与其他文献报道的结果一致。结论:建立了2种真菌效应蛋白预测流程,可供研究者选用。
- 冯世鹏
- 关键词：真菌PERL语言
- 橡胶树miRNA探查被引量：1
- 2016年
- 橡胶是一种重要的工业原料,橡胶树的种植是热带地区尤其是海南省重要的农业产业之一。miRNA在生物的生长发育及抵御病虫害方面发挥了重要作用,而已公布橡胶树的miRNA仅有32种。通过胶乳miRNA测序的方法对橡胶树miRNA进行系统的探查,共发现已知miRNA 170种,预测新的miRNA 250种,对这些miRNA靶基因进行预测及GO功能富集分析发现,其GO条目主要集中在碳水化合物的合成代谢方面,这提示我们miRNA在胶乳的合成代谢过程中发挥了一定的作用。实验结果将为后续miRNA的进一步研究应用奠定基础。
- 冯世鹏
- 关键词：橡胶树胶乳MIRNA
- 一种微小RNA分子及其应用
- 本发明公开了一种微小RNA分子及其应用。miRNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，miRNA分子的前体的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示，miRNA分子的初级前体的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所...
- 冯世鹏郑运天刘欢周霞李慧萍牛晓磊
- 文献传递
- 8种模式生物的miRNA比较分析被引量：2
- 2016年
- 目的:分析物种间miRNA序列的共同点和差异点,为后续miRNA研究奠定基础。方法:从miRBase数据库下载8种模式生物,即智人、小鼠、大鼠、果蝇、线虫、拟南芥、水稻、玉米的全部miRNA,通过生物信息学相关软件及方法对其进行分析。结果:各物种成熟miRNA序列长度均约为22 nt,植物miRNA长度分布范围较动物更集中;而pre-miRNA则相反,植物pre-miRNA的长度变异远大于动物;各物种miRNA序列第一个碱基倾向于U,而其他位点的碱基在不同物种间变异较大;miRNA的保守性有一定的范围,不存在在所有物种中均保守的miRNA。结论:找到了miRNA间的一些共同点及差异点,可为后续miRNA鉴定注释提供借鉴。
- 冯世鹏刘梦佳
- 关键词：MIRNAPRE-MIRNA保守性GC含量
- 木薯SWEET1基因的分子克隆、亚细胞定位与功能分析被引量：4
- 2017年
- SWEET基因家族为新发现的一类糖转运蛋白家族,具有转运蔗糖及单糖的功能,在真核生物中广泛存在,其特点为具有1~2个MtN3_slv结构域及7个跨膜结构域,对植物生长发育、生理代谢及植物-病原菌互作等方面具有重要的调控作用。为了探索热带作物木薯中SWEET基因的功能,本研究采用RT-PCR技术,从木薯Ku50成熟叶片中克隆得到MeSWEET1基因的编码序列,并对其进行了生物信息学预测分析和功能初步研究。本研究结果表明:MeSWEET1蛋白含有植物SWEET家族两个保守的MtN3_Slv功能域,还具有7个跨膜结构域。系统进化树分析显示,MeSWEET1与拟南芥AtSWEET1、水稻OsSWEET1a和OsSWEET1b亲缘关系最近,属于SWEET蛋白家族进化树的Clade I分枝class II小家族。亚细胞定位结果表明,MeSWEET1蛋白定位于细胞膜上。组织特异性表达分析揭示,MeSWEET1在木薯成熟叶片中相对表达量最高,而在新叶和果实中相对表达量最低。本研究的结果将为进一步研究木薯MeSWEET1基因在糖转运及与病原互作等方面的功能奠定了初步的理论基础。
- 刘秦马畅冯世鹏唐枝娟陈银华罗丽娟牛晓磊
- 关键词：木薯亚细胞定位
- miRNA命名及注释研究进展
- 2016年
- miRNA是目前生物学研究的热点领域之一,随着越来越多的miRNA被发现,miRNA的命名及注释鉴定标准经历了一系列变化。对miRNA的命名及注释鉴定标准进行了总结,以期为后续的miRNA命名及注释鉴定提供借鉴。
- 冯世鹏刘梦佳
- 关键词：MIRNA注释
- 一种水稻黄单胞菌的环介导等温扩增检测引物组、检测方法和检测试剂盒
- 本发明公开了一种水稻黄单胞菌的环介导等温扩增检测引物组、检测方法和检测试剂盒。本发明基于水稻黄单胞菌基因组特异性分子标记特征，通过比较基因组学方法，获得了水稻黄单胞菌保守的、特异性的DNA片段xcp，采用环介导等温扩增技...
- 陶均陈银华何朝族郑琳琳李春霞牛晓磊冯世鹏
- 一种微小RNA分子及其应用
- 本发明公开了一种微小RNA分子及其应用。miRNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，miRNA分子的前体的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示，miRNA分子的初级前体的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所...
- 冯世鹏郑运天刘欢周霞李慧萍牛晓磊
- 一种水稻黄单胞菌的环介导等温扩增检测引物组、检测方法和检测试剂盒
- 本发明公开了一种水稻黄单胞菌的环介导等温扩增检测引物组、检测方法和检测试剂盒。本发明基于水稻黄单胞菌基因组特异性分子标记特征，通过比较基因组学方法，获得了水稻黄单胞菌保守的、特异性的DNA片段xcp，采用环介导等温扩增技...
- 陶均陈银华何朝族郑琳琳李春霞牛晓磊冯世鹏
- 文献传递
- “分子生物学”实验课程教学改革探索——以问题为导向的学生分析解决问题能力提升被引量：1
- 2022年
- 分子生物学相关知识与实验技术是生物类相关专业学生应该掌握的基本知识及技术,在学生今后的学习或工作中占据极其重要的地位。通过探讨分子生物学实验课程教学过程及教学评价方式,以学生动手实验过程中遇到的问题为导向进行改革探索,从而提高学生的实验动手操作能力及分析和解决实验中问题能力,并改革实验课程的评价方式,为今后高等院校分子生物学实验教学提供参考。
- 牛晓磊冯世鹏蒋凌雁王倩男陈银华
- 关键词：教学改革
