徐珍珍
- 作品数：45 被引量：52H指数：4
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- 相关领域：农业科学生物学医药卫生轻工技术与工程更多>>
- 亚洲棉EST-SNP的挖掘及其在陆地棉中的验证
- 2017年
- 【目的】随着不同棉种序列数据库的逐步完善以及高通量测序技术的发展,棉花单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)标记开发可利用的公共数据资源逐步增加。【方法】本研究基于陆地棉祖先基因组的现代种亚洲棉表达序列标签(Expressed sequence tag,EST)数据库,利用CAP3对亚洲棉EST数据库进行拼接。拼接获得7 187个重叠群(Contig),再利用Quality SNP软件进行SNP位点分析。【结果】在807条含有4条以上EST序列的Contig中查找到2 690个SNP位点。通过筛选次要等位基因频率大于30%的位点,获得953个可靠度较高的候选SNP,通过电子筛选,最终获得可用于陆地棉分析的SNP 149个,利用位点特异性聚合酶链式反应以及酶切扩增多态序列验证了EST-SNP的准确性。【结论】本研究证实基于亚洲棉EST数据库挖掘用于陆地棉研究的EST-SNP切实可行,并有望将EST-SNP用于陆地棉遗传图谱构建、重要性状的基因定位以及分子标记辅助育种。
- 徐鹏蔡继鸿郭琪张香桂徐珍珍沈新莲
- 关键词：亚洲棉单核苷酸多态性表达序列标签
- 与棉花纤维强度和马克隆值相关的SSR分子标记及应用
- 本发明公开了与棉花纤维强度和马克隆值相关的SSR分子标记及应用。本发明提供了一个来自于异常棉的染色体片段，为位于异常棉11号染色体上至少含有自SSR分子标记NAU2152起至SSR分子标记JAAS4769止的片段；所述S...
- 孟珊沈新莲徐珍珍郭琪徐鹏张香桂
- 文献传递
- 江苏省现有生产条件下棉花良种繁育技术探讨
- 2015年
- 随着棉花生产管理体制的改变,棉花良种繁育工作出现了新品种选育速度快,生产用种更换频繁,育种者直接参与棉花良种生产等特点。费工费时的"三圃制"专业化棉花种子生产体系已不适应当前生产的需要。基于上述条件,本研究提出,用育种者的种子直接种植,选典型单株混收生产原种;原种去杂去劣生产良种直接用于生产的良种生产程序,简便高效。
- 张香桂沈新莲倪万潮徐鹏郭琪徐珍珍
- 关键词：棉花原种良种
- 陆地棉-异常棉异附加系抗旱耐盐性评价及关键生理生化指标测定被引量：3
- 2022年
- 【目的】筛选具有抗旱或耐盐潜力的陆地棉-异常棉异附加系,并明确体现其抗旱耐盐性的关键生理生化指标,旨在为棉花抗旱耐盐育种提供理论与材料基础。【方法】利用异常棉每条染色体特异的简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)标记鉴定陆地棉-异常棉异附加系的基因型;通过表型观察和相关指标测定,筛选出具有抗旱或耐盐潜力的异附加系,并测定其生理生化指标,包括过氧化氢(H_(2)O_(2))、丙二醛(malondialdehyde,MDA)、脯氨酸(proline,PRO)的含量、SPAD(soil and plant analyzer development)值及过氧化物酶(peroxidase,POD)、过氧化氢酶(catalase,CAT)和超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)的活性。【结果】陆地棉-异常棉异附加系的传递率为34.66%~51.50%;MAAL_1B、MAAL_5B、MAAL_7B、MAAL_8B、MAAL_11B和MAAL_12B具有抗旱潜力,MAAL_4B、MAAL_6B、MAAL_8B、MAAL_9B和MAAL_10B具有耐盐潜力。干旱或盐胁迫下轮回亲本陆地棉苏棉8289和具有抗旱或耐盐潜力的异附加系叶片中的MDA、H_(2)O_(2)和PRO的含量与干旱前或清水对照相比均有不同程度地增加,且轮回亲本的MDA和H_(2)O_(2)含量更高。干旱处理后10 d,与轮回亲本相比,MAAL_1B中CAT和SOD的活性、MAAL_5B中CAT和SOD的活性及PRO含量、MAAL_7B中SOD的活性、MAAL_8B中POD、CAT和SOD的活性及SPAD值、MAAL_11B中POD和CAT的活性以及MAAL_12B中CAT活性及SPAD值显著或极显著提高;350 mmol·L^(-1) NaCl处理后3 d,与轮回亲本相比,MAAL_6B中POD和SOD的活性及SPAD值、MAAL_8B中CAT活性、MAAL_9B中POD和SOD的活性以及MAAL_10B中SOD活性和SPAD值均显著或极显著提高。【结论】部分陆地棉-异常棉异附加系具有抗旱或耐盐潜力,且可能通过不同的生理生化过程应答干旱或高盐胁迫。
- 上官艺馨曹静季为陈祥龙徐鹏郭琪沈新莲徐珍珍
- 关键词：陆地棉异常棉异附加系耐盐性生理生化指标
- 棉花YABBY基因家族的全基因组分析被引量：14
- 2015年
- YABBY基因家族属于锌指蛋白超家族(Zinc finger super-family)的亚家族,在调控植物叶和花器官发育过程中起着重要的作用。从陆地棉标准系TM-1(Gossypium hirsutum L.acc.TM-1)基因组中鉴定到23个YABBY基因家族成员,具有不同的亚细胞定位;这些基因分布在16条染色体和1条Scaffold上,且有9对共线性基因;棉花的YABBY基因家族分为4个亚组,每个亚组都有与拟南芥同源的基因,且每个亚组成员间具有相似的基序类型和排列顺序;组织表达分析表明,TM-1全基因组中的23个YABBY基因家族成员具有较为广泛的组织表达类型。所有YABBY基因家族成员在花、蕾和茎端分生组织中表达。
- 徐珍珍倪万潮张香桂郭琪徐鹏沈新莲
- 关键词：陆地棉基因组
- 陆地棉GhZIP基因家族全基因组分析被引量：5
- 2015年
- ZIP基因家族是生物体内非常重要的一类金属阳离子转运蛋白基因家族,通过对陆地棉基因组的全面分析和鉴定,获得GhZIP基因家族系统性的生物学信息。运用比较基因组学的方法,从陆地棉异源四倍体标准系TM-1基因组数据库中鉴定出45个GhZIP基因,这些基因分布在除了A04、A09、D04和D09号亚基因组以外的22个亚基因组,D亚组比A亚组多5个GhZIP基因,有16对基因在A亚组和相对的D亚组上存在一一对应关系。有44个GhZIP基因具有跨膜结构,其中有36个GhZIP基因的跨膜结构域是6~9个,具有His富集区序列并位于膜内侧可变区的有20个GhZIP基因,只有1个GhZIP基因亚细胞定位不在细胞质膜。对NCBI中陆地棉的EST数据库做比对统计,有21个GhZIP基因没有可匹配的EST序列,其他24个GhZIP基因在棉花的根、茎、叶、花、胚珠、纤维等组织中广泛表达,其中有18个基因在根和/或茎中表达。研究结果为GhZIP基因的克隆和功能研究提供了理论基础。
- 倪万潮巩元勇徐珍珍郭书巧束红梅蒋璐
- 关键词：棉花
- 异常棉来源的抗旱相关SSR序列及其应用
- 本发明公开了异常棉来源的抗旱相关SSR序列及其应用。本发明提供了特定DNA片段或其相关生物材料在培育抗旱棉花品种或品系或提高棉花抗旱性中的应用；所述特定DNA片段为位于异常棉5号染色体上至少含有自SSR分子标记JAAS6...
- 徐珍珍徐鹏沈新莲郭琪孟珊
- 能引起陆地棉致死的异常棉染色体片段及其分子标记和应用
- 本发明公开了一种能引起陆地棉致死的异常棉染色体片段及其分子标记和应用，所述染色体片段A11‑9来自于异常棉，位于棉花染色体组的第11号染色体，通过6对SSR标记：NAU5192、A11_175、JAAS3191、A11_...
- 徐鹏沈新莲郭琪徐珍珍孟珊
- 文献传递
- 新选育陆地型中长绒棉品系性状分析被引量：1
- 2016年
- 通过远缘杂交将棉属野生种蕾蒙德氏棉、松散棉、异常棉的优异基因转育到栽培品种中,经过多年多目标定向选择,选育出3个陆地型中长绒棉品系,其纤维2.5%跨距长度32.35~34.46mm,比强度32.20~40.25cN/tex,马克隆值3.85~4.28,且各品系的长度、比强度、马克隆值三者之间均协调较好,适纺高织纱。产量表现虽不及丰产陆地棉,但其绝对产量已达1050kg/hm^2以上,若能优质优价,则可直接用于生产。
- 张香桂倪万潮沈新莲徐鹏郭琦徐珍珍
- 关键词：中长绒棉远缘杂交纤维品质
- 能提高棉花纤维强度的异常棉染色体片段及其分子标记
- 本发明公开了能提高棉花纤维强度的异常棉染色体片段及其分子标记。本发明提供了一个来自于异常棉的染色体片段，为位于异常棉1号染色体上自SSR分子标记NAU3615起至SSR分子标记JAAS1148止的片段；所述SSR分子标记...
- 沈新莲徐珍珍陈爱民闻甜徐鹏孟珊郭琪张香桂
