张海晨
- 作品数：4 被引量：12H指数：2
- 供职机构：玉溪师范学院资源环境学院更多>>
- 发文基金：云南省教育厅科学研究基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学医药卫生更多>>
- 三种滇龙胆叶片总RNA提取方法的比较被引量：1
- 2015年
- 分别使用传统异硫氰酸胍法和Takara公司的两种试剂盒来提取滇龙胆幼叶的总RNA,比较所提取RNA质量和纯度.结果表明,三种方法各有优缺点,但MiniBEST Plant RNA Extraction Kit试剂盒提取的RNA质量好、纯度高、提取效率高,且无基因组污染,优于其他两种方法,而异硫氰酸胍法从经济的角度考虑则最为实惠.
- 张海晨张晓东
- 关键词：总RNA异硫氰酸胍法
- 滇龙胆GrG10H基因的克隆与表达分析
- 香叶醇10-羟化酶(Geraniol 10-hydroxylase,G10H)是龙胆苦苷生物合成途径中的关键酶,能够催化香叶醇生成10-羟香叶醇(10-hydroxygeraniol)。以滇龙胆(Gentiana rig...
- 张海晨张晓东
- 关键词：克隆
- 滇龙胆异戊烯基焦磷酸异构酶基因的克隆与表达分析被引量：5
- 2015年
- 根据药用植物滇龙胆转录组异戊烯基焦磷酸异构酶基因(Gr IDI)序列,应用RT-PCR技术从滇龙胆幼叶克隆该基因开放阅读框(ORF),获得Gr IDI1和Gr IDI2两条序列,其Gen Bank登录号分别为KM879183和KM879184。生物信息学分析表明Gr IDI1基因ORF长708 bp,编码235氨基酸;Gr IDI1蛋白相对分子质量为27.10 ku,理论p I为5.01。该蛋白属于I型异戊烯基焦磷酸异构酶家族成员,可能定位于细胞质。该蛋白无信号肽,为亲水稳定蛋白,主要由α-螺旋(45.53%)和无规则卷曲(39.57%)构成。该蛋白具有其他IDI蛋白的活性位点、金属结合位点和保守结构域(NUDIX羟化酶结构域)。Gr IDI1蛋白与黄龙胆Gl IDI蛋白亲缘关系最近。原核表达结果表明,Gr IDI1基因在大肠杆菌中表达的重组蛋白相对分子质量约为53.11ku,与预期大小一致。组织特异性表达分析结果表明Gr IDI1基因主要在叶中表达。
- 张玲李彩霞张海晨马娜杨娇张晓东
- 关键词：基因克隆生物信息学分析
- 滇龙胆1-脱氧-D-木酮糖5-磷酸合酶基因的克隆与表达分析被引量：7
- 2016年
- 旨在克隆滇龙胆1-脱氧-D-木酮糖5-磷酸合酶基因GrDXS,并进行表达分析。以滇龙胆转录组为基础,采用RTPCR技术从滇龙胆幼叶克隆GrDXS基因,并进行原核表达和组织特异性表达分析。滇龙胆GrDXS基因(登录号:KJ624995)全长2145bp,编码714个氨基酸;GrDXS蛋白相对分子质量76.75kD,pI为6.93;属于DXS家族成员,可能定位于叶绿体;主要由α-螺旋和无规则卷曲构成;具有DXS蛋白的4类保守结构域:焦磷酸硫胺素结合折叠域(IPR029061,69-425、366-555、87-268、315-407、407-558)、类转酮酶嘧啶结合结构域(IPR005475,394-559、394-555)、转酮酶C端/丙酮酸铁氧还蛋白氧化还原酶结构域II(IPR009014,568-704,572-704)、转酮酶C端结构域(IPR005476,573-696)和1个转酮酶结合位点(IPR020826,500-516);与长春花CrDXS蛋白亲缘关系最近;GrDXS基因在大肠杆菌中表达的重组蛋白相对分子质量约为100kD,与预期蛋白大小一致;GrDXS基因主要在叶中表达。
- 张海晨李彩霞王元忠张晓东
- 关键词：生物信息学
